EST文庫(kù)分析

EST文庫(kù),文庫(kù)基因注釋,差異表達(dá)分析,基因功能注釋

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服務(wù)類(lèi)別：	芯片與生物信息學(xué)	總訪問(wèn)：	2795
最后更新：	2010-11-8	半年訪問(wèn)：	4
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公司簡(jiǎn)介

讀取測(cè)序峰圖(Base calling) 通過(guò)分析測(cè)序峰圖文件，讀取DNA堿基序列信息以及各個(gè)堿基的測(cè)序質(zhì)量得分。

EST序列質(zhì)控(Quality control) 屏蔽簡(jiǎn)單重復(fù)序列，載體序列，引物序列，低質(zhì)量測(cè)序部分序列等。

文庫(kù)基因注釋(Gene annotation)將EST文庫(kù)序列通過(guò)合適的blast方法比對(duì)到各個(gè)標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(kù)，從而獲取EST到已知基因的對(duì)應(yīng)關(guān)系。

基因集富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA) 富集分析是基于統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)的case/control高通量分析方法，可用于揭示生物學(xué)樣本（case相對(duì)于control）中被顯著激活或顯著抑制的功能。與翔自主開(kāi)發(fā)研制了不同的功能分析數(shù)據(jù)庫(kù)，可以提供對(duì)GO、KEGG、BioCarta、疾病相關(guān)基因、腫瘤相關(guān)基因、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)等功能的富集分析。

基因功能注釋(Gene function annotation)，通過(guò)KOG/COG數(shù)據(jù)庫(kù)完成EST序列的功能注釋

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