歡迎您參與我們的現(xiàn)場(chǎng)數(shù)據(jù)分析研討會(huì)！這個(gè)活動(dòng)會(huì)面向 10x Genomics 單細(xì)胞和空間的用戶，包括數(shù)據(jù)分析的互動(dòng)。請(qǐng)您攜帶自己的筆記本電腦。

10月10日｜9:30am - 3:00pm
 

• 從原始數(shù)據(jù)預(yù)處理、sample demultiplexing、doublet removal和其他QC、批次校正和數(shù)據(jù)整合、自動(dòng)細(xì)胞注釋，到多樣本差異基因分析。
• 首先我們將了解 10x cellranger 如何處理原始測(cè)序數(shù)據(jù)。
• 在后續(xù)的下游分析中，我們將使用多個(gè)10x和第三方開(kāi)發(fā)的工具/軟件，并熟悉他們的分析算法。
• 經(jīng)過(guò)這些分析步驟后，我們可以找到與 COVID-19 嚴(yán)重程度相關(guān)的細(xì)胞類型特異性基因特征。

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②Visium HD數(shù)據(jù)分析研討會(huì)：識(shí)別腫瘤微環(huán)境中不同的巨噬細(xì)胞亞群
10月11日｜9:30am - 4:20pm
 

 
Visium HD 提供單細(xì)胞scale的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析。本次研討會(huì)將涵蓋多方面對(duì) Visium HD 進(jìn)行深入數(shù)據(jù)分析。

• 首先我們將了解 Space Ranger 如何處理HD圖像和測(cè)序數(shù)據(jù)。
• 而后，我們將了解如何評(píng)估HD數(shù)據(jù)質(zhì)量以及使用Loupe Browser進(jìn)行HD數(shù)據(jù)可視化。
• 我們還將使用第三方工具進(jìn)行以下 HD 分析：

1. 使用 Seurat 進(jìn)行 HD 8μm bin 數(shù)據(jù)進(jìn)行下游分析；
2. HD 8μm bin數(shù)據(jù)與單細(xì)胞數(shù)據(jù)的整合；
3. 對(duì)HD數(shù)據(jù)進(jìn)行H&E圖像細(xì)胞核分割，并將分割得到的細(xì)胞核數(shù)據(jù)與單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行整合。多方面的HD數(shù)據(jù)分析揭示了人類結(jié)腸癌組織不同區(qū)域的不同巨噬細(xì)胞亞群。
 

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