劍橋結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫（CSD）由劍橋晶體數(shù)據(jù)中心（CCDC）維護，是全球最大的小分子晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫，包含近129萬個結(jié)構(gòu)。CSD不僅是數(shù)據(jù)存儲的寶庫，更是開發(fā)新藥、農(nóng)用化學(xué)品和新型功能材料的重要數(shù)據(jù)源。
為了更好地利用這一龐大資源，CCDC提供了一系列先進的軟件工具，包括CSD-CrossMiner、GOLD和Mogul。這些工具結(jié)合了豐富的CSD晶體數(shù)據(jù)，幫助科學(xué)家們更好地理解分子間的相互作用，支持藥物分子的優(yōu)化和新藥的開發(fā)。

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一、藥效團導(dǎo)向的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫探索：CSD-CrossMiner在現(xiàn)代藥物發(fā)現(xiàn)中的創(chuàng)新應(yīng)用

時間：7月18日（周四）下午15:00-16:20

藥效團是藥物分子中與生物靶點發(fā)生特定相互作用的化學(xué)特征，構(gòu)建藥效團模型是計算藥物設(shè)計的一種重要方法。CSD-CrossMiner是一款基于藥效團搜索數(shù)據(jù)庫的創(chuàng)新工具，能夠在CSD和PDB中高效搜索匹配的結(jié)構(gòu)。通過CSD-CrossMiner，研究人員可以交互式地構(gòu)建和修改藥效團特征，識別關(guān)鍵的分子骨架和相互作用模式，從而加速新藥的發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化。

在本次講座中，我們將詳盡介紹CSD-CrossMiner的工作原理和獨特特點，并詳細(xì)解釋各種藥效團特征及其在藥物設(shè)計中的應(yīng)用。

此外，我們將通過實際案例展示CSD-CrossMiner在不同研究場景下的多功能性，特別是在骨架躍遷和反向?qū)ぐ?/span>的應(yīng)用。通過操作演示，您將直觀體驗該軟件的高級功能，學(xué)習(xí)如何有效地構(gòu)建藥效團，優(yōu)化您的分子設(shè)計。

二、揭秘金屬離子與大環(huán)分子：通過GOLD軟件進行精準(zhǔn)對接

時間：7月25日（周四）下午15:00-16:20 

金屬離子和大環(huán)分子在藥物研發(fā)項目中非常常見，但其復(fù)雜的結(jié)構(gòu)和相互作用模式對分子對接提出了更高的要求。GOLD是CCDC開發(fā)的一款專業(yè)軟件，為蛋白質(zhì)-配體對接提供了完整的解決方案。依托于CCDC豐富的晶體數(shù)據(jù)，GOLD在生成分子對接構(gòu)象、處理含金屬離子的體系對接以及模擬有水分子參與的配體-蛋白質(zhì)相互作用等方面展現(xiàn)出顯著優(yōu)勢。通過使用GOLD軟件，研究人員可以精確模擬分子結(jié)合構(gòu)象，探索分子間的相互作用，從而優(yōu)化藥物設(shè)計。

在本次講座中，我們將詳盡介紹GOLD軟件關(guān)鍵功能和參數(shù)設(shè)置，包括蛋白柔性處理、配體構(gòu)象生成、水分子處理、金屬處理等方面。

此外，我們將通過具體案例和軟件實操，重點展示GOLD軟件處理復(fù)雜對接體系的能力，特別是在金屬蛋白對接、有機金屬化合物或大環(huán)化合物與蛋白的對接方面的技術(shù)優(yōu)勢。

三、探索分子結(jié)構(gòu)的奧秘：使用ConQuest和Mogul獲取扭轉(zhuǎn)角分布知識

時間：8月1日（周四）下午15:00-16:20 

分子的三維結(jié)構(gòu)和構(gòu)象是決定其生物活性的重要因素。Mogul和ConQuest是由CCDC提供的兩款專門用于小分子構(gòu)象檢索和分析的強大工具。Mogul能夠迅速評估分子構(gòu)象在實際晶體環(huán)境中的分布情況，而ConQuest則專用于從CSD檢索和提取結(jié)構(gòu)信息，并與Mercury軟件無縫對接，進行參數(shù)統(tǒng)計和圖形展示。這些工具為藥物設(shè)計提供了重要的晶體學(xué)數(shù)據(jù)支持和構(gòu)象分析手段。

在本講座中，我們將詳細(xì)介紹Mogul軟件的核心功能及其實際應(yīng)用，尤其是如何利用Mogul進行分子結(jié)構(gòu)的驗證和構(gòu)象異構(gòu)體的生成。

同時，我們也將詳細(xì)探討如何結(jié)合使用ConQuest和Mercury軟件來獲得特定扭轉(zhuǎn)角度的分布數(shù)據(jù)，并展示如何應(yīng)用這些數(shù)據(jù)在藥物設(shè)計中獲得新的靈感。

別錯過這次機會，加入我們的講座，擴充您的科研工具箱，掌握CCDC軟件的高效應(yīng)用技巧。我們期待與您一起探索CCDC在藥物研發(fā)中的無限可能！