Western Blot(WB)蛋白印跡實驗在蛋白質(zhì)分析中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,然而,對于許多新手研究人員來說,這個過程可能顯得復(fù)雜且難以理解。
為了幫助初學(xué)者快速上手并成功實施WB實驗,我們整理了從樣本制備到蛋白質(zhì)檢測的每一個步驟以及相應(yīng)的注意事項,另有實驗進階、疑難排查等相關(guān)內(nèi)容陸續(xù)上線,敬請關(guān)注!
WB實驗原理
WB實驗的基本核心理念是抗原抗體的特異性反應(yīng),通過變性膠SDS-PAGE將不同分子量的蛋白質(zhì)分離開,然后轉(zhuǎn)移到固相載體PVDF膜上,再用脫脂牛奶作為封閉液進行封閉和一抗稀釋液進行稀釋。
待靶蛋白和抗體充分結(jié)合后,用TBST洗脫液洗脫掉多余未結(jié)合的一抗,加入帶有HRP標(biāo)記的對應(yīng)二抗,這樣,我們的蛋白+一抗+二抗形成一個復(fù)合物,加以化學(xué)發(fā)光液,有靶蛋白的位置就會產(chǎn)生熒光,利用膠片或者化學(xué)發(fā)光成像儀就可以顯現(xiàn)靶蛋白的條帶。
WB實驗步驟及注意事項
01樣本制備
使用機械或化學(xué)方法提取生物樣本中的蛋白質(zhì), 定量總蛋白,樣品與緩沖液混合,然后在凝膠上進行電泳。
注意事項:
1. 蛋白質(zhì)在樣品處理過程應(yīng)在低溫下進行,以避免細(xì)胞 破碎釋放出的各種酶類的修飾(加入合適的蛋白酶抑制劑)。
2. 樣品建議分裝成合適的量(比如分裝出 20μL 檢測蛋白質(zhì)定量用),然后 -20°或 -80℃中長期保存,注意不要反復(fù)凍融,因為會使蛋白的抗原特性發(fā)生改變。
3. 切莫使用不新鮮的上樣緩沖液,同時在處理時應(yīng)注意將樣品與 loading buffer 混合均勻。
02SDS- PAGE電泳
蛋白樣品被裝載到凝膠上,通過電泳將它們按大小分開。
注意事項:
1. 配膠試劑里面的 AP 需要根據(jù)實驗室實際溫度來適量的增加或者減少,比如夏天溫度較高, 自然凝膠速度較快,AP 的量需要適當(dāng)?shù)臏p少;冬天溫度低,凝膠慢,需要適量的增加。
2. 灌膠時掌握好速度,避免氣泡產(chǎn)生(注意濃度越小的膠含水越多,凝固后膠體積縮小越多)。加水液封時速度要很慢,否則膠會被沖變形。
3. 所有的蛋白樣品定量一致,體積一致,不夠的用裂解液補足,樣品兩側(cè)的泳道用等體積 的1×Loading Buffer 上樣,Marker也用1×Loading Buffer調(diào)制與樣品等體積,這樣可以避免出現(xiàn)誤差。
4. 電泳時間和電壓說法各異。一般電泳至溴酚蘭剛跑出即可終止電泳,進行轉(zhuǎn)膜。為減少蛋白質(zhì)條帶的擴散,上樣后應(yīng)盡快進行電泳,電泳結(jié)束后也應(yīng)直接或者轉(zhuǎn)印。
03蛋白轉(zhuǎn)膜
將蛋白從凝膠基質(zhì)移動到合成膜支持物上,并與膜相結(jié)合,形成印跡。
注意事項:
1. 選擇合適的膜和緩沖液是確保蛋白轉(zhuǎn)印成功的關(guān)鍵。必須通盤考慮蛋白質(zhì)的大小和電荷、轉(zhuǎn)印方法和膜的結(jié)合特性。
2. 切濾紙和膜時一定要戴干凈手套,因為手上的蛋白會污染膜。PVDF 膜使用前用無水甲醇中浸泡 1min~2min。
3. 用槍頭或移液管在疊層的濾紙上滾動,除去氣泡。注意每疊一層就要用玻璃棒或圓筒試管趕去氣泡,因為一個氣泡的厚度對于蛋白來說都是十萬八千里的。
4. 用干凈紗布將疊層上面和周圍的多余緩沖液吸干。這一步很重要,寧可太干也不能太濕,太干容易燒胡,太濕的話多余的緩沖液會導(dǎo)致電流短路,大大降低轉(zhuǎn)移效率。
04封閉
對轉(zhuǎn)印后的膜進行封閉,阻斷膜上未結(jié)合位點,以防止與抗體的非特異性結(jié)合。
注意事項:
做磷酸化蛋白的western時使用BSA(牛血清蛋白)作為封閉液。奶粉含有酪蛋白(一種磷酸化蛋白),如果用奶粉,有可能出現(xiàn)背景深的現(xiàn)象。并且脫脂奶粉含磷酸酶,磷酸酶與膜上的磷酸化蛋白接觸可使之去磷酸化,用磷酸化特異性抗體分析磷酸化蛋白時會受到影響。
05抗體孵育
膜首先與一種特異性針對目標(biāo)蛋白上一個抗原表位的初級抗體孵育。經(jīng)過幾次洗滌后,隨后會與一個標(biāo)記的二級抗體孵育,以提供檢測的手段。
注意事項:
1. 為減少非特異結(jié)合,可選用封閉液作為一抗和二抗的抗體稀釋液。
2. 一抗孵育條件推薦 4°C過夜, 二抗孵育條件為室溫,1h。
3. 洗滌液推薦選用 TBST 緩沖液。洗滌時應(yīng)保持適中的搖床速度,避免過快導(dǎo)致膜上的蛋白 或抗體脫落,同時確保洗滌液能夠充分接觸到膜上的每一個角落。在洗滌過程中,適時更換新的洗滌液以確保洗滌效果。
4. 洗滌過程中需要保持膜的濕潤,避免膜干燥導(dǎo)致抗體結(jié)合力下降或蛋白變性。
06發(fā)光顯影
將膜清洗以移除未結(jié)合的抗體后,使用二抗上的標(biāo)簽來可視化感興趣的蛋白?贵w可以標(biāo)記有產(chǎn)生顏色和光的酶,或者直接用熒光標(biāo)記來可視化蛋白。
注意事項:
1. 采用暗室膠片曝光方法,操作需要盡量熟練,除了要把握曝光時間,還要避免位移(壓片、取片過程中膠片和雜交膜不能有移動);保留好膠片,作為原始憑證;
2. 使用化學(xué)發(fā)光成像儀采集圖像,注意采集白光下的圖像,并與發(fā)光的圖像進行融合,作為原始憑證保存。
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