講座背景：

蛋白質(zhì)質(zhì)譜法是指使用質(zhì)譜法對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行研究和表征，包括蛋白質(zhì)的定量、分析、相互作用作圖和翻譯后修飾的鑒定。蛋白質(zhì)質(zhì)譜法也可以稱為基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)�；�于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)包括三種方法：自上而下（top-down，TD）、自中而下（middle-down，MD）和自下而上（bottom-up，BU）的蛋白質(zhì)組學(xué)：

Mascot是一個(gè)基于HTTP網(wǎng)絡(luò)服務(wù)的平臺(tái)，支持用戶從本地或在線提交任意數(shù)量的譜圖進(jìn)行搜庫鑒定和定量分析。其由Server、Distiller與Daemon 組成，其中Server負(fù)責(zé)執(zhí)行核心搜索、Distiller負(fù)責(zé)峰提取與定量分析，而Daemon作為操作平臺(tái)，整合前兩個(gè)板塊，以便更高效地進(jìn)行批量處理。

（來源于：https://www.rapidnovor.com/what-is-protein-mass-spectrometry/）

本次講座聚焦于TD蛋白質(zhì)組學(xué)的數(shù)據(jù)分析。TD技術(shù)以完整蛋白質(zhì)為對(duì)象，"上"指準(zhǔn)確測(cè)定分子質(zhì)量，"下"通過串聯(lián)質(zhì)譜實(shí)現(xiàn)碎裂。TD法產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)復(fù)雜，包含高電荷、大質(zhì)量離子碎片，碎片重疊增加，修飾位點(diǎn)更多，不同修飾組合導(dǎo)致蛋白質(zhì)變體預(yù)測(cè)增多。相較于BU肽段的數(shù)據(jù)處理，完整蛋白質(zhì)的譜圖更為復(fù)雜，數(shù)據(jù)處理更具挑戰(zhàn)。

（來源于SUN Rui-Xiang, LUO Lan, CHI Hao, LIU Chao, HE Si-Min. Top-down Proteomics:The Large-scale Proteoform Identification[J]. Progress in Biochemistry and Biophysics, 2015, 42(2): 101-114）

Mascot的特殊版本"Mascot Top Down"限制在110kDa，自動(dòng)用于母離子質(zhì)量大于16kDa的搜索，小于16kDa的自下而上搜索不受影響�？店攀⑹荕ascot在中國的獨(dú)家代理與技術(shù)支持機(jī)構(gòu)，本期康昱盛將分享Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)策略，包括數(shù)據(jù)上傳、峰提取參數(shù)、搜索參數(shù)設(shè)置和結(jié)果導(dǎo)出，助您熟練運(yùn)用Mascot軟件解決Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)挑戰(zhàn)。

講座時(shí)間：

1月24日（周三）14：30-15：20

講座詳情：

上期講座《一節(jié)課讓你學(xué)會(huì)使用Mascot進(jìn)行基礎(chǔ)蛋白質(zhì)定量分析》已經(jīng)同步上傳至康昱盛同名B站以及視頻號(hào)。

此外，我們計(jì)劃在2月中下旬舉辦第四次Mascot培訓(xùn)，重點(diǎn)介紹如何聯(lián)用Mascot-Scaffold系列軟件進(jìn)行蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)質(zhì)控分析。感興趣的朋友們，請(qǐng)持續(xù)關(guān)注康昱盛官方公眾號(hào)獲取更多信息！

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