百蓁參加杭州第六屆PEAKS蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班
瀏覽次數(shù):1532 發(fā)布日期:2023-6-16
來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處
6月9日,由Bioinformatics Solutions Inc.與中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會(huì)組委會(huì)聯(lián)合舉辦的“第六屆PEAKS蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班”在杭州太虛湖假日酒店成功舉辦,來自55家的企業(yè)和學(xué)術(shù)單位的150多位學(xué)員參加了本屆培訓(xùn)班。
非常感謝大會(huì)組委會(huì)的大力支持與關(guān)心,中國質(zhì)譜四十載芳華,充滿活力全新起航,再次祝賀2020 – 2023年中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會(huì)取得圓滿成功!
本次培訓(xùn)首先由Bioinformatics Solutions Inc. CEO單寶珍博士致開幕詞,介紹并感謝特邀嘉賓的到來,同時(shí)對(duì)各位參加人員的支持表示感謝,最后也對(duì)培訓(xùn)的日程及內(nèi)容作了簡(jiǎn)介介紹。
Section 1
在這一天課程安排緊湊且干貨滿滿的培訓(xùn)過程中,PEAKS團(tuán)隊(duì)以及特邀嘉賓們?yōu)榇蠹規(guī)砹司实姆窒。首先由BSI產(chǎn)品經(jīng)理李文婷為大家?guī)鞵EAKS軟件概覽和基于深度學(xué)習(xí)的肽段鑒定方法的報(bào)告分享。深度學(xué)習(xí)可以自動(dòng)從數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí)特征和模式,而無需人工歸納總結(jié)。因此,深度學(xué)習(xí)特別適合于擁有 大型復(fù)雜數(shù)據(jù)集的科學(xué)領(lǐng)域。特別是基于質(zhì)譜(MS)的蛋白質(zhì)組學(xué)中越來越重要。過去10年,深度學(xué)習(xí)是一個(gè)發(fā)展非常迅速的領(lǐng)域,促進(jìn)了數(shù)據(jù)分析的多方面,包括數(shù)據(jù)采集的設(shè)計(jì),feature的選擇,二級(jí)譜的鑒定等方面的快速提升。
Section 2
BSI算法工程師邊海博為大家?guī)鞸tream-lined DIA 數(shù)據(jù)分析全流程的分享,從算法的角度為大家展示了DIA數(shù)據(jù)處理的底層邏輯。
Section 3
張耀陽研究員臨時(shí)未能來到培訓(xùn)班現(xiàn)場(chǎng),張老師在線為大家?guī)怼痘诘鞍踪|(zhì)組學(xué)的藥物靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)及作用機(jī)制研究》的報(bào)告,分享了他們組近期的一些小分子藥物靶標(biāo)研究新進(jìn)展。雖未到場(chǎng),大家對(duì)張老師的報(bào)告期待已久,熱度不減呢!
Section 4
葉慧教授課題組的皖寧博士報(bào)告為特征離子挖掘蛋白組乳;揎棧瑥囊压_的數(shù)據(jù)中評(píng)價(jià)了乳;瘍煞N特征離子的特異性和顯著性,分別做了不同水平的驗(yàn)證分析。PEAKS團(tuán)隊(duì)為葉老師提出的統(tǒng)計(jì)需求特意定制化了一個(gè)版本,而現(xiàn)在confident PTM新功能也加入到了PEAKS軟件中。
Section 5
下午的培訓(xùn)開始前,學(xué)員們的熱情依然高漲,很早便進(jìn)入會(huì)場(chǎng)等待。下午第一場(chǎng)是由PEAKS帶給大家的《翻譯后修飾以及糖基化》,具體展開了對(duì)于PTM翻譯后修飾全新的算法優(yōu)化,從翻譯后種類,修飾位點(diǎn)和特征離子三個(gè)水平如何評(píng)價(jià)一個(gè)修飾是否可信,此外對(duì)于糖基化修飾的全景表征也提出了在新的GlycanFinder 中具體的方案和應(yīng)用。
Section 6
單寶珍博士接著對(duì)蛋白質(zhì)組相對(duì)定量的算法基本原理和優(yōu)化做了詳細(xì)的介紹,特別是在整體蛋白組實(shí)驗(yàn)、數(shù)據(jù)采集、結(jié)果分析和靶向肽段4個(gè)水平的質(zhì)控,PEAKS也提供了完整的解決方案,現(xiàn)在已經(jīng)整合在了PEAKS分析工作流中,以QC節(jié)點(diǎn)部分展示各個(gè)指標(biāo)的統(tǒng)計(jì)信息。
此外,單博還介紹了PEAKS如何運(yùn)用從頭測(cè)序技術(shù)實(shí)現(xiàn)免疫肽組數(shù)據(jù)分析,并通過2020年初我們使用質(zhì)譜從頭測(cè)序方法篩選新冠中和抗體的實(shí)際多抗發(fā)現(xiàn)案例,來說明PEAKS蛋白水平的從頭測(cè)序整體解決方案。
Section 7
來自北京生命科學(xué)研究所的董夢(mèng)秋研究員和曹勇博士,為大家分享了他們組在交聯(lián)質(zhì)譜分析中的詳細(xì)工作,特別是在實(shí)驗(yàn)部分,交聯(lián)劑的選擇,數(shù)據(jù)分析的挑戰(zhàn)等方面為大家做了詳細(xì)的展開。
培訓(xùn)過程中,每位學(xué)員都專注聚精會(huì)神地聆聽,精彩部分還不忘拿出手機(jī)、手提電腦或是筆記本等各種工具進(jìn)行記錄,同時(shí),學(xué)員們也積極提問,培訓(xùn)老師們也都認(rèn)真給予解答,現(xiàn)場(chǎng)關(guān)于專業(yè)知識(shí)的交流互動(dòng)融洽且精彩。
培訓(xùn)結(jié)束后學(xué)員們?nèi)詿崆椴粶p,抓住機(jī)會(huì)與培訓(xùn)老師私下探討相關(guān)問題,最后,本次培訓(xùn)班在大家真誠的感謝和告別聲中落下帷幕。
PEAKS團(tuán)隊(duì)十分感謝大家的積極參與,通過本次培訓(xùn)班平臺(tái)提供的寶貴線下交流機(jī)會(huì),讓我們能夠快速地收集用戶在PEAKS使用中的問題和需求,讓我們共同推進(jìn)PEAKS軟件的開發(fā)和進(jìn)步。如果您遺憾錯(cuò)過這次培訓(xùn)班,或想進(jìn)一步回顧嘉賓們的精彩分享,請(qǐng)持續(xù)關(guān)注我們,后續(xù)將奉上培訓(xùn)期間BSI團(tuán)隊(duì)的培訓(xùn)視頻回放,千萬不要錯(cuò)過哦~
2020-2023年中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會(huì)
《2020-2023年中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會(huì)》于2023年6月9-13日在杭州太虛湖假日酒店成功舉辦,本次大會(huì)是中國質(zhì)譜界的又一次盛會(huì),旨在促進(jìn)學(xué)界團(tuán)結(jié)進(jìn)步、和諧發(fā)展、共贏未來,提高學(xué)術(shù)交流水平,推動(dòng)質(zhì)譜技術(shù)在各大科技領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用。本次大會(huì)將邀請(qǐng)國內(nèi)外質(zhì)譜領(lǐng)域的著名學(xué)者出席,BSI中國分公司百蓁生物的首席科學(xué)官/副總裁彭超博士應(yīng)邀于12日做題為《整合型前沿質(zhì)譜技術(shù)在生命科學(xué)與藥物研發(fā)中的應(yīng)用》,彭博士以lip-MS,HDX-MS和新抗原發(fā)現(xiàn)三個(gè)熱點(diǎn)為綱要,詳細(xì)介紹了整合型質(zhì)譜技術(shù)在小分子藥物和靶蛋白結(jié)合位點(diǎn)分析,藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn),蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)表征、抗體抗原表位分析以及腫瘤新抗原和免疫治療等的應(yīng)用,并結(jié)合了下游數(shù)據(jù)分析,為大家展開了完整的研究思路。
最后感謝《2020-2023年中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會(huì)》提供一個(gè)展示我國在質(zhì)譜及相關(guān)領(lǐng)域的最新研究進(jìn)展和成果,增進(jìn)廣大質(zhì)譜科學(xué)工作者及質(zhì)譜相關(guān)從業(yè)人員間的交流和合作平臺(tái),預(yù)祝大會(huì)圓滿成功!
如果您想深入了解更多關(guān)于培訓(xùn)班內(nèi)容,歡迎點(diǎn)擊下方鏈接查看培訓(xùn)視頻直播回放!
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MzY2MTExMw==&mid=2247487208&idx=2&sn=fd456410fcf63cd0bf2a2b2148f45fd6&chksm=cf454ebef832c7a84c6b47504308427aa13ac168a2c03ef4dd21322803c910b72c181330b3ab&token=1528927511&lang=zh_CN#rd