系列講座主題:
主題一:理性抗體設(shè)計(jì)之基礎(chǔ):抗體結(jié)構(gòu)建模
主題二:基于結(jié)構(gòu)的抗體人源化設(shè)計(jì)
主題三:抗體可開(kāi)發(fā)性預(yù)測(cè)及優(yōu)化改造
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一、理性抗體設(shè)計(jì)之基礎(chǔ):抗體結(jié)構(gòu)建模
時(shí)間:2月23日(周四)下午15:00-16:00
抗體藥物設(shè)計(jì)的研究起點(diǎn)往往是蛋白序列,但大多數(shù)抗體藥物設(shè)計(jì),如基于結(jié)構(gòu)的抗體設(shè)計(jì)、抗體親和力成熟或抗體人源化等,則是基于抗體結(jié)構(gòu)開(kāi)展。因此,快速而準(zhǔn)確地確定抗體結(jié)構(gòu)是理性抗體設(shè)計(jì)的關(guān)鍵,也為諸多計(jì)算機(jī)輔助抗體設(shè)計(jì),提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
得益于強(qiáng)大的建模算法和蛋白模擬計(jì)算速度,MOE軟件可以高效而精準(zhǔn)地執(zhí)行抗體結(jié)構(gòu)建模,獲得的抗體結(jié)構(gòu)模型與晶體解析結(jié)果差異極小。
在本次講座中,我們將全面介紹MOE中的抗體建模功能,您將可以了解到:
1.基于知識(shí)的抗體建模算法;
2.對(duì)不同功能區(qū)選擇多個(gè)模板構(gòu)建抗體模型;
3.如何評(píng)估模建出的抗體結(jié)構(gòu)?
4.利用Alphafold2接口進(jìn)行抗體結(jié)構(gòu)模建;
5.ScFv模建和雙抗結(jié)構(gòu)模建。
二、基于結(jié)構(gòu)的抗體人源化設(shè)計(jì)
時(shí)間:3月9日(周四)下午15:00-16:00
抗體人源化是治療性抗體藥物開(kāi)發(fā)中的常用策略,通過(guò)免疫異源物種獲得高親和性的抗體,并將異源抗體的CDR區(qū)嫁接至人源Framework區(qū)之上,同時(shí)通過(guò)特定方法改造嫁接之后的抗體,維持人源化抗體高活性的同時(shí)降低免疫原性,能夠快速地開(kāi)發(fā)出候選抗體。
基于MOE軟件的強(qiáng)大功能,康昱盛技術(shù)團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)出MOE抗體人源化模塊,能夠根據(jù)異源抗體序列快速而準(zhǔn)確地進(jìn)行抗體人源化設(shè)計(jì),具備成功率高和學(xué)習(xí)成本低的特點(diǎn)。
在本次講座中,我們將為您介紹應(yīng)用MOE進(jìn)行抗體人源化改造的功能,您將可以了解到:
1.抗體人源化的算法原理;
2.MOE抗體人源化模塊介紹;
3.候選Germline基因挑選;
4.經(jīng)典殘基的識(shí)別和分析;
5.納米抗體的人源化;
6.抗體人源化的技巧:動(dòng)力學(xué)優(yōu)化蛋白模型及注釋方法的選擇等。
三、抗體可開(kāi)發(fā)性預(yù)測(cè)及優(yōu)化改造
時(shí)間:3月23日(周四)下午15:00-16:00
在抗體藥物的研發(fā)過(guò)程中,對(duì)候選抗體序列進(jìn)行可開(kāi)發(fā)性預(yù)測(cè),評(píng)估并改善候選抗體序列的成藥性,能夠極大地提高抗體藥物后期開(kāi)發(fā)的成功率?贵w可開(kāi)發(fā)性預(yù)測(cè)涉及多個(gè)方面,包括抗體的多維屬性,聚集傾向,粘度和熱穩(wěn)定性,以及翻譯后修飾位點(diǎn)(PTM位點(diǎn))的預(yù)測(cè)等。
MOE軟件通過(guò)多種不同的算法,實(shí)現(xiàn)多方面的抗體可開(kāi)發(fā)性預(yù)測(cè)。通過(guò)MOE豐富且全面的蛋白模擬模塊,可以在研發(fā)早期更全面地評(píng)估候選抗體序列,也可以基于計(jì)算結(jié)果對(duì)抗體進(jìn)行修飾和改造,提高抗體的成藥性。
在本次講座中,我們將為您介紹如何使用MOE軟件進(jìn)行抗體可開(kāi)發(fā)性預(yù)測(cè),您將可以了解到:
1.什么是抗體可開(kāi)發(fā)性?
2.如何使用計(jì)算模擬進(jìn)行可開(kāi)發(fā)性預(yù)測(cè)?
3.基于pH動(dòng)態(tài)構(gòu)象采樣的抗體多維屬性預(yù)測(cè);
4.抗體PTM位點(diǎn)預(yù)測(cè)
5.抗體粘度、清除率及穩(wěn)定性預(yù)測(cè)。
6.抗體沉聚性質(zhì)預(yù)測(cè)及優(yōu)化
7.抗體溶解度評(píng)估及優(yōu)化