系列講座主題：

主題一：初識GOLD：GOLD的對接原理及其性能介紹

主題二：大批量的分子對接：如何使用GOLD進行虛擬篩選

主題三：如何使用GOLD進行含有水分子或金屬離子體系的分子對接
 

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一、初識GOLD：GOLD的對接原理及其性能介紹

Basic introduction of GOLD: the genetic algorithm and the performance of GOLD

時間：11月24日（周四）下午15:00-16:00
 

此次講座您將了解到GOLD的遺傳算法、四種常用的打分函數(shù)等理論知識，同時我們將通過一個案例分析，為您介紹GOLD分子對接的流程、關(guān)鍵參數(shù)的設(shè)置及結(jié)果分析的方法。

二、大批量的分子對接：如何使用GOLD進行虛擬篩選

Ultra-large docking: Using GOLD for High throughput virtual screening

時間：12月08日（周四）下午15:00-16:00 
 

虛擬篩選可以通過計算機模擬幫助研發(fā)工作人員快速的在海量化合物中篩選出具有目標靶蛋白活性的先導化合物，大大節(jié)省了實驗時間和成本。目前GOLD支持在PC端、HPC集群或云端進行大批量虛擬篩選工作，此次講座您將了解到如何使用GOLD進行虛擬篩選工作，以及如何進行虛擬篩選結(jié)果分析等。

三、如何使用GOLD進行含有水分子或金屬離子體系的分子對接

Docking with and without water using GOLD: Identify the solvated intermediate ligand-protein interaction

時間：12月22日（周四）下午15:00-16:00 
 

水在蛋白質(zhì)-配體結(jié)合過程中的作用至關(guān)重要。在基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計中，人們通常對配體進行優(yōu)化以取代蛋白質(zhì)結(jié)合口袋中能量不利的水分子。有些蛋白體系含有金屬離子或金屬離子復(fù)合物比如CPY450酶等，金屬離子能與蛋白或小分子形成配位鍵，但是配位鍵模型在經(jīng)典的力場中比較難以準確描述。

在GOLD 中憑借CSD 數(shù)據(jù)庫中大量的含金屬的晶體結(jié)構(gòu)，GOLD對于金屬離子的相互作用構(gòu)型等有較好理解，因此特別適用于含金屬離子的體系對接。

此次講座您將了解到如何分析結(jié)合口袋中的水分子和金屬離子的作用，并使用GOLD進行含有水分子或金屬離子體系的分子對接。