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講座:劍橋結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)中心CCDC介紹與使用案例

瀏覽次數(shù):2460 發(fā)布日期:2022-6-28  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處

系列講座主題:
主題一:小分子構(gòu)象分析利器-Mogul 介紹及其在藥物設(shè)計中的應(yīng)用案例
主題二:強大的分子對接軟件GOLD介紹及應(yīng)用
主題三:利用CCDC軟件進行構(gòu)象生成及分子疊合

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一、小分子構(gòu)象分析利器-Mogul 介紹及其在藥物設(shè)計中的應(yīng)用案例
Using Mogul to assess molecular geometry and the use cases in drug design.

時間:7月15日(周五)下午15:00-16:00

藥物設(shè)計中,判斷小分子構(gòu)象的合理性是十分重要的。比如小分子和蛋白結(jié)合構(gòu)象,可能在對接和打分中提示了較強的結(jié)合力,但是在真實的實驗中卻沒有活性或者活性較差,其中一部分原因可能是因為對接程序和打分對于分子構(gòu)象合理性的考慮不足。Mogul 是基于海量小分子晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)提煉的知識數(shù)據(jù)庫,利用Mogul可以檢查小分子構(gòu)象中任何不常見的(unusual)的構(gòu)象特征,比如不合理的二面角、鍵長及鍵角。本次在線講座將介紹Mogul的功能特性,并用Mogul解釋化合物的SAR數(shù)據(jù)、篩選合理的Docking 構(gòu)象以及用于化合物的結(jié)構(gòu)優(yōu)化。

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二、強大的分子對接軟件GOLD介紹及應(yīng)用
The introduction of GOLD and its advantages.

時間:7月29日(周五)下午14:30-15:30 

GOLD 是一款知名的分子對接軟件,憑借CCDC海量的晶體數(shù)據(jù)GOLD在分子結(jié)合構(gòu)象生成、含有金屬離子參與的體系對接等方面有強大的功能和優(yōu)勢。本次在線講座將介紹GOLD特點和優(yōu)勢以及在藥物設(shè)計中的應(yīng)用案例。

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三、利用CCDC軟件進行構(gòu)象生成及分子疊合
Conformer generation and molecular alignment.

時間:8月12日(周五)下午15:00-16:00 

CCDC的Discovery 套件提供分子構(gòu)象生成和疊合算法,通過借助超過100萬的晶體數(shù)據(jù)庫的知識和理解能夠以極快的速度生成優(yōu)良的分子構(gòu)象。

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