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講座預(yù)告:第六屆PEAKS蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班

瀏覽次數(shù):2695 發(fā)布日期:2022-2-15  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處

培訓(xùn)簡介:
質(zhì)譜的技術(shù)發(fā)展,極大程度地推動了蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展。無論是單個蛋白的表征、單細(xì)胞蛋白質(zhì)組,還是到大規(guī)模的臨床蛋白質(zhì)組學(xué),離不開多屬性的質(zhì)譜方法和對應(yīng)的數(shù)據(jù)分析。本屆蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班將由豆谷科技與中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會組委會聯(lián)合舉辦,旨在從質(zhì)譜方法及數(shù)據(jù)分析,到最新的蛋白組學(xué)的應(yīng)用,為從事蛋白組學(xué)的科研人員和學(xué)生提供一個學(xué)習(xí)和交流的平臺,誠摯地邀請您的參與!

主辦單位:上海豆谷信息科技有限公司
                中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會組委會
培訓(xùn)時間:2022年3月17日(周四)
培訓(xùn)地點(diǎn):杭州市蕭山區(qū)義橋東方文化園-杭州太虛湖假日酒店附樓二樓百源廳

特邀嘉賓:
(按姓氏排名)


邊海博,算法工程師,Bioinformatics Solutions Inc. 。在BSI公司從事算法研究工作,于2016年和2019年分別在浙江大學(xué)獲得軟件工程學(xué)士,在University of Waterloo獲得數(shù)學(xué)碩士學(xué)位,主要研究方向?yàn)橛?jì)算機(jī)科學(xué)、系統(tǒng)與網(wǎng)絡(luò)。目前在PEAKS團(tuán)隊(duì)中研究蛋白質(zhì)搜索算法并進(jìn)行設(shè)計(jì)優(yōu)化,特別是對DIA數(shù)據(jù)分析的算法有深入研究。


曹勇 博士,北京生命科學(xué)研究所。現(xiàn)為北京生命科學(xué)研究所董夢秋實(shí)驗(yàn)室博后。博士期間一共發(fā)表論文12篇,代表性工作包括:開發(fā)了新型靶向精氨酸的交聯(lián)劑和為交聯(lián)軟件測評制備了可靠數(shù)據(jù)集,兩項(xiàng)工作都以共同一作在Nature Communications發(fā)表。此外,還應(yīng)用交聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)輔助其他課題組解析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、表征蛋白質(zhì)構(gòu)象變化以及鑒定二硫鍵等,成果以共同作者發(fā)表在Nature、Nature Communications、Science Advances、PNAS等雜志上。曹勇博士在交聯(lián)質(zhì)譜領(lǐng)域有豐富的經(jīng)驗(yàn),所在的董夢秋老師課題組開發(fā)的交聯(lián)肽段質(zhì)譜鑒定技術(shù)被全球很多實(shí)驗(yàn)室采用。


董夢秋 博士,研究員,北京生命科學(xué)研究所。耶魯大學(xué)博士,斯克利普斯研究所博士后,2007年回國,在北京生命科學(xué)研究所工作至今。董夢秋課題組以線蟲為模型研究關(guān)于衰老的基礎(chǔ)生物學(xué)問題,同時開發(fā)基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),在兩個領(lǐng)域都取得了突破性進(jìn)展,相關(guān)文章發(fā)表在Nature、Nature Methods、Nature Communications、eLife、Aging Cell, Journal of Proteome Research、Analytical Chemistry 等期刊。課題組開發(fā)的交聯(lián)肽段質(zhì)譜鑒定技術(shù)是輔助解析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或蛋白-蛋白相互作用的有效工具,被全球很多實(shí)驗(yàn)室采用。在生物學(xué)方面,課題組目前的研究重點(diǎn)是解析線蟲衰老的生物學(xué)過程,以系統(tǒng)生物學(xué)思想結(jié)合多組學(xué)手段回答衰老是什么、衰老是否由遺傳程序控制等基本問題。


單寶珍 博士,CEO,Bioinformatics Solutions Inc.。加拿大Bioinformatics Solutions Inc.(BSI)的首席執(zhí)行官,是PEAKS算法的設(shè)計(jì)開發(fā)核心成員。單博士1997年在南京大學(xué)獲得化學(xué)博士學(xué)位,并于2009年在Western University獲得計(jì)算機(jī)博士學(xué)位,在基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)的數(shù)據(jù)挖掘和統(tǒng)計(jì)分析(比如蛋白質(zhì)/多肽鑒定和定量、抗體表征等)的相關(guān)研究和算法開發(fā)方面有近20年的豐富經(jīng)驗(yàn)。


張耀陽 博士,研究員,中科院生物與化學(xué)交叉研究中心。于2004年和2006年在北京理工大學(xué)分別獲得學(xué)士和碩士學(xué)位,2010年在德國馬克斯普朗克精神病研究所和慕尼黑大學(xué)獲得博士學(xué)位,隨后在美國斯克利普斯研究所進(jìn)行博士后研究。張耀陽研究員于2013年加入中國科學(xué)院生物與化學(xué)交叉研究中心,擔(dān)任‘質(zhì)譜與蛋白質(zhì)組’研究組長的職位,并獲得中科院“百人計(jì)劃”支持。張耀陽研究員目前的研究主要集中在蛋白質(zhì)質(zhì)譜技術(shù)的開發(fā)及其在生物體系中應(yīng)用。

培訓(xùn)內(nèi)容:

8:30 - 9:00 簽到
9:00 - 9:05 主辦方致辭
9:05 - 9:25

李文婷 高級應(yīng)用工程師
豆谷科技

· 蛋白質(zhì)組學(xué)概覽
· PEAKS安裝軟件

9:25 - 10:25

邊海博 算法工程師
Bioinformatics Solutions Inc.

DIA數(shù)據(jù)分析全流程:
1.DIA de novo與de novo譜圖庫應(yīng)用
2.DIA 直接序列數(shù)據(jù)庫搜索
3.DIA 譜圖庫搜索
4.數(shù)據(jù)質(zhì)控

10:25-10:40

茶歇

10:40--11:20

張耀陽 博士,研究員
中科院生物與化學(xué)交叉研究中心

特邀報(bào)告:蛋白質(zhì)組學(xué)在藥物靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)及
作用機(jī)制研究中的應(yīng)用

11:20-12:00

李文婷 高級應(yīng)用工程師
豆谷科技

肽段鑒定方法:
1.從頭測序
2.序列數(shù)據(jù)庫與蛋白推斷
3.打分與大規(guī)模數(shù)據(jù)FDR質(zhì)控

12:00-13:30 午餐  

13:30-14:15

李文婷 高級應(yīng)用工程師
豆谷科技

翻譯后修飾與突變

14:15-15:00

單寶珍 博士,CEO
Bioinformatics Solutions Inc.

完整糖肽分析:
1.糖基化及位點(diǎn)鑒定
2.寡糖鏈從頭測序

15:00-15:15 茶歇  

15:15-16:00

董夢秋 博士,研究員
北京生命科學(xué)研究所
曹勇 博士
北京生命科學(xué)研究所

特邀報(bào)告:Chemical Cross-linking of Proteins 
Coupled with Mass Spectrometry

16:00-17:00

單寶珍 博士,CEO
Bioinformatics Solutions Inc.

蛋白相對定量:
定量方法新優(yōu)化(DDA & DIA)

如何報(bào)名:
如果您計(jì)劃參加,可以通過以下兩種方式報(bào)名,由于座位有限,建議您提前報(bào)名!
1. 請點(diǎn)擊豆谷官方網(wǎng)站上方“我要報(bào)名”即可!
2. 掃描填寫下方報(bào)名表單報(bào)名參加!

報(bào)名后,我們會在一個工作日內(nèi)通過微信或郵件回復(fù)您!

備注:如果您已經(jīng)報(bào)名參加“2020年中國質(zhì)譜學(xué)術(shù)大會”,可以免費(fèi)參加本次培訓(xùn)班。
 

培訓(xùn)費(fèi)用及相關(guān)事項(xiàng):
1、培訓(xùn)班期間每位學(xué)員提供午餐和茶點(diǎn),以及培訓(xùn)班期間的PEAKS Studio軟件免費(fèi)試用。
2、請參加人員自備筆記本電腦和鼠標(biāo),以便在培訓(xùn)當(dāng)天由主辦方安裝軟件。
3、收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)為:1200元/人。
 

付款方式:

1.網(wǎng)上匯款或銀行轉(zhuǎn)賬
我公司銀行卡的信息為:
戶名:上海豆谷信息科技有限公司
賬號:31001632504052514304
開卡銀行:建行上海宜山路支行

    2.支付寶付款

    名稱:上海豆谷信息科技有限公司
    賬號:43542942@qq.com


聯(lián)系我們:
報(bào)名咨詢:徐玉仙
Email:  sales@wandougu.com
電話: 021-54155562、13764231640


關(guān)于豆谷科技
上海豆谷信息科技有限公司是一家致力于為蛋白質(zhì)組學(xué)和抗體生物藥領(lǐng)域的科研工作者提供基于質(zhì)譜的數(shù)據(jù)分析軟件和服務(wù)整體解決方案的公司,是加拿大Bioinformatics Solutions Inc在中國的獨(dú)家代理,負(fù)責(zé)軟件全系列產(chǎn)品和服務(wù)的商務(wù)、銷售和技術(shù)工作,主要包括:PEAKS AB及抗體測序與表征服務(wù),PEAKS Studio、PEAKS Online等

關(guān)于BSI
BSI是世界領(lǐng)先的生物信息軟件和服務(wù)公司,位于加拿大享有“硅谷”之稱的安大略省滑鐵盧市。BSI在質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域擁有多年的經(jīng)驗(yàn)積累,為迅猛發(fā)展的基因組學(xué),蛋白質(zhì)組學(xué)和生物技術(shù)行業(yè)提供了世界領(lǐng)先的算法和軟件解決方案及質(zhì)譜分析服務(wù)。旗下著名的PEAKS軟件平臺在全世界范圍內(nèi)擁有上千家學(xué)術(shù)和工業(yè)界用戶。2016年ASMS期間BSI又隆重推出的PEAKS AB軟件平臺更是一經(jīng)推出即獲得多家生物制藥公司的青睞。

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