2020年2月份發(fā)表在《PLOS GENETICS》上的一篇文章中，研究人員利用秀麗隱桿線蟲Caenorhabditis elegans重組自交系(RIL)來研究遺傳變異所導(dǎo)致的物種適應(yīng)性變化。他們通過鑒定發(fā)現(xiàn)了一株具有高度環(huán)境適應(yīng)性的蟲株，此外該蟲株對周圍環(huán)境表現(xiàn)出了更強(qiáng)的探索性，而親本株并不具備這些特征。對該蟲株進(jìn)行短讀測序發(fā)現(xiàn)rcan-1基因發(fā)生了復(fù)雜的自發(fā)重排。利用Oxford Nanopore長讀長測序技術(shù)將這種復(fù)雜的重排解析為5個獨(dú)特的串聯(lián)反轉(zhuǎn)/重復(fù)。作者認(rèn)為，新的生存環(huán)境可以產(chǎn)生進(jìn)化壓力，從而產(chǎn)生復(fù)雜的基因重排，這種重排除了可以增加基因拷貝數(shù)之外，還可以通過其他方式影響和改變基因表達(dá)。該文章中，BluePippin被用來分離和回收10-50kb的DNA片段，用于后續(xù)Oxford Nanopore MinION文庫制備。

小編短評：BluePippin可用于三代長讀長測序的文庫構(gòu)建，專門用于回收大片段DNA，可有效提升三代測序的效率，提高測序數(shù)據(jù)的N50值。是三代測序的標(biāo)配工具。

圖1：BluePippin用于Nanopore三代測序流程圖

Sage Science是全球領(lǐng)先的研發(fā)和制造Pippin系列全自動核酸電泳片段回收儀的生產(chǎn)廠家，擁有美國技術(shù)專利，其生產(chǎn)的Sage系列產(chǎn)品可以高效完成不同長度范圍的DNA片段的精準(zhǔn)回收，廣泛用于二代測序、三代測序以及多個分子生物學(xué)相關(guān)領(lǐng)域。
 
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