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轉(zhuǎn)錄組學(xué)與全基因組重測序數(shù)據(jù)分析實(shí)操班通知

瀏覽次數(shù)：9743　發(fā)布日期：2019-11-26　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

各科研單位：

隨著新一代高通量測序技術(shù)的快速發(fā)展，在準(zhǔn)確度大大提高的前提下, 進(jìn)一步降低測序成本。由此不斷產(chǎn)生出巨量的分子生物學(xué)數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)有著數(shù)量巨大、關(guān)系復(fù)雜的特點(diǎn)，以至于不利用計(jì)算機(jī)根本無法實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的存儲和分析。隨著生物信息學(xué)作為新興學(xué)科迅速蓬勃發(fā)展，正在改變?nèi)藗冄芯可镝t(yī)學(xué)的傳統(tǒng)方式，高通量測序技術(shù)以及數(shù)據(jù)分析技術(shù)已成為探索生物學(xué)底層機(jī)制和研究人類復(fù)雜疾病診斷、治療及預(yù)后的重要工具，廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)各個(gè)領(lǐng)域，是21世紀(jì)生命科學(xué)與生物技術(shù)的重要戰(zhàn)略前沿和主要突破口。為進(jìn)一步推動(dòng)我國生物信息學(xué)特別是基因組學(xué)的發(fā)展，提高從業(yè)人員的技術(shù)水平。由中科成創(chuàng)（北京）生物技術(shù)有限公司具體承辦，具體事宜通知如下：

一、培訓(xùn)目標(biāo)及特點(diǎn)：

本培訓(xùn)以轉(zhuǎn)錄組學(xué)與基因組學(xué)的應(yīng)用與數(shù)據(jù)分析為主題，精心設(shè)計(jì)了具有前沿性、實(shí)用性和針對性強(qiáng)的理論課程和上機(jī)課程。培訓(xùn)邀請的主講人均是有理論和實(shí)際研究經(jīng)驗(yàn)的人員。學(xué)員通過與專家直接交流，能夠分享到這些頂尖學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的研究經(jīng)驗(yàn)和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路。學(xué)員通過集中專題學(xué)習(xí)后能夠擴(kuò)展思路，在研究技術(shù)方面領(lǐng)悟更多。

二、授課專家：

主講專家來自中科院科研機(jī)構(gòu)的高級專家，擁有豐富的科研工作經(jīng)驗(yàn)，長期從事生物信息學(xué)方面的項(xiàng)目研究，發(fā)表Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell等雜志40多篇。具有資深的技術(shù)底蘊(yùn)和專業(yè)背景，目前承擔(dān)國家科技部、國家自然基金委和市科技新星項(xiàng)目等多項(xiàng)課題。

三、培訓(xùn)對象：

大中專院校生物信息、生物計(jì)算、生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)、農(nóng)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)類專業(yè)的課程負(fù)責(zé)人、一線教師、教研室骨干人員、教學(xué)管理人員；科研單位從事數(shù)據(jù)分析實(shí)驗(yàn)室人員、生物、生命科學(xué)、微生物研究的相關(guān)人員；生物、醫(yī)藥、化學(xué)及相關(guān)企業(yè)的領(lǐng)導(dǎo)與技術(shù)骨干。

四、時(shí)間地點(diǎn)：2019年12月26日—12月29日（時(shí)間安排：第1天報(bào)到，授課3天）河南鄭州

五、培訓(xùn)內(nèi)容：

第一天	9：00-12：00 Lunix系統(tǒng)講解 R語言	1．常規(guī)基礎(chǔ)Linux命令入門講解及實(shí)操訓(xùn)練。
		2．R語言簡介及安裝，RStudio的安裝及使用說明。
		3．R語言語法介紹及常用命令。
		4．R語言畫圖實(shí)操，tSNE，小提琴圖，熱圖，網(wǎng)絡(luò)圖，GO、KEGG富集圖等圖形繪制(實(shí)操)。
	13：30-17：30 轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)分析在植物、動(dòng)物、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的應(yīng)用理論講解	1．轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動(dòng)態(tài)。
		2．轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例。
		3．轉(zhuǎn)錄組分析應(yīng)用熱點(diǎn)。
第二天	9：00-12：00 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析流程及實(shí)操	1．轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹。
		2．轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化。
		3．轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)比對。
		4．DESeq2進(jìn)行表達(dá)量估計(jì)和分析（實(shí)操）。
	13：30-17：30 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘和關(guān)聯(lián)分析上機(jī)實(shí)操	轉(zhuǎn)錄組聚類分析（實(shí)操）。
		2．通過ggsurvival構(gòu)建生存曲線（實(shí)操）。
		3．通過cox分析構(gòu)建預(yù)后模型（實(shí)操）。
		4．lncRNA與mRNA關(guān)聯(lián)分析。
		5．個(gè)性化分析方案。
第三天	9：00-12：00 基因組學(xué)學(xué)數(shù)據(jù)分析在植物、動(dòng)物、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的應(yīng)用及上機(jī)操作	基因組學(xué)生物信息學(xué)前沿技術(shù)動(dòng)態(tài)
		基因組重測序及數(shù)據(jù)分析
		數(shù)據(jù)模擬（實(shí)操）
		數(shù)據(jù)過濾及質(zhì)量評估（實(shí)操）
		5．SOAP/Bwa/Bowtie 等軟件的使用
	13：30-17：30 單細(xì)胞測序技術(shù)應(yīng)用與案例介紹、10×單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析思路及流程	1. 單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)原理和科研應(yīng)用。
		2. 近年單細(xì)胞方向高分文章思路解析和案例介紹。
		3. 10×官方單細(xì)胞軟件Cell ranger講解及實(shí)操。
		4. 從基因表達(dá)矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實(shí)操。
		5. 通過Seurat軟件進(jìn)行PCA及tSNE降維。

（*實(shí)際授課還會增加一些學(xué)員報(bào)名時(shí)反饋的感興趣內(nèi)容，希望參會人員可以把自己想了解的內(nèi)容，報(bào)名時(shí)一起填寫在回執(zhí)表上。大家在上課期間有什么問題，都可以隨時(shí)提出，如果有針對性問題可在課間、課下和老師進(jìn)行交流；）

六、報(bào)名辦法及費(fèi)用：

每人￥3980元（含報(bào)名費(fèi)、培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)費(fèi)）

團(tuán)隊(duì)報(bào)名：4+1優(yōu)惠。（5位其中1位免除費(fèi)用）

食宿可統(tǒng)一安排，費(fèi)用自理。各單位人員報(bào)名參加，報(bào)名回執(zhí)表請回傳至?xí)⻊?wù)處即可。

如單位有內(nèi)訓(xùn)需求，請將內(nèi)訓(xùn)方案傳至?xí)⻊?wù)組，根據(jù)單位需求安排相應(yīng)專家進(jìn)行授課

七、聯(lián)系方式：

聯(lián)系人：張琦 177 4456 9660（微信同號）

報(bào)名郵箱：zkcc_BIS@vip.163.com

中科成創(chuàng)（北京）生物技術(shù)有限公司

二零一九年十一月二十六日