高通量ChIP-seq測定助力全基因組蛋白質(zhì)-DNA分析
瀏覽次數(shù):4176 發(fā)布日期:2016-4-5
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Porvair Sciences公司
Chromatrap®產(chǎn)品事業(yè)部發(fā)布一則新的應(yīng)用筆記,介紹Chromatrap® ChIP-seq測定如何助力全基因組蛋白-DNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究。
蛋白質(zhì)-DNA相互作用的全基因組映射在基因調(diào)控研究中必不可少。一份表觀遺傳標(biāo)記和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的詳細(xì)圖譜是推斷調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和鞏固各種生物系統(tǒng)基因表達(dá)的關(guān)鍵。研究這些相互作用時(shí),ChIP和大規(guī)模平行測序(ChIP-seq)是最廣泛的使用工具。
新應(yīng)用筆記詳述了Chromatrap® ChIP-seq試劑盒與Illumina公司ChIP-seq文庫制備試劑盒和測序平臺(tái)一起使用時(shí),如何為測序提供高品質(zhì)的DNA。由于Chromatrap®獨(dú)有的固相基質(zhì)和可選96孔板測定,所需較小的樣品量、減少的離心沖洗步驟和無需封閉的基質(zhì),樣本通量和再現(xiàn)性得以極大提高。
Chromatrap® ChIP-seq 測定可兼容富集片段的直接測序、深度測序,可助力蛋白-DNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的全基因組研究,提供公正的研究數(shù)據(jù)。惰性固體載體基質(zhì)可重現(xiàn)捕獲和從少量input染色質(zhì)中獲取的重要調(diào)節(jié)復(fù)合物的全基因組擴(kuò)增。進(jìn)一步的結(jié)果表明Chromatrap® ChIP-seq可用于了解人子宮內(nèi)膜雌激素受體的基因組廣泛結(jié)合模式;且是大規(guī)模并行新一代測序的快速、多重分析工具。