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193 次 基因沙漠：調(diào)控Shox2基因多效性表達與胚胎發(fā)育的關(guān)鍵區(qū)域 2024-11-20
文章題目：A gene desert required for regulatory control of pleiotropic Shox2 expression and embryonic survival發(fā)表時間：2024.10.10發(fā)表平臺：Nature Communications影響因子：IF 14.7 Q
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300 次 利用染色質(zhì)免疫共沉淀測序技術(shù)ChIP-seq等揭示頭頸鱗癌免疫逃逸機制 2024-10-9
免疫逃逸是癌癥進展的關(guān)鍵里程碑，是腫瘤免疫治療的理論基礎(chǔ)。頭頸部鱗狀細胞癌（(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)）是全球最常見的惡性腫瘤之一，傳統(tǒng)治療選擇包括手術(shù)切除、放
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651 次 ChIP-seq等揭示Foxo1-YAP-Notch1軸在疾病進展中的表觀調(diào)控作用 2024-8-27
大家好，這里是專注表觀組學十余年，領(lǐng)跑多組學科研服務的易基因。非酒精性脂肪性肝炎（nonalcoholic steatohepatitis，NASH）是一種慢性肝臟疾病，其特征是肝臟中脂肪積累、炎癥和纖維化。干擾
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430 次 seq-DAP-seq和ChIP-seq聯(lián)合檢測揭示花發(fā)育器官轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控機制 2024-6-28
技術(shù)簡介MADS轉(zhuǎn)錄因子的同源蛋白SEPALLATA3 (SEP3)和AGAMOUS (AG)是調(diào)控擬南芥花發(fā)育分化的重要DNA結(jié)合蛋白。在雌蕊發(fā)育階段，SEP3和AG形成異源四聚體，通過識別CArG-box序列來調(diào)控基因的表達。
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667 次 ChIP-seq等在揭示m6A修飾以促進卵巢癌發(fā)展研究中的應用 2024-2-29
卵巢癌（Ovarian cancer，OC）是影響女性生殖系統(tǒng)的三種常見惡性腫瘤之一。轉(zhuǎn)錄因子Forkhead box蛋白O1（FoxO1），又稱forkhead橫紋肌肉瘤（rhabdomyosarcoma）轉(zhuǎn)錄因子，屬于Forkhead box O（F
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502 次 ChIP-seq等揭示人畜共患寄生蟲弓形蟲的蛋白質(zhì)乳酸化和代謝調(diào)控機制 2024-1-29
弓形蟲（Toxoplasma gondii）是弓形蟲病（toxoplasmosis）廣泛傳播的寄生蟲病的病原體之一，但其生物學特性仍然知之甚少。乳酸（Lactate）作為葡萄糖代謝的產(chǎn)物，不僅在包括弓形蟲在內(nèi)的多種生物
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498 次 文獻解讀：WWOX基因通過上調(diào)Myc促進骨肉瘤發(fā)生發(fā)展的表觀調(diào)控機制 2024-1-10
骨肉瘤（Osteosarcoma, OS）是一種高侵襲性骨腫瘤，主要影響兒童和青少年。這種惡性腫瘤與不良臨床結(jié)果相關(guān)，尤其是肺轉(zhuǎn)移。由于其罕見性和生物學異質(zhì)性，對其分子基礎(chǔ)研究有限，阻礙了有效療法
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432 次 ChIP-seq等揭示SETD2介導H3K36me3調(diào)控結(jié)直腸癌進展的表觀遺傳機制 2023-12-5
結(jié)直腸癌(Colorectal cancer，CRC)是一種復雜的多階段疾病，由基因突變和表觀遺傳改變相互作用引起。組蛋白H3K36三甲基轉(zhuǎn)移酶SET結(jié)構(gòu)域2 (SETD2)是一種表觀遺傳信號分子，在結(jié)直腸癌中突變率為5
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430 次 ChIP-seq揭示BRWD3調(diào)控KDM5活性以維持H3K4甲基化水平的表觀機制應用 2023-10-31
組蛋白修飾對調(diào)控染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達至關(guān)重要，組蛋白修飾失調(diào)可能導致疾病狀態(tài)和癌癥。染色質(zhì)結(jié)合蛋白BRWD3（Bromodomain and WD repeat-containing protein 3）是Cul4-DDB1 E3泛素連接酶復合
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462 次 ChIP-seq等在揭示Runx2通過轉(zhuǎn)錄調(diào)控表達激活肝星狀細胞中的應用 2023-8-31
肌成纖維細胞（myofibroblasts）主要由肝臟中活化的肝星狀細胞(hepatic stellate cells HSC)組成，在肝纖維化進展中發(fā)揮著核心作用。由于肌成纖維細胞主要負責細胞外基質(zhì)蛋白的合成、沉積和重塑
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404 次 ChIP-seq等在揭示NRF1促進原始生殖細胞的發(fā)育、增殖和存活中的應用 2023-8-14
大家好，這里是專注表觀組學十余年，領(lǐng)跑多組學科研服務的易基因。原始生殖細胞（Primordial germ cell，PGC）是生殖細胞前體，可以產(chǎn)生卵母細胞和精子，確保生命延續(xù)。盡管PGC特化（PGC specif
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402 次 ChIP-seq等揭示H3K4me1修飾在蜜蜂級型分化中的表觀遺傳調(diào)控機制 2023-7-18
蜜蜂是一種真社會性昆蟲，是研究社會性昆蟲級型發(fā)育和級型分化的重要模式生物，其分工主要基于級型分化（蜂王(queen)和工蜂(worker)）。分化后，盡管基因組相同，但蜂王和工蜂具有不同的形態(tài)、生
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676 次 染色質(zhì)免疫共沉淀測序ChIP-seq研究成果匯總及DNA-蛋白質(zhì)互作研究思路 2023-6-26
在生物學研究中，DNA與蛋白質(zhì)之間的互作（DNA-Protein Interactions，DPIs）是至關(guān)重要的，參與基因的表達、調(diào)控、復制、重組和修復以及RNA的轉(zhuǎn)運、翻譯和調(diào)控等多個過程，幾乎涉及所有的生命活
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602 次 ChIP-seq等揭示METTL14調(diào)控哺乳動物二價結(jié)構(gòu)域的表觀遺傳機制 2023-6-20
大家好，這里是專注表觀組學十余年，領(lǐng)跑多組學科研服務的易基因。組蛋白及其翻譯后修飾在調(diào)控基因表達和其他染色質(zhì)模板化過程中起著重要作用。組蛋白H3賴氨酸4三甲基化（H3K4me3）和組蛋白H3K2
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509 次 細菌ChIP-seq測序分析在抗生素合成機制研究新進展中的應用 2023-6-12
2023年06月07日，華東理工大學生物工程學院和生物反應器工程國家重點實驗室葉邦策教授和尤迪副教授為共同通訊作者、博士生符瑜為第一作者以“A meet-up of acetyl phosphate and c-di-GMP
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707 次 全基因組ChIP-seq分析揭示細菌轉(zhuǎn)錄因子PhoB的基因內(nèi)結(jié)合位點 2023-5-30
細菌編碼許多轉(zhuǎn)錄因子（transcription factor，TF），這些轉(zhuǎn)錄因子通過與啟動子周圍的DNA結(jié)合并調(diào)控RNA聚合酶（RNAP）全酶以結(jié)合啟動子DNA或異構(gòu)化為主動轉(zhuǎn)錄構(gòu)象的能力來調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄起始。目前對T
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674 次 ChIP-seq等揭示熱休克轉(zhuǎn)錄因子A1b調(diào)控植物高溫脅迫響應的分子機制 2023-4-24
在擬南芥中，熱休克轉(zhuǎn)錄因子A1b（HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b，HSFA1b）通過影響種子產(chǎn)量來調(diào)控對環(huán)境脅迫的抗性。HSFA1b是生殖適應性的決定性因素，這種調(diào)控機制怎么形成的呢？2018年，
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663 次 高通量測序后的下游實驗驗證方法之ChIP-seq介紹 2023-3-28
此前，我們分享了染色質(zhì)免疫共沉淀測序(ChIP-seq）的數(shù)據(jù)挖掘思路，進而篩選出TF結(jié)合/組蛋白修飾的目標區(qū)域和候選靶基因。做完ChIP-seq測序后，如果需要對分析結(jié)果中感興趣的內(nèi)容進行后期驗證，
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1006 次 染色質(zhì)免疫共沉淀測序(ChIP-seq）的數(shù)據(jù)挖掘思路 2023-3-27
CHIP-seq研究的數(shù)據(jù)挖掘思路主要分為3步：1. 整體把握CHIP-seq圖譜特征：peak/reads在基因組上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距離TSS位點的距離分
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201 次 DAP-seq技術(shù)助力胡楊耐鹽機制的研究 2020-4-21
2019年9月，北京林業(yè)大學和藍景科信合作，在植物學主流學術(shù)期刊Journal of Experimental Botany上（IF=5.36），發(fā)表了題為“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase
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