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ACE等揭示產(chǎn)前不良環(huán)境暴露通過DNA羥甲基化變化介導子代自閉癥

瀏覽次數(shù):413 發(fā)布日期:2024-9-11  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負
自閉癥譜系障礙(Autism spectrum disorder,ASD)是一種神經(jīng)發(fā)育障礙,以社交溝通障礙和刻板行為為主要特征。許多研究證明,妊娠期暴露于環(huán)境毒素會導致兒童中ASD患病率快速增長。1-硝基芘(1-Nitropyrene,1-NP)一種主要存在于柴油排放顆粒(DEPs)和烹飪排放中的特征性硝基多環(huán)芳烴(nitro-PAH)。早期報告顯示,妊娠晚期暴露于1-NP(10 µg/kg)與子代青少年學習力和記憶力下降有關(guān)。整個妊娠期暴露于1-NP(10、100 µg/kg)引起了子代成年階段的焦慮樣行為。盡管這些神經(jīng)系統(tǒng)疾病與1-NP暴露有關(guān),但目前尚不清楚母親1-NP暴露是否在子代中誘導自閉癥樣行為。
 
越來越多證據(jù)表明內(nèi)側(cè)前額葉皮層(medial prefrontal cortex,mPFC)中的中間神經(jīng)元在社交溝通調(diào)節(jié)中發(fā)揮關(guān)鍵作用,中間神經(jīng)元遷移遲緩導致小鼠出現(xiàn)自閉癥樣行為。一些研究表明,羥甲基化修飾參與胎盤滋養(yǎng)層細胞和神經(jīng)干細胞遷移。那么產(chǎn)前1-NP暴露是否會通過抑制與中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因的羥甲基化修飾來抑制中間神經(jīng)元遷移呢?
 
2024年5月16日,安徽醫(yī)科大學碩士研究生趙婷為第一作者、合肥工業(yè)大學黃程青博士和安徽醫(yī)科大學張醫(yī)浩副教授為共同第一作者,安徽醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院徐德祥教授為通訊作者、王博副教授為共同通訊在《Advanced Science》(Adv Sci)期刊發(fā)表題為“Prenatal 1-Nitropyrene Exposure Causes Autism-Like Behavior Partially by Altering DNA Hydroxymethylation in Developing Brain”的研究論文,研究通過APOBEC-coupled epigenetic sequencing(ACE-seq)和RNA-seq多組學分析揭示了母體孕期1-NP暴露會通過改變發(fā)育大腦中與中間神經(jīng)元遷移相關(guān)的DNA羥甲基化調(diào)控下游基因表達,進而介導子代出現(xiàn)自閉癥樣行為表型。此外,研究還表明補充α-酮戊二酸(α-KG,TET酶的輔因子),可以逆轉(zhuǎn)1-NP誘導的中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因特定位點的低羥甲基化,緩解中間神經(jīng)元遷移延遲并改善由1-NP引起的自閉癥。

 

標題:Prenatal 1-Nitropyrene Exposure Causes Autism-Like Behavior Partially by Altering DNA Hydroxymethylation in Developing Brain(產(chǎn)前1-硝基芘暴露通過腦發(fā)育過程中DNA羥甲基化變化誘導子代自閉癥樣行為)
期刊:Advanced Science
影響因子:IF 14.3 / Q1
技術(shù)平臺:ACE-seq(易基因優(yōu)勢技術(shù))、RNA-seq、行為評估、細胞功能分析等

研究摘要:
本研究旨在研究產(chǎn)前暴露于1-硝基芘(1-NP)對小鼠模型中自閉癥樣行為的影響。三室社交互動測試結(jié)果表明,產(chǎn)前1-NP暴露在斷奶期間引起自閉癥樣行為。膜片鉗技術(shù)顯示,在1-NP暴露的斷奶幼崽內(nèi)側(cè)前額葉皮層中的抑制性突觸傳遞減少。免疫熒光顯示,產(chǎn)前1-NP暴露減少了胎兒和斷奶幼崽前額葉中谷氨酸脫羧酶67(GAD67)陽性的中間神經(jīng)元數(shù)量。此外,產(chǎn)前1-NP暴露導致GAD67陽性中間神經(jīng)元遷移延遲,并下調(diào)胎兒前腦與中間神經(jīng)元遷移相關(guān)的基因,如Nrg1、Erbb4和Sema3F。從機制上講,產(chǎn)前1-NP暴露通過抑制胎兒前腦中的TET活性,以誘導中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因的羥甲基化降低。補充α-KG(TET酶輔因子)可以逆轉(zhuǎn)1-NP誘導的中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因特定位點的低羥甲基化。實驗結(jié)果表明,α-KG補充劑緩解了胎兒前腦中1-NP誘導的中間神經(jīng)元遷移延遲;母體α-KG補充劑改善了斷奶子代中1-NP誘導的自閉癥樣行為?傊,產(chǎn)前1-NP暴露可以通過發(fā)育中大腦中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因的DNA羥甲基化變化,而引起自閉癥樣行為。
 
實驗設計:
30只懷孕小鼠隨機分為3組,分別給予不同劑量的1-NP(0、10、100μg/kg);后續(xù)實驗懷孕小鼠分為不同的處理組:對照組、1-NP暴露組、α-KG補充組以及1-NP+α-KG聯(lián)合組。產(chǎn)前在指定時間點收集胎兒前腦樣本;產(chǎn)后在指定時間點收集子代前額葉皮質(zhì)(mPFC)樣本。用于后續(xù)的行為評估、DNA羥甲基化檢測(ACE-seq)、TET酶活性檢測、α-KG水平檢測、RNA測序(RNA-seq)與RT-PCR驗證、細胞功能分析等實驗。

 

圖1:動物和處理的實驗方案
 
結(jié)果圖形:
(1)母體 1-NP 暴露對子代自閉癥樣行為的影響
圖2:母體1-NP暴露對斷奶子代自閉癥樣行為的影響。30只懷孕小鼠從妊娠第0天(GD0)到第17天(GD17)每天口服接受不同劑量的1-NP(0,10, 100 µg/kg)。所有懷孕的小鼠都自然分娩。

A–F) 使用三室社交互動測試來評估斷奶子代(PND28)的自閉癥樣行為。
G–L) 使用三室社交互動測試來評估成年子代(PND70)的自閉癥樣行為。
 
(2)母體1-NP暴露對子代mPFC中微小抑制性后神經(jīng)突觸電流(miniature inhibitory postsynaptic current,mIPSC)的影響

 

圖3:母體1-NP暴露對子代mIPSC的影響。

 
A–F) 對斷奶子代(PND28)的興奮性神經(jīng)元進行膜片鉗實驗,以檢測前額葉皮層(mPFC)中的微小抑制性突觸后電流(mIPSC)。
G–L) 對成年子代(PND70)的興奮性神經(jīng)元進行膜片鉗實驗,以測量mPFC中的mIPSC每組樣本量(N)為3只小鼠的12個興奮性神經(jīng)元。
 
(3)孕期母體1-NP暴露對斷奶子代mPFC中GAD67+中間神經(jīng)元的影響

圖4:母體1-NP暴露對斷奶子代GAD67中間神經(jīng)元的影響。

 
A–G) 雄性子代在PND28被安樂死,并且采集其前額葉皮層(mPFC)。
A-B.   Western blot檢測GAD67。
C-D.   Western blot檢測NeuN。
E.   免疫熒光(IF)分析mPFC各個亞區(qū)的GAD67+和NeuN+神經(jīng)元。
F.    mPFC各個亞區(qū)中GAD67+與NeuN+神經(jīng)元的比例。
G.   mPFC各個亞區(qū)中NeuN+神經(jīng)元的百分比。
H–N) 雌性子代在PND28被安樂死,并且收集其mPFC。
H-I.  Western blot檢測GAD67。
J-K.  Western blot檢測NeuN。
L.   免疫熒光分析mPFC各個亞區(qū)的GAD67+和NeuN+神經(jīng)元。
M.   mPFC各個亞區(qū)中GAD67+與NeuN+神經(jīng)元的比例。
N.   mPFC各個亞區(qū)中NeuN+神經(jīng)元的百分比。
Cg1:cingulate cortex, area 1;PrL:prelimbic cortex;IL:infralimbic cortex。
 
(4)妊娠期1-NP 暴露對胎兒前腦中間神經(jīng)元遷移的影響

 

圖5:妊娠期1-NP暴露對胎兒大腦中間神經(jīng)元遷移的影響
 
(5)妊娠期1-NP暴露對胎兒前腦神經(jīng)元遷移相關(guān)基因羥甲基化的影響
在妊娠期第14天(GD14)的胎兒前腦中,分析了妊娠期1-NP暴露對中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因中5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)含量的影響。Nrg1、Erbb4和Sema3F基因的甲基化位點序列(圖6A),盡管Nrg1和Erbb4基因中富含CpG片段的5hmC水平在兩組間沒有差異,但在1-NP暴露的胎兒中,Sema3F基因的一個富集CpG片段的5hmC水平有所降低(圖6B)。隨后檢測了Nrg1、Erbb4和Sema3F基因CpG位點的5hmC含量(圖6C),在1-NP組胎兒前腦中,Nrg1基因的CpG位點(chr1:32009246)的5hmC含量減少。在1-NP組胎兒前腦中,Erbb4基因的兩個CpG位點(chr8: 69107743和69107866)的5hmC含量減少。而在1-NP組胎兒中,Sema3F基因的三個CpG位點(chr9: 107709269、107709348和107710238)的5hmC水平降低。在胎兒前腦中分析了三種DNA去甲基化酶TET1、TET2和TET3的活性。盡管1-NP并未影響TET1、TET2和TET3的表達(圖6D–F),但在1-NP組胎兒的前腦中,TETs酶的活性降低(圖6G)。

 

圖6:妊娠1-NP暴露對胎兒前腦中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因羥甲基化的影響。
 
(6)妊娠期1-NP暴露對胎兒前腦線粒體功能的影響
為研究1-NP暴露導致胎兒前腦中與中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因的羥甲基化變化以及抑制TET酶活性的原因,研究對妊娠第14天(GD14)的胎兒前腦進行轉(zhuǎn)錄組分析。KEGG和GO分析發(fā)現(xiàn),1-NP導致前腦的線粒體相關(guān)代謝功能出現(xiàn)障礙,例如煙酸/煙酰胺代謝、類固醇生物合成和長鏈脂肪酸代謝(圖7A、B)。基于KEGG的基因集富集分析(GSEA)顯示,在1-NP暴露的胎兒前腦中,氧化磷酸化通路呈負向富集(圖7C);贕O的GSEA顯示,在1-NP暴露的胎兒前腦中線粒體電子傳遞鏈和氧化磷酸化通路呈負向富集(圖7D,E)。基于Reactome的GSEA顯示,三羧酸(TCA)循環(huán)和呼吸電子傳遞在1-NP暴露的胎兒前腦中呈負向富集(圖7F)。盡管線粒體面積沒有差異,但在1-NP暴露的胎兒前腦中,中間神經(jīng)元起源地神經(jīng)節(jié)隆起的線粒體嵴結(jié)構(gòu)消失(圖7G–I)。琥珀酸脫氫酶(SDH)B和vATP5A(兩種與氧化磷酸化相關(guān)的蛋白)在1-NP誘導的胎兒前腦中下調(diào)(圖7J–L)。最后線粒體α-酮戊二酸(α-KG)合成的關(guān)鍵酶IDH2和TET酶的輔因子α-KG,在1-NP組的胎兒前腦中減少(圖7M–O)。

 

圖7:妊娠期1-NP暴露對胎兒前腦線粒體功能的影響。
 
(7)補充α-KG對胎兒前腦中1-NP誘發(fā)的神經(jīng)元遷移相關(guān)基因低羥甲基化的影響
補充α-KG對1-NP引起的中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因低羥甲基化的影響(圖8A-F)。正如預期,妊娠期間補充α-KG抑制了1-NP引起的Nrg1基因中CpG位點(chr1: 32009246)的5hmC減少(圖8A)。此外,妊娠期間補充α-KG預防了1-NP引起的Sema3F基因一個CpG位點(chr9:107710238)的5hmC減少(圖8F)。補充α-KG可以保護1-NP誘導的Erbb4或其他Sema3F基因CpG位點的5hmC減少趨勢(圖8B–E)。分析α-KG對1-NP引起的中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因表達減少的影響(圖8G–I),結(jié)果表明,妊娠期間補充α-KG緩解了1-NP在胎兒前腦中引起的Sema3F、Nrg1和Erbb4減少(圖8G–I)。α-KG補充對1-NP引起的神經(jīng)元間遷移抑制的影響(圖8J、K)結(jié)果表明,妊娠期補充 α-KG 逆轉(zhuǎn)了 1-NP 導致前腦皮層中端和遠端 GAD67 中間神經(jīng)元減少。

 

 
圖8:補充α-KG對1-NP誘發(fā)的胎兒前腦中間神經(jīng)元遷移相關(guān)基因的低羥基甲基化和中間神經(jīng)元遷移抑制的影響
 
(8)補充α-KG對1-NP誘導的中間神經(jīng)元遷移抑制的影響

圖9:妊娠期補充𝛼-KG對斷奶子代中間神經(jīng)元的影響
 
(9)補充α-KG對1-NP誘導的子代mIPSC傳遞障礙和自閉癥樣行為的影響

 

圖10:妊娠期補充𝛼-KG對1-NP誘導mIPSC傳遞障礙和自閉癥樣行為的影響
 
易小結(jié)
本研究利用小鼠模型進行實驗,將懷孕小鼠分為不同劑量的1-NP暴露組。通過三室測試評估幼崽的ASD樣行為;使用膜片鉗技術(shù)檢測小鼠大腦前額葉皮層的抑制性突觸傳遞;通過免疫熒光技術(shù)檢測特定腦區(qū)的神經(jīng)元數(shù)量和遷移;利用ACE-seq和RNA-seq檢測與神經(jīng)元遷移相關(guān)的基因表達和DNA羥甲基化水平;最后通過補充α-酮戊二酸(𝛼-KG)來研究其對1-NP誘導的效應的逆轉(zhuǎn)作用。

研究結(jié)果揭示了產(chǎn)前1-NP暴露導致斷奶期小鼠出現(xiàn)ASD樣行為。1-NP暴露減少了小鼠大腦前額葉皮層中抑制性突觸傳遞;減少了胎兒和斷奶幼崽前額葉中的谷氨酸脫羧酶67(GAD67)陽性神經(jīng)元數(shù)量;延緩了GAD67陽性神經(jīng)元的遷移,并下調(diào)了與神經(jīng)元遷移相關(guān)的基因表達;通過抑制TET酶活性降低了特定基因的羥甲基化水平。補充𝛼-KG能夠逆轉(zhuǎn)1-NP誘導的羥甲基化降低,并改善神經(jīng)元遷移延遲。母體補充𝛼-KG能夠改善1-NP誘導的幼崽ASD樣行為。

總之,本研究結(jié)果表明,產(chǎn)前1-NP暴露通過改變發(fā)育中大腦內(nèi)神經(jīng)元遷移相關(guān)基因的DNA羥甲基化,部分導致了ASD樣行為。𝛼-KG補充可能是一種用于減輕環(huán)境毒素引起的神經(jīng)發(fā)育障礙的潛在干預措施。本研究提供了關(guān)于環(huán)境污染物如何可能影響神經(jīng)發(fā)育和行為的新見解,并為預防和治療相關(guān)的神經(jīng)發(fā)育障礙提供了可能的策略。

參考文獻:
Zhao T, Huang CQ, Zhang YH, Zhu YY, Chen XX, Wang T, Shao J, Meng XH, Huang Y, Wang H, Wang HL, Wang B, Xu DX. Prenatal 1-Nitropyrene Exposure Causes Autism-Like Behavior Partially by Altering DNA Hydroxymethylation in Developing Brain. Adv Sci (Weinh). 2024 May 16:e2306294. doi: 10.1002/advs.202306294. PubMed PMID: 38757379.
來源:深圳市易基因科技有限公司
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標簽: DNA甲基化
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