Innopsys熒光掃描儀在單細胞western blots檢測中的應(yīng)用
瀏覽次數(shù):1074 發(fā)布日期:2023-5-8
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細胞是生命體最小的組成單位,蛋白質(zhì)是生命活動的執(zhí)行者,而細胞內(nèi)蛋白質(zhì)豐度的變化對各種生命過程有著至關(guān)重要的作用,不僅為生命活動提供物質(zhì)基礎(chǔ),也是理解細胞功能和發(fā)展過程的中心環(huán)節(jié)。細胞在生長過程中,經(jīng)過多次分裂增殖,在完成其生命周期的同時也會呈現(xiàn)分子生物學(xué)或基因方面的改變,從而產(chǎn)生細胞多樣性即細胞異質(zhì)性,這是一種普遍存在的生物學(xué)現(xiàn)象,即使看起來相同的細胞,也可能存在顯著的差異。而傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)組學(xué)是對組織或大量細胞樣本進行分析,獲得的是均質(zhì)化后的結(jié)果,掩蓋了單個細胞的個體差異,而在組織、器官或個體中,細胞具有非常大的異質(zhì)性,傳統(tǒng)的研究方法不能完全衡量細胞的復(fù)雜性、多樣性以及功能差異。同時基于流式的檢測技術(shù),由于很難檢測細胞胞內(nèi)的蛋白水平以及抗體來源受限,使得這一方法有一定的局限性。
隨著測序技術(shù)的發(fā)展,生命科學(xué)研究早已進入了單細胞時代,在mRNA水平已經(jīng)可以很好的從單細胞的維度上探究細胞、組織、器官的發(fā)育過程以及與疾病相關(guān)的細胞異質(zhì)性和同質(zhì)性問題。但由于基因轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平相關(guān)性并不是很高,也不能完全反映蛋白質(zhì)的調(diào)控作用,所以要更好地理解細胞的調(diào)控機制,檢測效應(yīng)分子蛋白質(zhì)比mRNA更直接有效,對于理解細胞的功能更為重要。近幾年,基于單細胞蛋白質(zhì)組技術(shù)的方法快速發(fā)展,在很大程度上彌補了單細胞水平蛋白質(zhì)研究的需求。
本文主要介紹一種單細胞蛋白免疫印跡檢測技術(shù)(Single cell Westerns Blotting, scWesterns),是對傳統(tǒng)的蛋白免疫印跡(Western blotting)方法的精細化改進,實現(xiàn)了在單細胞層面上高通量的對于單細胞蛋白質(zhì)組進行免疫印跡檢測、定量和分析,與傳統(tǒng)的western blots不同,scWesterns方法可以精確量化由外界刺激所引起的單個細胞蛋白質(zhì)水平的變化。系統(tǒng)組成:scWesterns 檢測試劑、全自動電泳分離系統(tǒng)、數(shù)據(jù)處理軟件以及Innopsys芯片掃描儀,檢測流程如圖(一)所示。scWesterns實驗整個過程都是在改造的顯微鏡載玻片上進行的,載玻片上有通過軟光刻技術(shù)制作而成的可以固定單個細胞的凝膠槽矩陣,每個微孔都可以看作是一個微型的反應(yīng)器,對細胞矩陣進行明場光學(xué)掃描之后,將凝膠槽轉(zhuǎn)移至微型電泳槽中,進行蛋白凝膠電泳。整個技術(shù)可以實現(xiàn)高通量的對單細胞蛋白進行scWesterns檢測和分析。
操作流程圖一:1.解凍細胞,吹打混勻,離心重懸制備細胞懸液,細胞濃度為 10,000 - 100,000 個細胞/mL,種植細胞,將 1 mL 單細胞懸液從左到右滴加到芯片上,確保整張芯片都被均勻覆蓋,細胞在重力的作用下會沉降到光敏膠中,室溫靜置 5-20 分鐘,用明場顯微鏡觀察芯片,確保每個block至少有15%-20%細胞占有率,且很少存在單孔雙細胞的狀態(tài);2.在儀器電泳槽中加入300uL裂解液進行細胞裂解,根據(jù)蛋白大小設(shè)置參數(shù)運行儀器進行電泳分離和蛋白固定;3.稀釋不同種屬的一抗(小鼠,山羊,兔)與芯片進行雜交,室溫孵育 1-2小時,也可4度過夜,孵育后用wash buffer清洗三次,每次10分鐘;稀釋二抗,芯片避光與二抗孵育1小時,孵育后用wash buffer清洗三次,每次10分鐘,最后用去離子水連續(xù)沖洗芯片1分鐘;4.使用Innopsys 1100三色熒光掃描儀(紅、綠、藍)進行熒光信號掃描;5-6.使用分析軟件進行數(shù)據(jù)處理和分析。
結(jié)果顯示:采用scWesterns技術(shù)對單細胞進行四個靶蛋白檢測,如圖二所示,根據(jù)不同蛋白分子量的差異以及雜交不同種屬的一抗和熒光二抗來區(qū)分不同的靶標蛋白,使用Innopsys 1100對紅、綠、藍三種熒光信號進行檢測,發(fā)現(xiàn)細胞對刺激產(chǎn)生了ERK應(yīng)答反應(yīng),同時檢測到了EGFR表皮生長因子受體、以及突變體L858R。
圖二:對紅,綠,藍不同熒光標記的目的蛋白(ERK,EGFR,L858R,Tubulin)進行檢測,結(jié)果如上圖所示。
展望:scWesterns技術(shù)可以應(yīng)用于基礎(chǔ)研究和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,包括腫瘤細胞:腫瘤的耐藥基礎(chǔ)研究,惡性腫瘤標志物發(fā)現(xiàn);免疫細胞:機體免疫狀態(tài)分析以及免疫應(yīng)答基礎(chǔ)研究;干細胞:干細胞分化發(fā)育研究,精準控制干細胞分化發(fā)育;藥物研發(fā):量化細胞對藥物制劑的反應(yīng)。
Innopsys 成立于1999年?偛课挥诜▏,一直致力于生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域相關(guān)儀器和軟件的自主研發(fā)和生產(chǎn)。Innoscan系列掃描儀,采用先進的共聚焦PMT檢測器和多激光掃描光路,可以同時進行多通道熒光檢測。不僅有效降低了熒光光漂白現(xiàn)象以及信號損失,還可以有效縮短掃描時間。在基因組和蛋白組表達,基因突變,SNP檢測,CGH,細菌病毒檢測,腫瘤特異性標志篩查,病理組織篩查等方面都有非常廣泛的應(yīng)用。
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