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應(yīng)用案例:近期肝病相關(guān)研究成果

瀏覽次數(shù):2239 發(fā)布日期:2022-11-28  來源:麥特繪譜

截至2022年9月,麥特繪譜已協(xié)助客戶發(fā)表肝病相關(guān)研究SCI文章30余篇,涵蓋脂肪肝、肝細(xì)胞癌、肝母細(xì)胞瘤、原發(fā)性膽管炎、藥物肝損傷、新生兒膽道閉鎖等多個(gè)研究方向。繪譜君按照上述研究方向整理了其中代表性的文章思路,希望可以為您的科研之路保駕護(hù)航。

一、脂肪肝研究方向

1. 腸道菌群可用于非酒精性脂肪性肝病的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)

文獻(xiàn)名稱:Risk assessment with gut microbiome and metabolite markers in NAFLD development

發(fā)表期刊Science Translational Medicine,IF=19.319

發(fā)表時(shí)間:2022.06

合作單位:上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院、香港大學(xué)、Hans Knöll研究所

樣本類型:大隊(duì)列人的糞便和血清

技術(shù)方法:靶向代謝組學(xué),宏基因組學(xué),機(jī)器學(xué)習(xí)算法等

研究思路:

主要結(jié)果采用巢式病例對(duì)照設(shè)計(jì)進(jìn)行的前瞻性研究。首先,病例組和對(duì)照組在總體菌群構(gòu)成方面并無顯著差異,但兩組與基線已經(jīng)診斷為NAFLD的患者相比卻有顯著差異。同時(shí),在具體的細(xì)菌種屬和功能豐度上,病例組和對(duì)照組呈現(xiàn)出較大不同。其次,病例組的氨基酸水平顯著高于對(duì)照組,并在外部驗(yàn)證集中發(fā)現(xiàn)支鏈氨基酸纈氨酸、芳香氨基酸酪氨酸分別與谷丙轉(zhuǎn)氨酶和谷草轉(zhuǎn)氨酶相關(guān),提示氨基酸代謝紊亂與NAFLD及NASH的發(fā)病機(jī)制有關(guān)。通過機(jī)器學(xué)習(xí)算法構(gòu)建NAFLD的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型,確定了在未來數(shù)年內(nèi)存在NAFLD風(fēng)險(xiǎn)的受試者的微生物組特征。

2. 金絲桃甙通過膽固醇代謝和膽汁酸代謝降低大鼠非酒精性脂肪性肝病

文獻(xiàn)名稱:Hyperoside attenuates non-alcoholic fatty liver disease in rats via cholesterol metabolism and bile acid metabolism

發(fā)表期刊Journal of Advanced Research,IF= 10.479

發(fā)表時(shí)間:2021.06

合作單位:澳門大學(xué)

樣本類型:大鼠肝臟

技術(shù)方法:靶向代謝組學(xué),Label-free蛋白質(zhì)組學(xué)等

研究思路:

1)大鼠分組設(shè)計(jì):正常飲食組,高脂飲食組,高脂飲食+低劑量金絲桃甙(0.6 mg/kg/day),高脂飲食+高劑量金絲桃甙(1.5 mg/kg/day)

2)肝臟蛋白質(zhì)組學(xué)分析蛋白表達(dá)差異

3)肝臟代謝組學(xué)分析膽汁酸水平變化

主要結(jié)果:金絲桃甙處理導(dǎo)致與脂肪酸降解途徑、膽固醇代謝途徑和膽汁分泌途徑相關(guān)的幾個(gè)蛋白發(fā)生改變,包括ECI1、Acnat2、ApoE和BSEP等,且大鼠肝臟中核受體,包括法尼醇X受體(FXR)和肝X受體α(LXRα)的表達(dá)增加,伴隨肝臟新生脂肪生成中催化酶的蛋白表達(dá)減少,經(jīng)典和替代途徑膽汁酸(BA)合成酶的蛋白水平增加。金絲桃甙可降低肝臟非結(jié)合BAs水平,增加結(jié)合BAs水平,而結(jié)合型BAs比非結(jié)合型BAs毒性小且更親水。因此金絲桃甙可通過調(diào)節(jié)膽固醇代謝及BAs代謝和排泄來改善NAFLD。

3. 雙陰性T細(xì)胞在非酒精性脂肪性肝病中的作用機(jī)制研究

文獻(xiàn)名稱:The Critical and Diverse Roles of CD4–CD8– Double Negative T Cells in Nonalcoholic Fatty Liver Disease

發(fā)表期刊Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology,IF=8.879

發(fā)表時(shí)間:2022.03

合作單位:首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京友誼醫(yī)院

樣本類型:小鼠肝臟

技術(shù)方法:靶向代謝組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué),流式細(xì)胞術(shù)等

研究思路:

1)構(gòu)建NAFLD模型小鼠,進(jìn)行流式細(xì)胞術(shù)分析

2)探究雙陰性T(DNT)細(xì)胞在NAFLD進(jìn)展過程中的作用并進(jìn)行驗(yàn)證

3)靶向代謝組學(xué)分析代謝物的變化

4)通過NAFLD患者和健康人肝活檢樣本分析進(jìn)一步驗(yàn)證

主要結(jié)果:NAFLD進(jìn)展過程中,TCRγδ+ DNT細(xì)胞促進(jìn)IL17A的分泌,加重肝臟炎癥,而TCRαβ+ DNT細(xì)胞減少顆粒酶B(GZMB)的產(chǎn)生,導(dǎo)致免疫調(diào)節(jié)功能減弱。此外,有害脂肪酸二十二碳四烯酸(ADA,Adrenic acid)和花生四烯酸(AA,Arachidonic acid)可誘導(dǎo)TCRαβ+ DNT細(xì)胞凋亡,抑制其免疫抑制功能和AKT通路活性;而AA則促進(jìn)了TCRγδ+ DNT細(xì)胞分泌白細(xì)胞介素IL17A,并激活NF-kB信號(hào)通路。最后肝活檢樣本分析證實(shí)了NAFLD患者中TCRαβ+DNT細(xì)胞比例下降,TCRγδ+DNT細(xì)胞比例升高,與NAFLD小鼠的結(jié)論一致。

4. 肝臟膽固醇25-羥化酶減少加劇飲食誘導(dǎo)的脂肪變性

文獻(xiàn)名稱:Hepatic Reduction in Cholesterol 25-Hydroxylase Aggravates

Diet-induced Steatosis

發(fā)表期刊Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology,IF=8.879

發(fā)表時(shí)間:2022.01

合作單位:西安交通大學(xué)

樣本類型:小鼠肝臟、糞便和血漿,大鼠肝臟

技術(shù)方法:靶向代謝組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué),qPCR,免疫印跡等

研究思路:

1)首先分析NAFLD小鼠和大鼠模型中Ch25h水平是否發(fā)生改變

2)敲除Ch25h(Ch25h-/-)對(duì)高脂飲食(HFD)小鼠肝臟的影響

3)小鼠肝臟轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析Ch25h缺失引起的基因表達(dá)變化

4)進(jìn)一步分析Ch25h過表達(dá)是否緩解NAFLD

5)肝臟和糞便代謝組學(xué)分析Ch25h過表達(dá)對(duì)膽汁酸合成與分泌的影響

6)功能驗(yàn)證,外源添加25-羥膽固醇(25-HC)對(duì)NAFLD的緩解作用

主要結(jié)果:肥胖型小鼠和大鼠肝臟中Ch25h水平降低。HFD飼喂的Ch25h-/-小鼠脂肪肝加重,CYP7A1水平降低,并且肝臟中差異表達(dá)基因參與脂質(zhì)代謝的正向調(diào)控、類固醇代謝、膽固醇代謝和膽汁酸生物合成。或外源添加25-HC可緩解NAFLD,同時(shí)Ch25h過表達(dá)顯著提高初級(jí)、次級(jí)膽汁酸和CYP7A1的水平,但降低小異源二聚體伴侶受體和FGFR4的水平。因此,Ch25h及其酶促產(chǎn)物25-HC的升高可通過調(diào)節(jié)膽汁酸的腸肝循環(huán)緩解HFD誘導(dǎo)的肝臟脂肪變性,其潛在機(jī)制是25-HC激活肝X受體-CYP7A1通路。

5. S100A11通過FOXO1介導(dǎo)的自噬和脂肪生成促進(jìn)肝臟脂肪變性

文獻(xiàn)名稱:S100A11 Promotes Liver Steatosis via FOXO1-Mediated Autophagy and Lipogenesis

發(fā)表期刊Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology,IF=7.076

發(fā)表時(shí)間:2020.10

合作單位:云南大學(xué)

樣本類型:樹鼩肝臟,小鼠肝臟,細(xì)胞

相關(guān)技術(shù):脂質(zhì)組學(xué),蛋白質(zhì)組學(xué),CRISPR/Cas9,RNA測(cè)序等

研究思路:

1)  樹鼩肝臟、小鼠肝臟及細(xì)胞模型蛋白質(zhì)組學(xué)分析S100A11的表達(dá)

2)  小鼠肝臟、細(xì)胞模型過表達(dá)S100A11的影響

3)  脂質(zhì)組學(xué)分析體內(nèi)外S100A11過表達(dá)導(dǎo)致的脂質(zhì)合成變化

4)  探究S100A11通過激活脂肪生成參與脂質(zhì)積累的潛在機(jī)制

5)  功能驗(yàn)證:抑制FOXO1和自噬或刪除Dgat2可緩解S100A11誘導(dǎo)的脂質(zhì)積累

主要結(jié)果:首先,研究人員在NAFLD動(dòng)物模型和油酸處理的肝細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)S100A11表達(dá)明顯上調(diào),此外,體內(nèi)外S100A11過表達(dá)均可誘導(dǎo)肝脂質(zhì)積累機(jī)制上,S100A11過表達(dá)通過上調(diào)和乙酰化轉(zhuǎn)錄因子FOXO1激活自噬和脂肪生成過程,從而促進(jìn)體內(nèi)外脂肪生成和脂質(zhì)積累。S100A11可能與HDAC6(FOXO1去乙;福┫嗷プ饔,阻斷其與FOXO1的結(jié)合,釋放或增加FOXO1的乙;,從而激活自噬和脂肪生成,加速脂質(zhì)積累和肝臟脂肪變性,揭示了S100A11-HDAC6-FOXO1軸調(diào)節(jié)自噬和肝臟脂肪變性的全新作用,為NAFLD治療提供了新方向。

二、肝癌研究方向

6. PGC1α抑制肝癌轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制研究

文獻(xiàn)名稱:PGC1α suppresses metastasis of HCC by inhibiting Warburg effect via PPARγ-dependent WNT/β-catenin/PDK1 axis

發(fā)表期刊Hepatology,IF=14.679

發(fā)表時(shí)間:2020.04

合作單位:上海交通大學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院

樣本類型:人的肝癌組織和非肝癌組織,細(xì)胞,小鼠皮下瘤

技術(shù)方法:非靶向代謝組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué),RT-PCR,Western blot,免疫組化等

研究思路:

1)分析隊(duì)列中肝癌患者的PGC1α表達(dá)水平及其臨床意義

2)構(gòu)建PGC1α過表達(dá)/沉默細(xì)胞系,探討PGC1α在肝癌細(xì)胞中的生物學(xué)功能,對(duì)裸鼠尾靜脈注射建立肺轉(zhuǎn)移模型,體內(nèi)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證

3)代謝組學(xué)分析肝癌細(xì)胞和異種移植物的代謝變化

4)進(jìn)一步探討PGC1α調(diào)節(jié)有氧糖酵解的機(jī)制,糖酵解酶的mRNA水平,丙酮酸脫氫酶激酶PDK1的作用

5)轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析PGC1α對(duì)PDK1的抑制機(jī)制,WNT/β-catenin信號(hào)通路

6)探討PPARγ在PGC1α誘導(dǎo)的WNT/β-catenin信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)抑制和抗Warburg效應(yīng)中的功能

7)探討PDK1在HCC中的預(yù)后價(jià)值

主要結(jié)果:首先觀察到PGC1α在人類肝細(xì)胞癌中表達(dá)下調(diào),低水平的PGC1α表達(dá)與較差的存活率、血管侵犯和較大的腫瘤相關(guān)。在體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)PGC1α均抑制肝癌細(xì)胞的遷移和侵襲。進(jìn)一步聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)分析發(fā)現(xiàn),PGC1α通過WNT/β-catenin途徑介導(dǎo)的丙酮酸脫氫酶激酶同工酶1(PDK1)的下調(diào)抑制了Warburg效應(yīng),并且PPARγ的激活介導(dǎo)了PGC1α對(duì)WNT/β-catenin途徑的抑制。綜上,PGC1α表達(dá)水平下調(diào)預(yù)示著肝細(xì)胞癌患者預(yù)后不良,PGC1α通過調(diào)節(jié)WNT/β-catenin/PDK1軸抑制有氧糖酵解來抑制肝癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移,PGC1α發(fā)揮此功能依賴PPARγ。

7. 環(huán)狀circRNA調(diào)控肝母細(xì)胞瘤發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制

文獻(xiàn)名稱:CircHMGCS1 promotes hepatoblastoma cell proliferation by regulating the IGF signaling pathway and glutaminolysis

發(fā)表期刊Theranostics,IF=8.063

發(fā)表時(shí)間:2019.01

合作單位:上海第十人民醫(yī)院

樣本類型:HB組織和正常肝組織,細(xì)胞,小鼠腫瘤組織

技術(shù)方法:非靶向代謝組學(xué),circRNA測(cè)序,qRT-PCR等

研究思路:

1)分析肝母細(xì)胞瘤(HB)組織中circRNA的表達(dá)譜

2)CircHMGCS1(3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A合酶1)的表達(dá)水平及臨床意義

3)CircHMGCS1在HB細(xì)胞和HB小鼠模型中的作用

4)HB細(xì)胞代謝組學(xué)分析CircHMGCS的代謝調(diào)控,谷氨酰胺代謝

5)深入探討CircHMGCS的作用機(jī)制

主要結(jié)果 研究發(fā)現(xiàn)人肝母細(xì)胞瘤組織中circHMGCS1顯著上調(diào)。circHMGCS1高表達(dá)的HB患者總體生存期縮短。敲低circHMGCS1可抑制HB細(xì)胞增殖并誘導(dǎo)凋亡。circHMGCS1通過海綿miR-503-5p作用調(diào)節(jié)IGF和IGF1R的表達(dá),進(jìn)而影響下游的PI3K-Akt信號(hào)通路來調(diào)節(jié)HB細(xì)胞增殖和谷氨酰胺分解。綜上,circHMGCS1/miR-503-5p/IGF-PI3K-Akt軸可調(diào)控HB細(xì)胞的增殖、凋亡和谷氨酰胺分解,提示circHMGCS1是HB患者的潛在治療靶點(diǎn)和預(yù)后標(biāo)志物。

8.抗生素與微生物代謝物可增強(qiáng)Vδ2Vγ9 T細(xì)胞對(duì)肝癌的免疫治療

文獻(xiàn)名稱:Beneficial Effect of Antibiotics and Microbial Metabolites on Expanded Vd2Vg9 T Cells in Hepatocellular Carcinoma Immunotherapy

發(fā)表期刊Frontiers in Immunology,IF=5.085

發(fā)表時(shí)間:2020.07

合作單位:中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院

樣本類型:小鼠糞便和腫瘤組織,肝癌細(xì)胞等

技術(shù)方法:靶向代謝組學(xué),16S rRNA,流式細(xì)胞術(shù)等

研究思路:

1)裸鼠皮下接種腫瘤細(xì)胞構(gòu)建肝癌小鼠模型,小鼠分為四組:對(duì)照組(Ctrl),抗生素處理組(ATB),γδT細(xì)胞治療組(γδT),抗生素與γδT細(xì)胞聯(lián)合治療組(ATB+γδT)

2)分析抗生素處理對(duì)γδT細(xì)胞免疫治療效果的影響

3)16S分析各組腸道菌群結(jié)構(gòu)與組成差異

4)體外驗(yàn)證不同特征的糞便是否直接影響γδT細(xì)胞的功能及增殖

5)菌群相關(guān)代謝物分析,3-吲哚丙酸(IPA)

6)體內(nèi)體外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證IPA對(duì)γδT細(xì)胞毒性的作用

主要結(jié)果:抗生素誘導(dǎo)的菌群失調(diào)增強(qiáng)了小鼠腫瘤治療過程中γδT細(xì)胞的療效。進(jìn)一步菌群和代謝物分析表明,γδT細(xì)胞毒性的改變可能與腸道細(xì)菌產(chǎn)生的特定代謝物密切相關(guān),這些代謝物刺激γδT細(xì)胞釋放更多的細(xì)胞毒性細(xì)胞因子,如顆粒酶B和穿孔素。其中IPA在抗生素處理小鼠體內(nèi)濃度最高,可提高γδT細(xì)胞的體內(nèi)外殺傷能力。該研究確定了腸道菌群如何影響γδT細(xì)胞的抗腫瘤能力,并確定了連接腸道菌群和γδT細(xì)胞的潛在中間分子。

三、原發(fā)性膽汁性膽管炎

9.腸道菌群參與膽汁酸螯合劑對(duì)黃疸型原發(fā)性膽汁性膽管炎的治療作用

文獻(xiàn)名稱:Alterations in microbiota and their metabolites are associated with beneficial effects of bile acid sequestrant on icteric primary biliary Cholangitis

發(fā)表期刊Gut Microbes,IF=10.245

發(fā)表時(shí)間:2021.08

合作單位:上海交通大學(xué)附屬仁濟(jì)醫(yī)院

樣本類型:臨床樣本,人的糞便和血清

相關(guān)技術(shù):靶向代謝組學(xué),宏基因組學(xué)等

研究思路:

主要結(jié)果:對(duì)服用消膽胺(膽汁酸螯合劑)的黃疸型原發(fā)性膽汁性膽管炎(PBC)受試者進(jìn)行16周縱向研究。消膽胺促進(jìn)膽汁酸排泄,特別是脫氧膽酸DCA和石膽酸LCA;并降低血液FGF19水平,提高胰高血糖素樣肽-1水平;毛螺菌科(產(chǎn)SCFAs)的2個(gè)物種增加,羅氏弧菌(觸發(fā)自身免疫)的2個(gè)物種降低。腸道菌群共豐度網(wǎng)絡(luò)分析顯示,SR組與IR組之間存在不同的微生物相互作用模式。對(duì)血清代謝物分析發(fā)現(xiàn)SR組的戊酸和己酸水平顯著升高,這與該組中產(chǎn)SCFAs菌的富集一致。最后膽汁酸、腸道菌群、菌群相關(guān)代謝物和炎癥細(xì)胞因子進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析顯示,SR組中具有多種關(guān)聯(lián),而IR組中較少。

三、藥物性肝損傷

10. 膽汁酸和Omega-6PUFAs可影響藥物性肝損傷進(jìn)展和預(yù)后

文獻(xiàn)名稱:Alteration of Bile Acids and Omega-6 PUFAs Are Correlated With the Progression and Prognosis of Drug-Induced Liver Injury

發(fā)表期刊Frontiers in Immunology,IF=8.786

發(fā)表時(shí)間:2022.04

合作單位:上海交通大學(xué)附屬瑞金醫(yī)院

樣本類型:臨床樣本,人血清、肝組織、糞便

技術(shù)方法:靶向代謝組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué),16S rRNA等

研究思路:

1)納入90名DILI患者和70名健康志愿者;DILI患者按照兩種方式分別分組,DILI恢復(fù)組(DILI.rec)和DILI慢性組(DILI.chr);輕度(Grade 1)、中度(Grade 2)、重度(Grade 3)和肝衰竭(Grade 4)

2)血清靶向代謝組學(xué)分析,膽汁酸(BAs)和多不飽和脂肪酸(PUFAs)

3)基于差異代謝物構(gòu)建DILI嚴(yán)重程度的預(yù)測(cè)模型

4)對(duì)4名DILI患者和3名健康志愿者的肝臟樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

5)對(duì)30名DILI患者和30名健康志愿者的糞便樣本進(jìn)行16S分析

主要結(jié)果: BAs和PUFAs分別與DILI的嚴(yán)重程度和慢性密切相關(guān),DILI患者血清初級(jí)/次級(jí)BAs比值和n-6/n-3PUFAs比值升高。腎上腺酸(AdA)和天冬氨酸(Asp)建立的模型對(duì)預(yù)測(cè)DLIL.chr有較好的效果,AUC達(dá)到0.850。肝臟轉(zhuǎn)錄組學(xué)顯示DILI患者中PUFA過氧化表達(dá)增強(qiáng),BA合成相關(guān)基因表達(dá)被抑制;16S分析顯示DILI患者腸道中乳酸菌和BA轉(zhuǎn)化細(xì)菌增多。此外,DILI患者血清丙二醛(MDA)和成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子19 (FGF19)升高。因此,腸道菌群可能作為負(fù)反饋機(jī)制,分別通過FGF19信號(hào)和PUFA的飽和來維持BAs和PUFAs的穩(wěn)態(tài)。

11. 血清;悄懰崴脚c藥物性肝損傷嚴(yán)重程度的相關(guān)性研究

文獻(xiàn)名稱:A High Serum Level of Taurocholic Acid Is Correlated With

the Severity and Resolution of Drug-induced Liver Injury

發(fā)表期刊Clinical Gastroenterology and Hepatology,IF=8.549

發(fā)表時(shí)間:2020.07

合作單位:首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京友誼醫(yī)院

樣本類型:臨床樣本 人血清、肝活檢樣本

技術(shù)方法:靶向代謝組學(xué),外顯子測(cè)序,免疫組化等

研究思路:

1)納入95名藥物性肝損傷(DILI)患者、100名健康受試者和105名慢性乙肝患者(CHB)

2)收集臨床數(shù)據(jù),檢測(cè)分析生化指標(biāo)

3)血清膽汁酸靶向定量分析,分析血清膽汁酸水平與DILI程度和預(yù)后的關(guān)系

4)ABCB11外顯子測(cè)序與肝活檢樣本免疫組化,分析BA變化與ABCB11基因及其產(chǎn)物(BSEP)表達(dá)的關(guān)系

主要結(jié)果:包括牛磺膽酸(TCA)在內(nèi)的四種膽汁酸水平的變化與膽紅素水平的升高和DILI嚴(yán)重程度相關(guān),也與CHB有關(guān)。其中只有TCA與DILI的臨床恢復(fù)相關(guān),而肝活檢膽小管中較低水平的BSEP與血清膽汁酸水平改變有關(guān)。

12. 抑制VDAC1低聚反應(yīng)保護(hù)線粒體,減輕藥物誘導(dǎo)的急性肝損傷中鐵死亡

文獻(xiàn)名稱:Protecting mitochondria via inhibiting VDAC1 oligomerization alleviates ferroptosis in acetaminophen-induced acute liver injury

發(fā)表期刊Cell Biology and Toxicology,IF=6.691

發(fā)表時(shí)間:2021.08

合作單位:復(fù)旦大學(xué),上海交通大學(xué)

樣本類型:小鼠血清和肝臟,細(xì)胞

技術(shù)方法:靶向代謝組學(xué),脂質(zhì)組學(xué),RT-qPCR,Western blot等

研究思路:

1)體內(nèi)/體外實(shí)驗(yàn)探究鐵死亡在對(duì)乙酰氨基酚誘導(dǎo)的肝損傷(AILI)中的作用

2)Hepa1-6細(xì)胞靶向代謝組學(xué)分析APAP誘導(dǎo)鐵死亡的潛在機(jī)制,聚焦TCA循環(huán)代謝物

3)研究線粒體功能障礙在 APAP 誘導(dǎo)的鐵死亡中的可能作用,VDAC1 寡聚化抑制劑 VBIT-12或鐵死亡抑制劑Fer-1處理小鼠原代肝細(xì)胞(PMH)

4)小鼠肝臟非靶向脂質(zhì)組學(xué)分析鐵死亡抑制劑和VBIT-12對(duì)AILI的影響,心磷脂(CL)和神經(jīng)酰胺(CER)

5)驗(yàn)證CL合成酶TAZ和CER合成酶SMPD1是否會(huì)影響AILI,敲低或過表達(dá)Smpd1 和 Taz

6)臨床驗(yàn)證,對(duì)DILI患者和其他肝病患者的穿刺肝臟組織進(jìn)行免疫組化分析,檢測(cè)4-羥基壬烯醛 (4-HNE)蛋白的加合物水平

主要結(jié)果:鐵死亡是 APAP 誘導(dǎo)的體內(nèi)和體外肝細(xì)胞死亡的原因。TCA 循環(huán)和脂肪酸β-氧化抑制相關(guān)的線粒體功能障礙引起能量生成受損,可能會(huì)導(dǎo)致 APAP誘導(dǎo)的鐵死亡。通過電壓依賴性陰離子通道1(VDAC1)抑制劑 VBIT-12 保護(hù)線粒體在體內(nèi)和體外減輕了APAP 誘導(dǎo)的鐵死亡。在APAP 誘導(dǎo)的肝細(xì)胞鐵死亡中,F(xiàn)er-1和 VBIT-12 增強(qiáng)了CER 和 CL。敲低負(fù)責(zé) CER 和 CL 合成的 Smpd1 和 Taz或過表達(dá)Taz,結(jié)果表明抑制 VDAC1寡聚化可保護(hù)線粒體并通過增加 AILI 中的 CER 和 CL 水平來減輕隨后的鐵死亡。與其他肝病患者相比,DILI 患者肝臟樣本中脂質(zhì)過氧化指示劑 4-HNE 蛋白的加合物水平升高。

五、新生兒膽道閉鎖

13. 膽道閉鎖患兒的腸道菌群與膽汁酸譜分析

文獻(xiàn)名稱:Comprehensive Analysis of Gut Microbiota and Fecal Bile Acid Profiles in Children With Biliary Atresia

發(fā)表期刊Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, IF=6.074

發(fā)表時(shí)間:2022.06

合作單位:首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院

樣本類型:臨床樣本,人的糞便

技術(shù)方法:靶向代謝組學(xué),16S rRNA等

研究思路:

1)納入46名膽道閉鎖患兒和38名健康對(duì)照,收集糞便樣本

2)糞便16S rRNA分析腸道菌群變化

3)糞便膽汁酸定量分析膽汁酸譜變化

4)關(guān)聯(lián)分析

主要結(jié)果:膽道閉鎖患者的腸道菌群整體結(jié)構(gòu)與對(duì)照組有顯著差異,并伴隨著膽汁酸(BAs)譜的改變。無膽管炎患者的Actinobacillus、MonoglobusAgathobacter富集,Selenomonadaceae 和Megamonas在非復(fù)發(fā)性膽管炎患者中更豐富,而Lachnospiraceae 和Ruminococcaceae在復(fù)發(fā)性膽管炎患者中富集;膽道閉鎖組初級(jí)BAs水平下調(diào),而膽固醇代謝中間產(chǎn)物C4上調(diào)。關(guān)聯(lián)分析顯示術(shù)后黃疸清除與CampylobacterRikenellaceae顯著相關(guān)(p < 0.05),牛磺熊去氧膽酸與黃疸清除顯著相關(guān)(p < 0.001)。因此,腸道菌群與BAs的相互相互作用參與了膽道閉鎖的肝損傷過程,這可能與術(shù)后膽管炎和黃疸清除密切相關(guān)。

更多肝病相關(guān)領(lǐng)域成果:

  1. Liver cancer heterogeneity modeled by in situ genome editing of hepatocytes.Science Advances. 2022.
  2. The effect of biliary obstruction, biliary drainage and bile reinfusion on bile acid metabolism and gut microbiota in mice.Liver International. 2021.
  3. Soyasaponin A2 Alleviates Steatohepatitis Possibly through Regulating Bile Acids and Gut Microbiota in the Methionine and Choline-Deficient (MCD) Diet-induced Nonalcoholic Steatohepatitis (NASH) Mice.Molecular Nutrition & Food Research. 2021.
  4. The Bio-Persistence of Reversible Inflammatory, Histological Changes and Metabolic Profile Alterations in Rat Livers after Silver/Gold Nanorod Administration.Nanomaterials. 2021.
  5. Targeted Metabolomics Analysis of Bile Acids in Patients with Idiosyncratic Drug-Induced Liver Injury.Metabolites. 2021.
  6. The methyltransferase METTL3-mediated fatty acid metabolism revealed the mechanism of cinnamaldehyde on alleviating steatosis.Biomedicine & Pharmacotherapy. 2022.
  7. UPLC-MS/MS-Based Serum Metabolomics Signature as Biomarkers of Esophagogastric Variceal Bleeding in Patients With Cirrhosis.Frontiers in Cell and Developmental Biology. 2022.
  8. Loss of miR-192-5p initiates a hyperglycolysis and stemness positive feedback in hepatocellular carcinoma.Journal of Experimental & Clinical Cancer Research. 2020.

……

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麥特繪譜專注于代謝組學(xué)與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,擁有成熟的代謝組學(xué)檢測(cè)平臺(tái),以靶向代謝組學(xué)為核心技術(shù),包括全球獨(dú)有技術(shù)Q600、Q300、Q200和各類小分子代謝物獨(dú)立檢測(cè)方法,菌群16S測(cè)序、宏基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等多組學(xué)技術(shù),以及聯(lián)合分析等全套解決方案。獨(dú)家的檢測(cè)技術(shù)、全面的數(shù)據(jù)報(bào)告以及專業(yè)的售后探討,助力您的科研探索之路不斷創(chuàng)新和突破。歡迎聯(lián)系獲取詳細(xì)資料!

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