16S rRNA測序和代謝組學(xué)助力土壤中微塑料和重金屬評價的研究
瀏覽次數(shù):1161 發(fā)布日期:2022-6-29
來源:中科新生命
項目文章 | 16S+代謝助力客戶土壤污染研究登陸環(huán)境科學(xué)頂刊
近期,南京大學(xué)環(huán)境學(xué)院李梅教授團(tuán)隊蔣小峰博士等人在環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域頂級期刊Environment International(IF 13.352)發(fā)表題為“Seasonal variations and feedback from microplastics and cadmium on soil organisms in agricultural fields”的研究文章,利用16S rDNA多樣性測序、非靶向和靶向代謝組學(xué)技術(shù)(中科新生命提供服務(wù))對微塑料和鎘(Cd)污染農(nóng)田中蚯蚓腸道菌群和代謝物情況進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)蚯蚓腸道菌群失調(diào)、代謝譜改變;此外,微塑料可作為載體在土壤環(huán)境中轉(zhuǎn)移重金屬,并可能在土壤生物體內(nèi)積累,揭示了土壤生態(tài)系統(tǒng)中微塑料進(jìn)入土壤環(huán)境和重金屬協(xié)同污染的潛在風(fēng)險。
研究材料
不同季節(jié)農(nóng)田土壤,蚯蚓腸道組織和內(nèi)容物。
技術(shù)路線
步驟1 立體顯微鏡測定土壤中微塑料的形狀、大小和顏色;
步驟2 μ-FTIR鑒定微塑料聚合物類型組成情況;
步驟3 土壤原位蚯蚓體內(nèi)微塑料和Cd含量的測定;
步驟4 16S rDNA多樣性測序檢測土壤、蚯蚓腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的變化;
步驟5 非靶、靶向代謝組檢測蚯蚓腸道代謝譜變化。
Graphic Abstract
研究結(jié)果
1.農(nóng)田春、冬季微塑料的分布和特征
根據(jù)《中國土壤環(huán)境質(zhì)量指南》,發(fā)現(xiàn)Cd是無錫太湖地區(qū)農(nóng)田的主要污染物(濃度 > 0.30 mg/kg)。春季和冬季土壤樣品中微塑料豐度分別為56.67~180.33 粒/kg、206.15~890.49 粒/kg,尺寸以0~500 μm為主,在春、冬季土壤樣本中分別占72.45%和88.87%(圖1)。微塑料顏色主要以透明、綠色和黑色為主,形狀主要以碎片(46%,春季)和纖維(37%,冬季)為主(圖2)。μ-FTIR鑒定結(jié)果顯示聚乙烯微塑料含量最高,說明地膜覆蓋是土壤微塑料的主要來源。
圖1 春季(A、B)和冬季(C、D)采樣點微塑料的豐度及尺寸的整體分布
圖2 春季(A、C)和冬季(B、D)采樣點微塑料顏色和形狀的總體分布
2.土壤、蚯蚓腸道和糞便微塑料、Cd含量的分布情況和相關(guān)性
線性回歸分析顯示,在冬季微塑料和Cd含量顯著相關(guān)(圖3)。對10個土壤采樣點取樣,僅F2、F3和F6均有皮質(zhì)遠(yuǎn)盲蚓檢出,因此后續(xù)對這3個采樣點進(jìn)行進(jìn)一步研究。結(jié)果顯示,蚯蚓腸道和糞便中的微塑料含量顯著高于土壤環(huán)境中的含量;蚯蚓腸道中Cd含量顯著高于土壤(圖4)。這些結(jié)果表明微塑料可能作為載體,將土壤環(huán)境中的重金屬轉(zhuǎn)移并在生物體內(nèi)富集,這將造成潛在的健康風(fēng)險。
圖3 采樣點春季(A)和冬季(B)微塑料豐度與Cd含量的相關(guān)性
圖4 土壤、蚯蚓糞和腸道中的微塑料豐度(A)和Cd含量(B)
3.原位土壤與蚯蚓腸道細(xì)菌群落的差異
16S rDNA多樣性測序顯示,蚯蚓腸道細(xì)菌OTU數(shù)量和多樣性顯著低于土壤,相同樣本類型間無顯著差異。原位土壤和蚯蚓腸道的細(xì)菌群落以變形菌門為主,且不同樣本間菌群組成相似。在蚯蚓腸道GF2、GF3、GF6中,擬桿菌門的相對豐度增加,而厚壁菌門相對豐度減少。表明隨著原位土壤SF2、SF3和SF6中微塑料豐度的增加,微生物群落結(jié)構(gòu)失調(diào)情況加劇(圖5)。
圖5 土壤和蚯蚓腸道微生物群落結(jié)構(gòu)和功能組成情況
4.原位蚯蚓代謝產(chǎn)物的變化特征
基于非靶向代謝組學(xué)的KEGG Pathway分析顯示,蚯蚓腸道代謝物主要參與途徑為丙酸代謝、丙酮酸代謝以及煙酸-煙酰胺代謝,這些途徑與有機酸和氨基酸代謝相關(guān)。靶向代謝組學(xué)結(jié)果顯示,苯丙氨酸和琥珀酸,在F2、F3和F6位點的原位蚯蚓腸道樣本間存在顯著差異(圖6)。
圖6 蚯蚓腸道顯著變化的KEGG途徑和代謝物
小編小結(jié)
本文通過對無錫太湖農(nóng)田污染物微塑料和Cd季節(jié)性變化的研究發(fā)現(xiàn),春季和冬季采樣點的微塑料豐度不同,但兩者間尺寸大小分布類似,來源于地膜覆蓋的聚乙烯是主要的微塑料類型。原位蚯蚓對土壤微塑料污染的反應(yīng)表明微塑料可作為載體,將土壤環(huán)境中的重金屬轉(zhuǎn)移并在生物體內(nèi)富集。16S rRNA測序和代謝組學(xué)的結(jié)果表明,微塑料-重金屬污染土壤可導(dǎo)致原位蚯蚓腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)失調(diào)和能量代謝失衡。這些研究結(jié)果對土壤生態(tài)系統(tǒng)中微塑料和重金屬污染物共存的潛在風(fēng)險進(jìn)行了綜合評價,對維護(hù)土壤生態(tài)安全具有重要作用。