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4D蛋白組學(xué)揭示新冠病毒誘導(dǎo)的心肌炎分子特征

瀏覽次數(shù):696 發(fā)布日期:2022-4-18  來源:中科新生命

炎癥性心肌病是一種以心臟免疫細(xì)胞浸潤(rùn)為特征的常見疾病,常由病毒、系統(tǒng)性免疫紊亂和藥物毒性引起。近期發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2感染的患者也伴有炎癥性心肌病,但是其具體的分子特征仍未知。
 

2021年12月,德國(guó)心血管研究中心Christian Schulz和馬克斯·普朗克生物化學(xué)研究所Matthias Mann等團(tuán)隊(duì)合作在心血管醫(yī)學(xué)領(lǐng)域權(quán)威期刊JAMA Cardiology(IF 14.7)雜志上發(fā)表了一篇參與的題為“Association of Complement and MAPK Activation With SARS-CoV-2–Associated Myocardial Inflammation”的文章。該文章利用4D蛋白組學(xué)技術(shù)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)評(píng)估了SARS-CoV-2感染患者以及病毒和免疫介導(dǎo)的心肌炎患者心臟的分子特征。



 

研究材料

非SARS-CoV-2病毒性心肌炎、免疫介導(dǎo)心肌炎、非炎癥性心肌病、SARS-CoV-2病毒性心肌炎患者心臟組織的福爾馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 樣本

 

技術(shù)路線

· 步驟1:不同心肌炎患者的免疫特征分析;

· 步驟2:不同心肌炎患者的蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析;

· 步驟3:富集通路的深入分析。
 

研究結(jié)果

1. 不同心肌炎患者的免疫特征分析

本研究共收集了19例參與者,包括4例(非SARS-CoV-2)病毒性心肌炎患者、5例免疫介導(dǎo)心肌炎患者、5例非炎癥性心肌病患者以及5例SARS-CoV-2病毒性心肌炎患者(患者信息見下表)。


表1 心肌炎患者的信息


免疫組織化學(xué)分析顯示,在免疫介導(dǎo)和病毒性心肌炎患者中,存在由T細(xì)胞(CD3)和巨噬細(xì)胞(CD68)組成的炎癥浸潤(rùn)(圖1A和1B),非炎癥對(duì)照組患者中T細(xì)胞缺失,巨噬細(xì)胞豐度較低,而在SARS-CoV-2感染患者中,心臟浸潤(rùn)以巨噬細(xì)胞為主,T細(xì)胞數(shù)量中度增加但較其他患者較高(圖1B)。對(duì)巨噬細(xì)胞的清除受體CD163(SARS-CoV-2感染患者中巨噬細(xì)胞的特征)的研究發(fā)現(xiàn),雖然所有炎癥患者中CD163的表達(dá)都有所增加(圖1C),但SARS-CoV-2組巨噬細(xì)胞的量最高(圖1D)。綜上所述,這些發(fā)現(xiàn)表明不同炎癥條件下的免疫反應(yīng)存在差異。


圖1 心臟標(biāo)本的的組織學(xué)特征

 

2. 不同心肌炎患者的蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

為了全面探索心肌炎患者心臟的分子特征,作者隨后對(duì)患者的心內(nèi)膜心肌活檢(EMB)樣本進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和4D蛋白組學(xué)分析(分析流程如下圖所示)。


圖2 分析流程圖


相關(guān)性分析結(jié)果顯示SARS-CoV-2感染患者EMB組織的蛋白組與病毒相關(guān)性心肌炎相關(guān)性最高,而非炎癥對(duì)照組患者的蛋白組相關(guān)性較低(圖3A),表明蛋白質(zhì)豐度發(fā)生了群體特異性的改變。
 

蛋白表達(dá)差異分析(圖3B)結(jié)果中發(fā)現(xiàn)基質(zhì)相互作用分子1 (STIM1)前體在SARS-CoV-2患者中的表達(dá)均顯著高于其他組。
 

通路富集分析結(jié)果顯示與非炎癥對(duì)照組相比,SARS-CoV-2組中絲氨酸/蘇氨酸激酶信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(特別是絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)和B-Raf通路)以及補(bǔ)體級(jí)聯(lián)反應(yīng)通路顯著上調(diào)(圖3C),且SARS-Cov-2組中的顯著差異蛋白數(shù)目在這兩種信號(hào)通路中均較高于其他三個(gè)組別(圖3D)。


圖3 SARS-CoV-2相關(guān)炎癥性心肌病的分子特征

 

3. 富集通路的深入分析

作者隨后對(duì)MAPK和B-Raf通路和補(bǔ)體級(jí)聯(lián)反應(yīng)進(jìn)行了更深入的分析,結(jié)果顯示MAPK通路中的蛋白MAP2K1、MAPK3以及ras相關(guān)蛋白--RAP1A, RAP1B和M-Ras,較于非炎癥性心肌患者均顯著上調(diào)(圖4A),不過該改變僅是在蛋白組學(xué)水平上,轉(zhuǎn)錄組的變化較小(圖4B)。


圖4 MAPK通路在SARS-CoV-2感染中上調(diào)


在SARS-CoV-2心肌炎組中,補(bǔ)體級(jí)聯(lián)反應(yīng)中的組成成分C1qB、C1qC、C3、C7、絲氨酸/半胱氨酸蛋白酶抑制劑分支G成員1 (SERPING1)和CD55在蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組水平上均顯著上調(diào)(圖5A)。另外,由于C1q是由巨噬細(xì)胞產(chǎn)生的,作者專門研究了心臟巨噬細(xì)胞中這種補(bǔ)體蛋白的豐度,結(jié)果顯示在EMB切片的免疫熒光分析中,CD68+巨噬細(xì)胞中存在C1q,且炎癥患者中巨噬細(xì)胞C1q中位熒光強(qiáng)度值增加,在SARS-CoV-2感染患者中巨噬細(xì)胞C1q中位熒光強(qiáng)度值最高(圖5B)。綜上所述,在SARS-CoV-2感染的心肌炎癥中,心肌巨噬細(xì)胞與補(bǔ)體蛋白C1q的豐度增加相關(guān)。



圖5 補(bǔ)體級(jí)聯(lián)反應(yīng)在SARS-CoV-2感染中上調(diào)

 

小編小結(jié)

在19名參與者中,心肌炎患者心肌組織中CD163+巨噬細(xì)胞的豐度普遍較高,而與非SARS-CoV-2病毒相關(guān)和免疫介導(dǎo)的心肌炎患者相比,SARS-CoV-2感染患者心肌組織中的淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)較低。在SARS-CoV-2感染患者中,補(bǔ)體級(jí)聯(lián)反應(yīng)的組成成分,包括C1q亞基和絲氨酸/半胱氨酸蛋白酶抑制劑分支G成員1在蛋白組和轉(zhuǎn)錄組中均較其他組患者顯著上調(diào)。在心臟巨噬細(xì)胞中,C1q豐度在SARS-CoV-2感染中最高。對(duì)重要信號(hào)級(jí)聯(lián)的評(píng)估發(fā)現(xiàn)絲氨酸/蘇氨酸絲裂原激活的蛋白激酶通路也顯著上調(diào)。
 

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來源:上海中科新生命生物科技有限公司
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