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Origin9.1進(jìn)行PAM熒光儀快速光曲線擬合操作指南

瀏覽次數(shù):4702 發(fā)布日期:2020-2-18  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

軟件:OriginPro9.1
素材:PAM熒光儀導(dǎo)出的PAR和ETR數(shù)據(jù)。
操作步驟

1,正確安裝Origin軟件,打開(kāi)軟件

 

20021801.jpg


2,打開(kāi)正確操作PAM測(cè)量得到的快速光曲線數(shù)據(jù)文件
 

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3,將PAR和ETR的數(shù)據(jù)復(fù)制到Origin軟件,并編輯橫坐標(biāo)和縱坐標(biāo)注釋及單位
 

20021803.jpg


4,選中數(shù)據(jù),生成散點(diǎn)圖,注意:一定一定一定要先選中數(shù)據(jù),才能生成圖哦!
 

20021804.jpg

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5,可以根據(jù)需求調(diào)整散點(diǎn)圖橫縱坐標(biāo)起始值,及最大值,間隔大小以及散點(diǎn)的樣式,形狀或顏色。
 

20021806.jpg

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6,開(kāi)始擬合:激活Graph,選中散點(diǎn)圖的數(shù)據(jù)點(diǎn)。

注意:一定一定一定要先選中散點(diǎn)圖中的點(diǎn),再點(diǎn)擊工具欄!
點(diǎn)擊軟件上方的 Analysis→Fitting→NonLinearCurve Fit→Open Dialog
 

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7,創(chuàng)建擬合方程

對(duì)話框中,Category選項(xiàng)選擇“UserDefined”(用戶自定義),再點(diǎn)擊箭頭所指按鈕,打開(kāi)創(chuàng)建新方程的對(duì)話框。對(duì)話框中:Function Name一欄可對(duì)方程進(jìn)行命名(僅限英文),此次命名為“LightCurveFit”;FunctionType一欄選擇第二個(gè)“Equations”,然后點(diǎn)擊next進(jìn)行下一步。
 

20021809.jpg

 

8,編輯擬合方程

進(jìn)入?yún)?shù)設(shè)置,第一行和第二行為自變量x和因變量y,第三行為你自己需要設(shè)置的方程參數(shù),以一元二次方程為例,設(shè)置參數(shù)a,b,c(字母和標(biāo)點(diǎn)符號(hào)必須是英文輸入法),然后點(diǎn)擊next進(jìn)行下一步。
 

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9,設(shè)置方程式

進(jìn)入方程輸入,如圖,在紅線框出的地方輸入一元二次方程。(字母和符號(hào)必須是英文輸入法)。

y=x/(a*x^2+b*x+c)

到此處基本設(shè)置已完畢,一直點(diǎn)擊next即可,最后點(diǎn)擊finish!

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10,開(kāi)始擬合

點(diǎn)擊并切換至Parameters窗口,點(diǎn)擊Simplex擬合,直至Parameters內(nèi)參數(shù)不變,點(diǎn)擊Fit完成擬合。

點(diǎn)擊完Fit,可能會(huì)出現(xiàn)一個(gè)對(duì)話框,詢問(wèn)是否切換到CurveFit Report Sheet。

11,查看擬合結(jié)果,修改擬合曲線注釋文本等
 

20021818.jpg

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強(qiáng)烈建議:
分析結(jié)束后請(qǐng)盡快通過(guò)File→Save Project保存工作流程。
擬合曲線可以通過(guò)File→Export Graph導(dǎo)出。

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12,計(jì)算快速光曲線參數(shù)

測(cè)量光響應(yīng)曲線時(shí)程序連續(xù)照射幾個(gè)強(qiáng)度逐漸升高的光化光,一般情況下每個(gè)梯度的光化光持續(xù)時(shí)間太短而不足以使光合作用達(dá)到穩(wěn)態(tài)。因此,此時(shí)的光響應(yīng)曲線被稱為快速光曲線(RLC)。和傳統(tǒng)的光響應(yīng)曲線不同,快速光曲線反映了當(dāng)前狀態(tài)下光合作用的信息。通過(guò)對(duì)快速光曲線進(jìn)行擬合,可以得到以下幾個(gè)主要參數(shù):
• α,單位:electrons/photons,快速光曲線的初始斜率,反映了光能利用效率。
• ETRm,單位:μmol· m-2 · s-1,最大電子傳遞速率。
• Ek,單位:μmol· m-2 · s-1,最小飽和光強(qiáng)(半飽和光強(qiáng)),反映了樣品對(duì)強(qiáng)光的耐受能力。


PamWin-3采用Eilers and Peeters(1988)的公式對(duì)快速光曲線進(jìn)行擬合,擬合公式如下:

20021821.jpg

各個(gè)參數(shù)的計(jì)算公式分別是:

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