流式細(xì)胞術(shù)( Flow cytometry, FCM)是一種可以對細(xì)胞或亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)進(jìn)行快速測量的新型分析技術(shù)和分選技術(shù)。與一般的技術(shù)相比,流式細(xì)胞儀分析時會涉及到各種參數(shù),對于剛?cè)腴T的我們,常常搞得焦頭爛額。如下圖(來自網(wǎng)絡(luò))僅僅流式分析數(shù)據(jù)圖都是多種多樣(一維直方圖、二維點圖、等高線圖、密度圖等)。所以,今天就為大家科普一下,流式細(xì)胞儀中那些常見術(shù)語。
01、流式細(xì)胞儀常見術(shù)語
1. 設(shè)門(gate):
劃定某一區(qū)域的細(xì)胞群體,對其單獨加以分析或分選。舉例來說,如下左圖,以FSC為橫坐標(biāo),SSC為縱坐標(biāo),圈出想進(jìn)行分析的細(xì)胞主群(設(shè)門),雙擊圈內(nèi),看FL4(APC)為橫坐標(biāo),F(xiàn)L2(PE)為縱坐標(biāo),進(jìn)行分析。下中圖為陰性對照,由此可以圈出陰性群的范圍,在下右圖中就可以劃分出APC單陽、PE單陽、APC&PE雙陽的細(xì)胞群。
2. FL1、 FL2、 FL3、FL4通道:
在某些機(jī)型的流式細(xì)胞儀中存在,是指不同的熒光通道。舉個例子,我們用FITC/PE雙標(biāo)記的細(xì)胞,在488nm的激光激發(fā)下,這兩種熒光染料分別發(fā)出波長不同的綠色和橙色熒光,然后將發(fā)出的熒光再通過濾光片分開,對應(yīng)的是不同的波長的濾光片,一般在FL1通道是530nm的濾光片,在FL2通道是575nm的濾光片,這樣就可以把在一起的熒光分開了。
3. FL2-W FL2-A FL2-H :
流式細(xì)胞儀檢測信號時,每一個細(xì)胞通過激光,機(jī)器的探頭都會檢測到一個熒光信號,在內(nèi)部產(chǎn)生一個電脈沖信號(波),這個信號機(jī)器記錄為一個峰值,每一個峰值都有三個參數(shù),高度(H),寬度(W)和曲線下面積(A),H 和W都是直接測出的,而A是根據(jù)機(jī)器的設(shè)置就算得出。
4. APC、PE、PE-Cy7、PerCP-Cy5.5等:
這些名詞均為常見的熒光素,在受激發(fā)后能產(chǎn)生熒光。
5. 調(diào)補(bǔ)償:
若兩種以上的熒光素的發(fā)射光譜之間存在重疊,則需要調(diào)補(bǔ)償。這就意味著一種熒光素發(fā)出的光可能被另一種熒光素的檢測器檢測到。調(diào)補(bǔ)償主要指在流式細(xì)胞多色分析中,糾正熒光素發(fā)射光譜重疊的過程,去除干擾熒光信號。如下為補(bǔ)償調(diào)節(jié)原則:
①用于調(diào)節(jié)補(bǔ)償?shù)臉?biāo)本必須單染。
②樣本必須可以染出一群陽性和一群陰性,以比較它們之間的平均熒光強(qiáng)度。
③可以使用同一熒光的另一抗體替換目的抗體來調(diào)節(jié)補(bǔ)償(例如在稀有細(xì)胞檢測時)。
④使用表達(dá)強(qiáng)度高的抗體來調(diào)節(jié)補(bǔ)償。
⑤用來調(diào)節(jié)補(bǔ)償?shù)目贵w必須與實驗用的抗體熒光素一樣(例如不能用FITC調(diào)節(jié)GFP的補(bǔ)償)。
⑥串聯(lián)染料的抗體如果批號不同,需要再次做補(bǔ)償。
⑦陰性和陽性細(xì)胞的自發(fā)熒光水平必須一致。
⑧有些抗原表達(dá)弱,陽性群不明顯,例如IFN-γ-PE,可以用補(bǔ)償微球代替細(xì)胞。
6. MFI值:
即為平均熒光強(qiáng)度。每個細(xì)胞經(jīng)過流式細(xì)胞儀檢測都會有一個相對強(qiáng)度的熒光值。陰性細(xì)胞沒有特異性熒光,也會發(fā)生很微弱的自發(fā)熒光,因此有很小的熒光強(qiáng)度;陽性細(xì)胞的特異性熒光強(qiáng)度是陰性細(xì)胞熒光強(qiáng)度的幾百甚至幾千倍。MFI就是把所有細(xì)胞的熒光強(qiáng)度相加再除以細(xì)胞數(shù),就是所有細(xì)胞熒光強(qiáng)度的一個平均值。一般來說,百分比越高M(jìn)FI就高,百分比低相應(yīng)MFI就低,有時候兩個樣本百分比相處不多看不出差別時,MFI就能很好地反應(yīng)這種微弱的差異。
7. 染色:
用帶有不同熒光基團(tuán)的抗體分別結(jié)合細(xì)胞上不同的抗原。熒光素偶聯(lián)抗體的標(biāo)記(染色)包括表面染色和胞內(nèi)染色:
①表面染色
②胞內(nèi)染色
8. 基線偏移:
通過增加隨機(jī)的高斯正偏移把一些低水平信號的對數(shù)數(shù)據(jù)從比較低的數(shù)字通道上移上來,方便數(shù)據(jù)間的分析。
02、常見的技術(shù)指標(biāo)
1. 儀器的分辨率:
分辨率是衡量儀器測量精度的指標(biāo),通常用變異系數(shù)CV (Coefficient of Variation)表示。DNA 流式分析中的分辨率(或精確性)非常重要,因為細(xì)胞群體之間DNA 含量的細(xì)微差別可能有顯著的生物學(xué)意義。通常,分辨率由標(biāo)準(zhǔn)微球DNA 分布中的G0/G1 峰的變異系數(shù)CV來反映(CV%=(SD/Mean)×100)。儀器因素(如液流、光路調(diào)試和光學(xué)元件等)、樣本制備和染色過程帶來的人為因素都可能影響檢測的精確性。評估真正的生物學(xué)意義上的DNA 含量差別因而具有更重要的價值。如何最大限度地減少樣本制備和儀器因素帶來的變異是DNA 分析條件最佳化的根本所在。DNA 直方圖中峰的CV 越低,質(zhì)量越好,從圖中可能獲得的信息越多。新鮮標(biāo)本的CV 常比石蠟包埋的標(biāo)本好。新鮮標(biāo)本的CV 常≤3%,而石蠟包埋的標(biāo)本CV 則取決于組織病理實驗室的具體操作方法,通常到≤5%。當(dāng)G1 峰的CV≥8%時,不再合適估計S 期比例。
2. 熒光測量靈敏度:
靈敏度的高低是衡量儀器檢測微弱熒光信號的重要指標(biāo),一般以能檢測到單個微球上最少標(biāo)有FITC 或PE 熒光分子數(shù)目來表示,一般現(xiàn)在FCM 均可達(dá)到<600個熒光分子,兩個細(xì)胞間的熒光差>5%即可區(qū)分。
3. 前向角散射光(FSC, Forward Scatter)檢測靈敏度:
前向角散射光檢測靈敏度是指能夠檢測到的最小顆粒大小,一般目前商品化的FCM 可以測量到0.2-0.5μm 左右。
4. FCM 分析速度:
分析速度以每秒可分析的細(xì)胞數(shù)來表示,當(dāng)細(xì)胞流過光束的速度超過FCM 儀器響應(yīng)速度時,細(xì)胞產(chǎn)生的熒光信號就會被丟失,這段時間稱為儀器的死時間(Dead time)。死時間越短,我們就說這臺儀器處理數(shù)據(jù)越快,一般可達(dá)到3000個/秒~6000個/秒左右,F(xiàn)ACS Calibur 的分析速度為10000個/秒,大型機(jī)已達(dá)到每秒幾萬個細(xì)胞。
5. FCM 分選指標(biāo):
分選指標(biāo)主要包括:分選速度、分選純度及分選得率。分選速度指每秒可提取所要細(xì)胞的個數(shù),目前常用的臺式分選儀器BD公司生產(chǎn)的FACS Calibur的分選速度為300個/秒,BD大型機(jī)的流式細(xì)胞儀最高分選速度可達(dá)每秒上萬個細(xì)胞。分選純度指被分選出細(xì)胞所占的百分比,一般臺式機(jī)和大型機(jī)的分選純度均可達(dá)到99%左右。分選得率是指被分出細(xì)胞與原來溶液中該細(xì)胞的百分比。通常情況下,分選純度和得率是互相矛盾的,同一樣品,純度提高,得率降低,反之亦然。這是由于樣品在液流中并不是等距離一個接著一個有序地排著隊,而是隨機(jī)的,因此,一旦兩個不同細(xì)胞挨得很近時,在強(qiáng)調(diào)純度和收獲率不同條件下,儀器會作出取舍,因此,選擇純度還是得率要視具體實驗要求而定。
6. 背景(噪聲、熒光、散射)Background (noise, fluorescence, scatter):
當(dāng)樣品流中沒有顆粒時卻仍存在的信號(背景噪聲是限制熒光檢測靈敏度的一個因素)。背景信號會有不同的主要來源:當(dāng)激光器關(guān)閉,或流動室沒有光激發(fā)時,檢測器噪聲是主要的背景信號來源。對于光電倍增管(PMT),檢測器背景噪聲被稱為暗電流,主要來自光電陰極的電子的隨機(jī)發(fā)射。對于光電二極管和其他固態(tài)檢測器,主要來源于倍增器。熒光噪聲源包括:水和光學(xué)元件的拉曼散射來自樣品或鞘流中未結(jié)合的熒光染料、試劑或污染物的熒光光學(xué)組件的熒光。
03、Tips
①控制好孵育時間:熒光淬滅操作中的孵育時間一定要嚴(yán)格,孵育時間過長會導(dǎo)致熒光淬滅,如將試管放入冰中,可以延遲淬滅;
②注意染色順序:遇到多種熒光染色時,可能會因為染色順序的不同而導(dǎo)致熒光強(qiáng)度不同。處理方法:提前進(jìn)行預(yù)實驗,嘗試多種順序,選擇最佳染色順序
③合適的染色方案:選擇不合理的染色方案也會導(dǎo)致熒光信號太弱。處理方法:提前進(jìn)行預(yù)實驗,設(shè)計好最佳染色方案
④做好陰性對照及同型對照:試驗細(xì)胞陰性對照可以顯示細(xì)胞基準(zhǔn)的熒光水平。同型對照則是為了查看抗體非特異性結(jié)合的水平。選擇同型對照需要注意采用相同物種、相同亞類、相同染料、相同濃度,否則,檢測的時候會出現(xiàn)亂七八糟的同型對照結(jié)果。
⑤選擇合適的抗體:為表達(dá)最弱的抗原選擇染色指數(shù)最高的熒光素。根據(jù)使用的流式細(xì)胞儀性能、激光器、濾光片種類來選擇。對于多色實驗,需選擇發(fā)射光譜重疊小的染料。