Less is more:DIA技術,2table+1figure,得一篇12分的Molecular Psychiatry文章
Nature旗下的Molecular Psychiatry(IF=11.64)是精神疾病領域的top期刊。
在19年1月發(fā)表了一篇題為“Complement pathwaychanges at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in alongitudinal population-based study: evidence for a role of stress”的文章,文中利用了DIA技術,研究補體系統(tǒng)與精神異常的關系。
Complement pathway changes at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in a longitudinal population-based study: evidence for a role of stress
IF=11.64
補體級聯(lián)是免疫系統(tǒng)的重要組成。越來越多的證據(jù)表明,補體系統(tǒng)異常與精神疾病有密切關系。為了進一步證明兩者之間的關系,研究者對來自于UK avon longitudinal study of parents and children (ALSPAC)隊列中的血液樣本,進行了DIA蛋白質(zhì)組檢測,重點關注其中29個補體級聯(lián)相關蛋白的表達水平。結果顯示,6個蛋白的表達水平與精神異常相關。利用大鼠慢性應激模型,該研究結果進一步表明:慢性應激可能引起補體通路異常,與精神異常有顯著相關性。(小編:如果進一步研究一下他們的腸道菌群,可能會有更多的發(fā)現(xiàn))
對于為什么采用DIA技術進行血漿蛋白質(zhì)組研究,作者在文中給出了說明:DIA技術避免了非靶向蛋白質(zhì)組學研究中會遇到的許多問題,比如缺失性,原文如下:
作者對于文章中圖表和結果的展示采取的是“less is more”原則,2 table+1 figure,Results全文也僅有3段話:
1個table和1個figure:列出所檢測的幾個補體通路相關的表達水平。
雖然話少,但作者為保證數(shù)據(jù)的嚴謹性,特意在進行數(shù)據(jù)分析時,剔除了兩個樣本的信息,原因是因為該樣本的色譜信息不好,原文如下:
跟本平臺一樣,對DIA的數(shù)據(jù)有著嚴格的質(zhì)控,色譜的評價是非常重要的,但是卻被大家所忽視(中科新生命的DIA數(shù)據(jù)從3個維度評價色譜表現(xiàn),并將數(shù)據(jù)呈現(xiàn)在報告中)。
雖然DIA是個比較新的技術,但憑借著覆蓋度、重現(xiàn)性、準確度方面的革新式提升,DIA已經(jīng)出現(xiàn)在越來越多的高水平研究中。隨著2019年的到來,我們一定會看到越來越多DIA技術的應用被報道。
中科新生命不僅是在國內(nèi)最早推出DIA服務的平臺,而且也是僅有的對DIA進行持續(xù)深度開發(fā)的平臺。例如,針對臨床最高頻研究樣本——血漿,我們實現(xiàn)了單個樣本、無需去除高豐度蛋白、無需分級、2h時長定量1000+蛋白的分析能力,該突破被大V平臺廣泛關注和報道(例如Bioart之前的一篇推文:蛋白質(zhì)組學技術新突破:血液樣本DIA,定量蛋白數(shù)創(chuàng)新高)。后續(xù),同樣的技術升級我們也將移植到其他類型樣本上,敬請期待。
最后再給要發(fā)DIA文章的老師們加一把力:
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注:上述數(shù)據(jù)為MedSci實時信息,動態(tài)變化,僅用于科學研究,不得作任何商業(yè)用途。
蛋白|修飾|代謝|脂質(zhì)|結構確證
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