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為什么要使用多重?zé)晒夥椒ㄟM(jìn)行western blot的檢測?

瀏覽次數(shù):6254 發(fā)布日期:2018-5-7  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

最近關(guān)于western blot數(shù)據(jù)造假的學(xué)術(shù)新聞成了科研的熱搜詞條,其數(shù)據(jù)造假包括,均存在一圖多用,用了剪切,拼接,翻轉(zhuǎn),旋轉(zhuǎn),調(diào)整大小,故意抹平背景等P圖手法,那我們來看看這些造假的數(shù)據(jù)。

一、一圖兩用——用同一條帶,P圖后代表不同實驗結(jié)果。

兩個不同實驗,同一條帶代表不同蛋白(GST-IkBa和Caspase)

《鋅指蛋白A20對氧化性低密度脂蛋白介導(dǎo)的巨噬細(xì)胞與血管平滑肌細(xì)胞增殖和凋亡的影響及其分子機制的研究》,2005年6月

二、抹平背景

為了達(dá)到預(yù)期的實驗效果,故意調(diào)整對比度,將不要的條帶抹去。

Kagami, A. et al. Acetylation regulates monopolar attachment at multiple levels during meiosis I in fission yeast. EMBO Rep. 12, 1189–1195 (2011).

三、拼圖粘貼

ABCD變成了ACBD

--Metformin inhibits cell proliferation, migration and invasion by attenuating CSC function mediated by deregulating miRNAs in pancreatic cancer cells.Cancer Prevention Research (2012)

四、一組對照多次使用

像GAPDH、β-actin這些基本都是陽性的結(jié)果,所以有時候有些小伙伴就圖省事兒,做一次GAPDH、β-actin的WB圖,可以用一陣子,發(fā)幾篇文章了,有時候調(diào)調(diào)亮度,有時候增加以下對比度,有的時候鏡像反轉(zhuǎn)一下。

--Increased Ras GTPase activity is regulated by miRNAs that can be attenuated by CDF treatment in pancreatic cancer cells.Cancer Letters (2012)

 

那么我們?nèi)绾味糁七@樣造假數(shù)據(jù)的發(fā)生的,最好的辦法是選擇合適合理的檢測方法和提供真實的圖片信息。

A、z驗人員應(yīng)該采用現(xiàn)在動態(tài)范圍更寬的多重?zé)晒鈝estern blot檢測方法來進(jìn)行western blot檢測,多重?zé)晒鈾z測二抗使用熒光基團(tuán)標(biāo)記,膜上的靶標(biāo)蛋白濃度與熒光信號強度呈線性關(guān)系,實現(xiàn)真正的定量要求,無需玻剝離膜和二次孵育,進(jìn)行上樣質(zhì)控,目標(biāo)蛋白和內(nèi)參蛋白在同一張膜上,就不會發(fā)生上面數(shù)據(jù)造假的情況發(fā)生。

  • 成像儀器要提供給客戶真實的原始的tiff圖片,而不是經(jīng)過軟件自行修改,編輯的看著好看的圖片,例如插值圖片,插值圖像灰度值有明顯的不連續(xù)性,圖像質(zhì)量損失較大,會產(chǎn)生明顯的馬賽克和鋸齒現(xiàn)象。自動優(yōu)化圖片,軟件類似PS的手法,在形成圖像時進(jìn)行自動優(yōu)化,消除背景等方法,這樣會使圖片丟失大量信息,影響數(shù)據(jù)的真實性。
  • Azure公司秉承實事求是,尊重科研的態(tài)度,我們提供給客戶最原始的16bit的tiff圖片,tiff是最復(fù)雜的一種位圖文件格式。tiff是基于標(biāo)記的文件格式,它廣泛地應(yīng)用于對圖像質(zhì)量要求較高的圖像的存儲與轉(zhuǎn)換。由于它的結(jié)構(gòu)靈活和包容性大,它已成為圖像文件格式的一種標(biāo)準(zhǔn)。信息量大,真實反映實驗結(jié)果。

綜上所述,要選擇合適的western blot檢測方法、好的成像檢測器和一顆端正的學(xué)術(shù)心,才能做好科研,不會有類似的事件發(fā)生。

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