基因編輯技術就像一把手術刀指能夠?qū)δ繕嘶蜻M行編輯修改,實現(xiàn)對特定基因片段的敲除、加入等。到目前為止,ZFN(鋅指核糖核酸酶),TALENs(轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應物核酸酶)和CRISPR/Cas9這三代技術已經(jīng)席卷國內(nèi)外各大實驗室?那么他們各有什么優(yōu)勢?他們之間相比又如何呢?小編帶著好奇專程采訪請教了威斯騰基因編輯團隊申總監(jiān)。
申總監(jiān)深入淺出地向小編介紹了三代基因編輯技術的原理、優(yōu)缺點及運用。小編也是生物學專業(yè)出身,聽得津津有味,樂在其中,決定現(xiàn)學現(xiàn)賣給大家簡單介紹一下基因編輯技術的奧妙。
ZFN(鋅指核糖核酸酶)作為人工合成的限制性內(nèi)切酶通過其鋅指DNA結合域、DNA切割域發(fā)揮作用。研究者通過改造DNA結合域,靶向定位于不同的DNA序列,再由DNA切割域進行特異性切割。此外,ZFN技術還可與細胞內(nèi)DNA修復機制共同發(fā)揮作用,使研究者自如地編輯基因組。ZFN技術的優(yōu)勢在于具有很高的特異性,因而避免了免疫應答,但高度的特異性卻帶來了另一種弊端,即基因工程化鋅指DNA結合蛋白成為了難題,究其原因或許是因為蛋白質(zhì)本身體積龐大的性質(zhì)及其環(huán)境依賴性結合的屬性。另外,ZNF技術易于脫靶,導致細胞死亡或者額外突變。
TALEN為第二代基因組編輯核酸酶。TAL效應因子(TALE)可以特異性結合目的序列,通過將一段人造TALE與FokI核酸酶連接起來,即組成了TALEN,一類具有特異性基因組編輯功能的強大工具。與其它技術相比,TALEN技術很大程度上的地避免了功能蛋白脫靶,因為它們可以高度特異性地結合DNA靶位點,產(chǎn)生的脫靶效應非常微弱。此外與ZFN技術相比,其設計和工程沒有那么復雜,也不像ZFN那樣容易受周圍連接環(huán)境綁定的影響。因此TALEN運用起來更簡單、構建更便捷,且價格更低廉。但是裝配TALEN編碼質(zhì)粒卻是一個冗長的、高強度工作的過程。
申總監(jiān)介紹完前兩種技術,開始變得越來越興奮,原來是要講他團隊的拿手好戲——CRISPR/Cas9系統(tǒng)了。最近幾年基因編輯技術CRISPR/Cas9顯得異;鸨,自面世以后,彌補了傳統(tǒng)基因編輯技術的諸多不足,使得基因的“任意編輯”變得越來越容易。也因此,CRISPR/Cas9技術當仁不讓的成為基因編輯技術的“王牌”,大有一副取而代之的勢頭。
CRISPR-Cas9技術的靈感來源于細菌的免疫系統(tǒng)。CRISPR序列由眾多短而保守的重復序列(repeats)和間隔區(qū)(spacer)組成。間隔區(qū)是一些可變序列,其與先前入侵細菌基因組外的外源遺傳物質(zhì)的序列相對應。這些間隔序列儲存在細菌基因組內(nèi),被看作是通過再感染來觸發(fā)降解入侵病毒DNA的記憶機制。距離該理論被提出已經(jīng)過去了幾十年,但是直到2012年,用于這項技術的工具才上市。
CRISPR-Cas9技術的工具使用起來非常簡單,同時設計和構建速度最快,成本也最低。因為不涉及蛋白質(zhì)工程,構建CRISPR-Cas9系統(tǒng)只需要幾天時間。但是CRISPR-Cas9技術也有一些限制,比如脫靶的問題,與ZFN和TALEN復雜的二聚體結構不同,CRISPR-Cas9系統(tǒng)擁有更簡單的單體結構,可通過堿基配對識別同源位點,因此在識別和切割期望的DNA位點方面特異性低,而且靶突變驗證難度很高,需要掃描全基因組,這將是很大的工作量。威斯騰生物CRISPR-Cas9團隊向細菌、植物、哺乳動物中成功敲除及引入了不少基因,擁有自己獨到的見解和豐富的技術經(jīng)驗。
小編今天對于基因編輯的學習收獲很大,您是不是對基因編輯技術也有了更深入的了解,三代技術你更青睞哪一種呢?