眾所周知,WB實(shí)驗(yàn)是蛋白質(zhì)研究的基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)之一。WB的操作看似簡單,做好確是不簡單的。要想取得漂亮的WB條帶,樣品的制備是前提保證。樣本制備是WB實(shí)驗(yàn)的第一步也是最重要的一步,可分為樣本采集、樣本裂解、蛋白定量和蛋白變性四個(gè)步驟。在此過程中,大家會(huì)遇到各種奇奇怪怪的問題,這里給大家匯總了一些樣本制備過程中經(jīng)常遇到的問題及解決方案,為大家答疑解惑。
問題一:出現(xiàn)透明膠狀物
可能原因:基因組復(fù)合物釋放出來
解決方案:
1.適當(dāng)超聲或使用1ml注射器反復(fù)抽吸可以打斷基因組DNA從而使粘稠感消失。
2.加入loading buffer煮沸變性的時(shí)候,可以稍微延長煮沸的時(shí)間,充分煮沸后一方面可以使結(jié)合在基因組DNA上的蛋白充分釋放,同時(shí)可導(dǎo)致基因組DNA的部分?jǐn)嗔褟亩拐吵砀邢А?/p>
3.裂解的時(shí)候在裂解液中加入廣譜核酸酶。
問題二:蛋白濃度低
可能原因:
1.細(xì)胞或者組織量偏少。
2.樣本跟裂解液的比例不合適。
3.沒有充分裂解,或者裂解過程中蛋白降解。
解決方案:
1.增加樣本量。
2.根據(jù)樣本的量調(diào)整裂解液量。
3.裂解時(shí)間要充足,組織樣本要借助物理破碎,細(xì)胞樣本要吹打或者顛倒混勻,裂解液里要加酶抑制劑。
問題三:上清漂浮一層油脂
可能原因:樣本富含脂肪
解決方案:
1.裂解后樣本低溫靜置,吸出漂浮的油脂。
2.當(dāng)吸取依然達(dá)不到要求的時(shí)候,可以嘗試用二氧化硅吸附。
問題四:貼壁細(xì)胞收集是刮下來還是胰酶消化
解決方案:
兩種方式都是可行的,各有利弊。不必?fù)?dān)心刮刀收集會(huì)刮壞細(xì)胞,如果胰酶消化的程度掌握不好,也會(huì)讓細(xì)胞破損。胰酶消化可能會(huì)對某些膜蛋白產(chǎn)生影響,刮刀收集效率會(huì)略低,可根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)來選擇細(xì)胞收集的方式。做總蛋白提取時(shí),可選擇直接在器皿中進(jìn)行裂解,無需提前收集。
問題五:WB蛋白樣品堵孔
可能原因:
1.脂類對濃縮膠點(diǎn)樣孔的堵塞。
2.樣品粘度高而引起的堵孔。
3.裂解不充分而引起的堵孔。
4.還原劑的失效而形成的蛋白復(fù)合物。
解決方案:
1.脂類對濃縮膠點(diǎn)樣孔的堵塞,可以將樣品靜置在冰上或4℃冰箱,讓脂類析出,從而去除脂類。
2.樣品粘度高而引起的堵孔,可以將樣品重新進(jìn)行超聲破碎,徹底地將樣品中的核酸打斷成小片段,從而降低樣品的粘度。
3.裂解不充分而引起的堵孔,在樣品變性之前,加入足量的裂解液,將樣品濃度降下來,才能夠打開蛋白質(zhì)聚集形成復(fù)合體。
4.還原劑的失效而形成的蛋白復(fù)合物,可以保存一段時(shí)間后的樣品再次使用前只需補(bǔ)加適量的還原劑重新煮樣就可以打開此類復(fù)合物了。
問題六:細(xì)胞提取液有的有沉淀,有的很清亮
可能原因:
1.蛋白變性不徹底。
2.樣本濃度過高。
解決方案:
1.適當(dāng)提高SDS濃度,同時(shí)延長煮樣時(shí)間。
2.用水或PBS稀釋樣本。
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