InnoScan在新冠患者不正常的自身聚糖抗體研究的應(yīng)用
瀏覽次數(shù):1102 發(fā)布日期:2023-10-11
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InnoScan文獻(xiàn)快訊—新冠患者不正常的自身聚糖抗體
人體免疫系統(tǒng)對(duì)預(yù)防和治療新冠至關(guān)重要,但異常免疫反應(yīng)會(huì)產(chǎn)生有害影響。新冠病毒表面高度糖基化,可誘導(dǎo)人體免疫系統(tǒng)產(chǎn)生聚糖抗體。聚糖抗體可識(shí)別病毒并影響臨床結(jié)果,但其作用知之甚少。NCI癌癥研究中心的吉爾德利夫團(tuán)隊(duì)使用糖微陣列芯片,對(duì)不同隊(duì)列新冠肺炎患者血清和健康對(duì)照血清進(jìn)行抗體分析,發(fā)現(xiàn)新冠肺炎患者對(duì)自身聚糖有多種自身抗體,包括可導(dǎo)致神經(jīng)系統(tǒng)疾病的抗神經(jīng)節(jié)苷脂抗體。
此外,新冠肺炎患者中幾乎所有的抗聚糖IgM信號(hào)都較低。某些N-連接聚糖的自身抗體與更嚴(yán)重的疾病相關(guān),如低水平的Forssman抗原和卵清蛋白自身抗體。這項(xiàng)研究表明,抗聚糖抗體檢測(cè)可能有利于新冠肺炎患者的臨床分析和病毒免疫反應(yīng)研究。
該團(tuán)隊(duì)構(gòu)建的糖芯片含有816種組份,其中包含N-和O-連接的聚糖、糖脂聚糖、糖肽、細(xì)菌和真菌聚糖以及一些天然糖蛋白。每個(gè)樣品點(diǎn)作二重復(fù),每張芯片有8個(gè)重復(fù)的微陣列。該芯片可快速分析血清中抗聚糖抗體群,包括針對(duì)外來(lái)抗原和自身抗原的抗體群。芯片制作后,采用InnoScan 1100 AL芯片掃描儀對(duì)樣品點(diǎn)形態(tài)和缺失進(jìn)行質(zhì)控。 芯片和樣品反應(yīng)后的熒光信號(hào),采用InnoScan1100AL進(jìn)行掃描檢測(cè)。
實(shí)驗(yàn)樣品中40例新冠感染患者血清來(lái)自Raybiotech公司, 70例新冠感染患者血清來(lái)自NIH,38名未感染健康個(gè)體血清作為“對(duì)照組”(表 1)。所有對(duì)照組血清樣本在SARS-CoV-2爆發(fā)前采集。
表1,隊(duì)列的人口統(tǒng)計(jì)
代表數(shù)據(jù):
圖1. 所有聚糖的平均IgG和IgM抗體信號(hào)。(A) IgG和IgM抗體信號(hào)平均信號(hào)箱線圖,對(duì)照樣品的平均IgG為9.21個(gè)原始熒光單位(RFU)。Raybiotech新冠肺炎隊(duì)列的平均IgG信號(hào)為9.30,NIH新冠肺炎隊(duì)列的平均IgG信號(hào)值為8.90。對(duì)照組的平均IgM信號(hào)為12.41。Raybtioech新冠肺炎隊(duì)列平均IgM信號(hào)為11.21,NIH隊(duì)列的平均IgM信號(hào)為10.83。(B) 選定年齡范圍患者的IgM和IgG的平均信號(hào)箱線圖。ns,表示不顯著。箱體表示四分位數(shù),線表示最小值和最大值。
圖2:新冠肺炎患者與對(duì)照組之間的差異。(A) x軸上的平均Raybiotech新冠肺炎患者信號(hào)相比對(duì)照的倍數(shù)變化(log2)和y軸上的負(fù)P值(log10)的火山圖。虛線以上的點(diǎn)在使用20%錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率的情況下具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。(B)各血清樣品抗LacNAc聚糖IgG抗體平均信號(hào)箱線圖。 使用GlycoGlyph創(chuàng)建聚糖結(jié)構(gòu)。箱體表示四分位數(shù),線表示最小值和最大值。
圖 3. 糖鏈家族異常高的 IgG 信號(hào)。 (A) 自身聚糖異常高的 IgG 信號(hào)。行代表糖鏈,列代表檢測(cè)樣品。藍(lán)色框代表異常高信號(hào)。 (B) 三個(gè)隊(duì)列中自身聚糖 IgG異常高信號(hào)的數(shù)量條形圖 C) 條形圖比較了三個(gè)隊(duì)列中非自身聚糖異常高IgG信號(hào)的數(shù)量。
圖4。新冠肺炎患者血清中神經(jīng)節(jié)苷脂聚糖抗體信號(hào)高。Violin圖顯示,與對(duì)照組相比,Raybiotech和NIH新冠肺炎血清樣品的各種神經(jīng)節(jié)苷脂/糖脂具有高IgG信號(hào),每個(gè)點(diǎn)代表單個(gè)患者的數(shù)據(jù)。在可用的情況下,圖表還包括先前HIV患者抗聚糖抗體的研究數(shù)據(jù)。為了將高信號(hào)與健康對(duì)照的較大子集進(jìn)行比較,虛線表示比先前研究的220個(gè)對(duì)照樣本平均值高3 SD (A)格林巴利綜合癥相關(guān)神經(jīng)節(jié)苷脂(B)其他神經(jīng)節(jié)苷脂/糖脂。使用GlycoGlyph創(chuàng)建聚糖結(jié)構(gòu)。
對(duì)來(lái)自NIH隊(duì)列的22名患者進(jìn)行長(zhǎng)期隨訪。在6個(gè)月的隨訪中,22名患者中共有4人出現(xiàn)感覺(jué)異常,這是格林巴利綜合癥常見(jiàn)癥狀?偟膩(lái)說(shuō),這些患者中有一人具有神經(jīng)節(jié)苷脂IgG自身抗體,包括Fuc-GM1、GD1b、GM1和GM2。第二名患者對(duì)Fuc-GM1具有高IgG?偟膩(lái)說(shuō),一名具有大量IgM自身抗體的患者經(jīng)歷了長(zhǎng)時(shí)間的皮膚剝落和脫發(fā)。還需要更多的研究來(lái)更詳細(xì)地評(píng)估這些關(guān)系。
InnoScan1100AL 芯片掃描儀
原文獻(xiàn)鏈接: https://academic.oup.com/pnasnexus/article/1/3/pgac062/6609787