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核酸提取解決方案具體實驗步驟

瀏覽次數(shù):2117 發(fā)布日期:2022-12-7  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

核酸提取

核酸提取是指將核酸(DNA和RNA)從細(xì)胞中提取出來的過程,基本包括細(xì)胞裂解(Lysis)、雜質(zhì)與產(chǎn)物分離(Precipitation)、清洗產(chǎn)物(Wash)及產(chǎn)物重懸(Resuspension)的過程。
 

提取的效果與產(chǎn)物質(zhì)量控制可以通過后續(xù)核酸濃度、純度測定來實現(xiàn)。根據(jù)原始樣品的種類和核酸產(chǎn)物后續(xù)的各種應(yīng)用目的,細(xì)胞裂解和核酸純化步驟有不同的處理方法和要求。
 


實驗室中的DNA提取

DNA提取過程最經(jīng)濟常用的方法為利用有機溶劑將裂解細(xì)胞后的蛋白雜質(zhì)變性沉降,使DNA溶于液相中,再離心分離,整個分離利用的是生物分子的可溶性差異。其他DNA提取方法還有無機法(鹽析法)、吸附法(微型柱)、磁珠法等。


案例:小鼠基因型判定實驗的模板DNA提取 

實驗步驟:

1.將1cm尾巴切段置于1.5mL微量離心管中,加入適量裂解液(Lysis buffer)和蛋白酶(Proteinase K)于55~65℃水浴過夜消化。

2.充分消化后的尾巴樣品加入沉淀液(Precipitation buffer)后用旋渦混勻器來使雜質(zhì)蛋白充分沉淀,雜質(zhì)沉淀后通過離心操作(如4℃,4000Xg,5min),取出溶有目標(biāo)DNA的上清液,丟棄雜質(zhì)沉淀。

3.上清液中加入100%異丙醇,小心顛倒離心管30~40次,便可以將產(chǎn)物DNA沉降。離心操作(4℃,10000Xg或12000rpm,10min)去除上清。

4.用75%乙醇洗滌兩次DNA產(chǎn)物,待乙醇充分揮發(fā)后,用水或TE緩沖液(Tris-EDTA buffer)收獲DNA模板產(chǎn)物。

進行后續(xù)的PCR擴增實驗前,可以使用Nanodrop儀器進行DNA濃度和純度的測定,提高PCR反應(yīng)的成功率。在PCR擴增實驗不順利的情況下,也可以進一步對DNA產(chǎn)品的完整度進行檢測。


室中的RNA提取實驗

RNA提取過程與DNA類似,也是通過裂解細(xì)胞后通過有機溶劑沉降雜質(zhì)的方法來分離RNA。但RNA的穩(wěn)定性比DNA低很多,因此RNA提取對溫度和污染清除的要求更高。實驗操作一般從以下幾個角度來提升成功率:降低RNA水解酶活性、提升RNA穩(wěn)定性、使RNA與DNA和蛋白分離、僅沉降RNA、有效去除DNA。


案例:總RNA提取 

實驗步驟與DNA提取類似,但有機溶劑的使用會有所不同。在首次離心后,混合物會分為三層,RNA溶于上層無色水相,而DNA和蛋白會處于中間層,組織殘渣等雜質(zhì)處于底層。 實驗步驟:1.向提取樣品中加入裂解液(如Trizol),裂解細(xì)胞與組織,室溫靜置5-8分鐘。2.充分混勻后離心(4℃,12000rpm,10min),取出上清液。3.向上清液中加入異丙醇沉降RNA,并離心(4℃,12000rpm,10min)棄去上清。4.用75%乙醇洗滌產(chǎn)物兩次,待乙醇揮發(fā)后加入RNase-free水溶解產(chǎn)物。
 
實驗中用到的耐思耗材和儀器
 


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