核酸提取
核酸提取是指將核酸(DNA和RNA)從細(xì)胞中提取出來的過程,基本包括細(xì)胞裂解(Lysis)、雜質(zhì)與產(chǎn)物分離(Precipitation)、清洗產(chǎn)物(Wash)及產(chǎn)物重懸(Resuspension)的過程。
實驗室中的DNA提取
DNA提取過程最經(jīng)濟常用的方法為利用有機溶劑將裂解細(xì)胞后的蛋白雜質(zhì)變性沉降,使DNA溶于液相中,再離心分離,整個分離利用的是生物分子的可溶性差異。其他DNA提取方法還有無機法(鹽析法)、吸附法(微型柱)、磁珠法等。
案例:小鼠基因型判定實驗的模板DNA提取
實驗步驟:
1.將1cm尾巴切段置于1.5mL微量離心管中,加入適量裂解液(Lysis buffer)和蛋白酶(Proteinase K)于55~65℃水浴過夜消化。
2.充分消化后的尾巴樣品加入沉淀液(Precipitation buffer)后用旋渦混勻器來使雜質(zhì)蛋白充分沉淀,雜質(zhì)沉淀后通過離心操作(如4℃,4000Xg,5min),取出溶有目標(biāo)DNA的上清液,丟棄雜質(zhì)沉淀。
3.上清液中加入100%異丙醇,小心顛倒離心管30~40次,便可以將產(chǎn)物DNA沉降。離心操作(4℃,10000Xg或12000rpm,10min)去除上清。
4.用75%乙醇洗滌兩次DNA產(chǎn)物,待乙醇充分揮發(fā)后,用水或TE緩沖液(Tris-EDTA buffer)收獲DNA模板產(chǎn)物。
進行后續(xù)的PCR擴增實驗前,可以使用Nanodrop儀器進行DNA濃度和純度的測定,提高PCR反應(yīng)的成功率。在PCR擴增實驗不順利的情況下,也可以進一步對DNA產(chǎn)品的完整度進行檢測。
室中的RNA提取實驗
RNA提取過程與DNA類似,也是通過裂解細(xì)胞后通過有機溶劑沉降雜質(zhì)的方法來分離RNA。但RNA的穩(wěn)定性比DNA低很多,因此RNA提取對溫度和污染清除的要求更高。實驗操作一般從以下幾個角度來提升成功率:降低RNA水解酶活性、提升RNA穩(wěn)定性、使RNA與DNA和蛋白分離、僅沉降RNA、有效去除DNA。
案例:總RNA提取
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