穩(wěn)定同位素標(biāo)記 SILAC 技術(shù)實驗流程簡介
瀏覽次數(shù):9294 發(fā)布日期:2019-1-10
來源:輝駿生物
一、SILAC概述
SILAC即細(xì)胞培養(yǎng)條件下穩(wěn)定同位素標(biāo)記技術(shù)(Stable isotope labeling with amino acids in cell culture,SILAC),其基本原理是在細(xì)胞培養(yǎng)時,采用含有輕、中、重同位素型必需氨基酸的培養(yǎng)基進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng),用于SILAC主要的穩(wěn)定同位素氨基酸是Lys和Arg, 細(xì)胞在傳代培養(yǎng)過程中同位素氨基酸將被細(xì)胞用于合成蛋白質(zhì),細(xì)胞經(jīng)傳代培養(yǎng)5-6代后,細(xì)胞的所有蛋白質(zhì)將被同位素標(biāo)記,等量混合標(biāo)記的蛋白質(zhì)后經(jīng)過SDS-PAGE分離和質(zhì)譜分析,通過比較一級質(zhì)譜圖中三個同位素型肽段的面積大小進(jìn)行相對定量,同時二級譜圖對肽段進(jìn)行序列測定從而鑒定蛋白質(zhì)。
由于
SILAC標(biāo)記技術(shù)是體內(nèi)標(biāo)記技術(shù),幾乎不影響細(xì)胞的功能,同時靈敏度高,因此其在蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)領(lǐng)域中得到了廣泛的應(yīng)用,如比較蛋白質(zhì)組學(xué),蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用,蛋白質(zhì)與DNA相互作用,蛋白質(zhì)與RNA相互作用等領(lǐng)域。
二、與體外標(biāo)記技術(shù)相比,輝駿生物SILAC屬于體內(nèi)標(biāo)記,具有以下技術(shù)優(yōu)勢
1、高通量,可同時鑒定并定量數(shù)百至數(shù)千種蛋白質(zhì);
2、定量精確,降低由于樣品制備不同而造成的實驗差異;
3、線性定量范圍廣;
4、靈敏度更高,蛋白質(zhì)需要量明顯減少;
5、標(biāo)記采用的是體內(nèi)標(biāo)記技術(shù),更接近樣品真實狀態(tài)。
三、輝駿生物SIALC技術(shù)服務(wù)流程
四、輝駿生物SILAC技術(shù)服務(wù)內(nèi)容
1、細(xì)胞同位素標(biāo)記;
2、樣本制備與定量;
3、SDS-PAGE分離;
4、胰酶酶切后液相分離和質(zhì)譜分析;
5、數(shù)據(jù)庫檢索;蛋白質(zhì)定量分析;
6、相關(guān)生物信息學(xué)分析;
7、實驗報告提交。
五、送樣須知
1、技術(shù)咨詢:在您開始實驗之前,本公司將為您竭誠提供最有效的SILAC實驗設(shè)計方案,本公司提供Lys和Arg均為L、M 、H標(biāo)記的氨基酸。
2、為了保證SILAC實驗?zāi)茼樌M(jìn)行,樣品寄送需滿足以下要求:
基本要求:SILAC實驗僅適用于能在SILAC培養(yǎng)基中培養(yǎng)的材料,具體情形請咨詢本公司。
運輸要求:液氮或干冰保存寄送,廣州本地客戶可上門收樣。
注:樣本應(yīng)避免各類污染和反復(fù)凍融。
六、輝駿生物實驗報告內(nèi)容
1、
蛋白質(zhì)鑒定和
SILAC定量分析結(jié)果;
2、顧客指定蛋白質(zhì)對應(yīng)的質(zhì)譜峰圖;
3、SILAC實驗完整的實驗步驟、使用儀器、軟件檢索參數(shù)等。
七、輝駿生物質(zhì)量承諾
1、嚴(yán)謹(jǐn)?shù)腟ILAC實驗設(shè)計方案確保定量分析結(jié)果可靠;
2、提供客觀的SILAC實驗分析結(jié)果。