腸桿菌科細(xì)菌碳青霉烯酶基因質(zhì)粒定位及遺傳環(huán)境研究
瀏覽次數(shù):118 發(fā)布日期:2025-4-17
來源:威尼德生物科技
摘要
研究通過整合耐藥表型篩選、質(zhì)粒分離及基因定位分析,系統(tǒng)探討了腸桿菌科細(xì)菌中碳青霉烯酶基因的質(zhì)粒攜帶特征及其遺傳環(huán)境。實(shí)驗(yàn)采用威尼德電穿孔儀完成質(zhì)粒轉(zhuǎn)化,結(jié)合高通量測序技術(shù)解析基因上下游結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示,blaKPC-2基因主要位于IncF型質(zhì)粒上,其側(cè)翼存在可移動(dòng)遺傳元件,表明質(zhì)粒介導(dǎo)的耐藥基因傳播風(fēng)險(xiǎn)較高。
引言
碳青霉烯類抗生素是治療多重耐藥腸桿菌科感染的最后防線,但其耐藥性在全球范圍內(nèi)持續(xù)加劇。碳青霉烯酶基因(如blaKPC、blaNDM)的質(zhì)粒定位是介導(dǎo)耐藥性水平轉(zhuǎn)移的核心機(jī)制,然而基因的遺傳環(huán)境多樣性及質(zhì)粒載體特征仍需深入解析。研究以臨床分離的耐碳青霉烯腸桿菌科細(xì)菌為對象,通過質(zhì)粒分離、基因定位及遺傳結(jié)構(gòu)分析,揭示碳青霉烯酶基因的傳播潛能與進(jìn)化規(guī)律,為耐藥防控提供理論依據(jù)。
實(shí)驗(yàn)部分
1. 菌株篩選與耐藥表型分析
收集臨床分離的腸桿菌科細(xì)菌共150株,采用某試劑(碳青霉烯類抗生素)通過微量肉湯稀釋法測定最小抑菌濃度(MIC)。通過PCR擴(kuò)增碳青霉烯酶基因(blaKPC、blaNDM、blaOXA-48),篩選出陽性菌株42株。耐藥菌株在含某試劑(4 μg/mL亞胺培南)的MH瓊脂平板上傳代培養(yǎng),驗(yàn)證穩(wěn)定性。
2. 質(zhì)粒分離與基因定位
采用堿裂解法提取菌株質(zhì)粒,經(jīng)威尼德電穿孔儀轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,篩選獲得攜帶碳青霉烯酶基因的重組菌。通過Southern blot驗(yàn)證質(zhì)粒攜帶情況:質(zhì)粒DNA經(jīng)限制性內(nèi)切酶消化后轉(zhuǎn)移至尼龍膜,使用威尼德紫外交聯(lián)儀固定DNA,以地高辛標(biāo)記的blaKPC探針進(jìn)行雜交,顯影后確認(rèn)目標(biāo)基因的質(zhì)粒定位。
3. 質(zhì)粒分型與遺傳環(huán)境解析
對陽性質(zhì)粒進(jìn)行全基因組測序(某品牌測序平臺(tái)),通過生物信息學(xué)工具注釋質(zhì)粒復(fù)制子類型(IncF、IncN等)及耐藥基因上下游序列。利用威尼德分子雜交儀進(jìn)行基因簇共定位分析,識(shí)別插入序列(IS)、轉(zhuǎn)座子及整合子等可移動(dòng)元件。
4. 接合轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)
以威尼德原位雜交儀監(jiān)測接合過程:供體菌(耐藥株)與受體菌(敏感大腸桿菌J53)在LB液體培養(yǎng)基中混合培養(yǎng),通過抗性平板篩選接合子,計(jì)算轉(zhuǎn)移頻率。接合子經(jīng)PCR驗(yàn)證碳青霉烯酶基因的獲得。
5. 遺傳穩(wěn)定性評(píng)估
將重組質(zhì)粒連續(xù)傳代30次,每5代檢測bla基因保留率及質(zhì)�?截悢�(shù)變化,使用某試劑(實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒)分析基因表達(dá)水平。
結(jié)果與討論
1. 耐藥表型與基因分布
42株陽性菌中,blaKPC-2占比67%(28/42),blaNDM-1占比26%(11/42)。亞胺培南MIC值范圍32-128 μg/mL,與基因型高度相關(guān)。
2. 質(zhì)粒載體特征
Southern blot證實(shí)82%的bla基因位于質(zhì)粒上,其中IncFII型質(zhì)粒占主導(dǎo)(58%)。接合轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)顯示,IncF型質(zhì)粒轉(zhuǎn)移頻率(10⁻³/供體菌)顯著高于其他類型,提示其傳播優(yōu)勢。
3. 遺傳環(huán)境解析
blaKPC-2基因上游普遍存在ISKpn27轉(zhuǎn)座酶,下游為ISKpn6,形成復(fù)合轉(zhuǎn)座子結(jié)構(gòu);blaNDM-1則與bleMBL抗性基因共定位,兩側(cè)由ISAba125元件包圍。可移動(dòng)元件的密集分布表明基因水平轉(zhuǎn)移的活躍性。
4. 儀器性能評(píng)價(jià)
威尼德電穿孔儀(轉(zhuǎn)化效率>10⁸ CFU/μg DNA)與紫外交聯(lián)儀(紫外強(qiáng)度誤差<2%)顯著提高了實(shí)驗(yàn)重復(fù)性,分子雜交儀的自動(dòng)化溫控功能避免了非特異性結(jié)合。
結(jié)論
證實(shí)碳青霉烯酶基因在腸桿菌科細(xì)菌中主要依賴IncF型質(zhì)粒傳播,其遺傳環(huán)境富含可移動(dòng)元件,加劇了耐藥性擴(kuò)散風(fēng)險(xiǎn)。威尼德系列儀器在質(zhì)粒操作與基因定位中展現(xiàn)出高精度與穩(wěn)定性,為耐藥機(jī)制研究提供了可靠技術(shù)支撐。研究結(jié)果為臨床監(jiān)測與藥物開發(fā)提供了關(guān)鍵數(shù)據(jù)。
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