Arrayjet生物芯片點(diǎn)樣儀和Innopsys生物芯片掃描儀助力EZH2基因在肺癌發(fā)生機(jī)制中的研究
EZH2(Enhancer of Zeste Homolog 2)是PRC2(Polycomb Repressive Complex 2,多梳抑制復(fù)合體2)的一個(gè)亞基,可對(duì)催化組蛋白H3的27位賴氨酸K27進(jìn)行甲基化修飾,具有轉(zhuǎn)錄抑制的作用。目前相當(dāng)比例的非小細(xì)胞肺癌臨床病患中出現(xiàn)了EZH2過(guò)表達(dá)的情況,一些研究也證實(shí)了EZH2 驅(qū)動(dòng)的癌細(xì)胞代謝重編程可誘發(fā)腫瘤發(fā)生和惡化。然而現(xiàn)有研究多基于2D細(xì)胞培養(yǎng)模型而非3D立體結(jié)構(gòu),無(wú)法充分評(píng)估腫瘤微環(huán)境的各種影響。
美國(guó)肯塔基大學(xué)環(huán)境與系統(tǒng)生物化學(xué)中心的研究團(tuán)隊(duì)于2023年11月在《The Journal of Biological Chemistry》雜志發(fā)表了文章《Metabolic reprogramming driven by EZH2 inhibition depends on cell–matrix interactions》。在該項(xiàng)研究中,作者利用A549細(xì)胞分別構(gòu)建2D和3D細(xì)胞模型,并轉(zhuǎn)染病毒knock down EZH2基因,對(duì)細(xì)胞在降低EZH2基因表達(dá)水平后在不同模型中的差異評(píng)估。
1.在A549細(xì)胞中轉(zhuǎn)染 shGFP、A6 或 A9 病毒,構(gòu)建EZH2 knock down細(xì)胞(shGFP為對(duì)照組,A6或A9為knock down(kd)組)。
2.構(gòu)建細(xì)胞模型:水凝膠中構(gòu)建EZH2 kd的3D細(xì)胞模型 ,液體培養(yǎng)基構(gòu)建貼壁2D細(xì)胞模型。
3.免疫熒光染色和同位素示蹤法評(píng)估細(xì)胞生長(zhǎng)情況。
4.裂解、提取細(xì)胞蛋白,使用Arrayjet 生物芯片點(diǎn)樣儀點(diǎn)印在硝酸纖維素玻片上,制成反向蛋白陣列(RPPA)芯片,封閉后用染色試劑雜交。通過(guò)法國(guó)Innopsys公司的innoScan 710 AL生物芯片掃描儀獲取雜交后的芯片數(shù)據(jù),用Innopsys的Mapix軟件分析結(jié)果。
1.EZH2 kd 對(duì)2D 模型中細(xì)胞侵襲能力的影響較;而在3D 球體模型中, EZH2 kd則能夠顯著降低細(xì)胞的侵襲能力。
2.EZH2 kd在3D細(xì)胞模型中抑制糖酵解過(guò)程,并增強(qiáng)克雷布斯循環(huán)循環(huán)和γ-氨基丁酸代謝,但在 2D 細(xì)胞模型中無(wú)顯著效果。(圖1)
3.EZH2 kd在3D細(xì)胞模型中會(huì)引起磷酸戊糖途徑和嘌呤核苷酸的補(bǔ)救合成,但在2D模型中無(wú)明顯類似效果。
4.總體上,EZH2 kd會(huì)抑制2D肺癌細(xì)胞生長(zhǎng),但對(duì)于3D球狀細(xì)胞生長(zhǎng)卻具有相反作用。
圖1 EZH2 knock down在3D細(xì)胞球模型中增強(qiáng)克雷布斯循環(huán)循環(huán)和γ-氨基丁酸代謝,抑制糖酵解過(guò)程,但對(duì)于2D細(xì)胞模型無(wú)明顯效果
本研究說(shuō)明,EZH2 對(duì) A549 細(xì)胞的生長(zhǎng)及相關(guān)中央代謝網(wǎng)絡(luò)的調(diào)節(jié)程度取決于細(xì)胞-細(xì)胞和細(xì)胞-基質(zhì)的相互作用。與2D細(xì)胞模型相比,EZH2抑制了在 3D 球狀體中引發(fā)的克雷布斯循環(huán)循環(huán)、γ-氨基丁酸代謝和嘌呤核苷酸的補(bǔ)救合成,這與它在 3D 球狀體中的最終觀察結(jié)果一致。因此EZH2不僅通過(guò)已知的甲基化方式沉默基因,而且也通過(guò)改變細(xì)胞外基質(zhì)和調(diào)節(jié)腫瘤微環(huán)境來(lái)影響癌癥發(fā)展,需要在未來(lái)的研究中予以重視。
Arrayjet位于英國(guó)愛(ài)丁堡,專注于提供生物芯片應(yīng)用領(lǐng)域的解決方案及服務(wù)。自2000年公司成立即致力于開(kāi)發(fā)新型生物樣品噴點(diǎn)方案–噴墨式液體處理平臺(tái),該系統(tǒng)于2006年上市,目前用戶遍布全球27個(gè)國(guó)家。
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Innopsys 成立于1999年?偛课挥诜▏(guó),一直致力于生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域相關(guān)儀器和軟件的自主研發(fā)和生產(chǎn)。Innoscan系列掃描儀,采用先進(jìn)的共聚焦PMT檢測(cè)器和多激光掃描光路,可以同時(shí)進(jìn)行多通道熒光檢測(cè)。不僅有效降低了熒光光漂白現(xiàn)象以及信號(hào)損失,還可以有效縮短掃描時(shí)間。在基因組和蛋白組表達(dá),基因突變,SNP檢測(cè),CGH,細(xì)菌病毒檢測(cè),腫瘤特異性標(biāo)志篩查,病理組織篩查等方面都有非常廣泛的應(yīng)用。
環(huán)亞生物,生命科學(xué)產(chǎn)品全國(guó)性代理商,不斷把國(guó)外頂級(jí)的創(chuàng)新產(chǎn)品引入中國(guó)。環(huán)亞生物具備完善的公司運(yùn)營(yíng)、產(chǎn)品管理、營(yíng)銷、售前技術(shù)支持和售后維修體系。環(huán)亞生物作為Innopsys芯片分析儀和Arrayjet芯片點(diǎn)樣儀大中華區(qū)代理商,負(fù)責(zé)Innopsys和Arrayjet產(chǎn)品大中華區(qū)的營(yíng)銷和售后支持。
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