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DSP技術(shù)識別肺動脈高壓血管病變的獨特分子特征

瀏覽次數(shù):466 發(fā)布日期:2024-9-5  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負

近日,科羅拉多大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員在Am J Respir Crit Care Med(IF19.3)上發(fā)表了題為Digital Spatial Profiling Identifies Distinct Molecular Signatures of Vascular Lesions in Pulmonary Arterial Hypertension的文章。

特發(fā)性肺動脈高壓(IPAH)是一種嚴重的心肺疾病,其核心病理特征之一是肺動脈血管病變,導(dǎo)致血管狹窄和閉塞。IPAH血管病變的特征表現(xiàn)為4種病變類型:叢狀(Plx)和閉塞性(Oblit)病變、內(nèi)膜加中膜異常增生(IMH)以及外膜改變(Adv),這些病變分布在肌肉動脈(直徑< 80微米)和毛細血管前動脈(直徑< 70微米)。該文章通過數(shù)字空間分析(DSP)技術(shù)識別11個IPAH患者肺和5個對照肺血管病變的分子特征,從而為IPAH的診斷和治療提供新的生物標志物。

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IPAH肺血管病變組織類型及DSP樣本信息

  
01 結(jié)論


1. IPAH與對照肺動脈間的差異基因表達

通過DSP空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)對11個IPAH患者肺和5個對照肺動脈進行分析,共挑選了IPAH 149個ROIs,對照組62個ROIs;8273個檢測到的轉(zhuǎn)錄本的主成分分析顯示,IPAH病變與對照肺動脈不同地聚集,具有一定程度的重疊。IPAH組與對照組肺動脈ROI之間的最顯著差異表達基因為編碼抗氧化劑谷胱甘肽過氧化物酶(GPX3)和免疫球蛋白重鏈G4 (IGHG4)。與對照ROIs相比,IPAH ROIs顯著富集TGFβ和TNFα信號、氧化應(yīng)激、凋亡和缺氧等通路。
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IPAH與對照肺動脈的差異基因

 
2. 四種肺血管病變的差異基因表達


比較四個肺血管病變與對照組的基因表達結(jié)果顯示,Plx組有108個獨特表達基因,涉及炎癥、血管生成、內(nèi)皮細胞功能以及先天和獲得性免疫等。Adv組顯示 84個獨特表達基因。其中22個差異表達的基因在所有IPAH病變類型中共有,包括免疫球蛋白、HLA和JUN等。

Plx組中組織相容性白細胞抗原(HLA)-B、胰島素生長因子結(jié)合蛋白(IGFBP)-4兩個基因的表達最高。與 Oblit,、IMH和Plx組相比,Adv組病變中補體因子D (CFD)表達最高,CFD是一種激活補體旁路C3的中樞轉(zhuǎn)化酶,這支持了補體在肺動脈高壓血管周圍炎癥中的潛在作用。隨后利用免疫組織化學(xué)也驗證了差異表達的基因。

img3四種肺血管病變的差異基因表達和免疫組化驗證

 
3. IPAH和對照肺動脈間的細胞類型分布


使用人類肺細胞圖譜數(shù)據(jù)來推斷每個ROI中內(nèi)皮細胞、平滑肌細胞、肌成纖維細胞、周細胞、巨噬細胞、肺泡II型和I型細胞的組成。與Oblit或IMH 組相比,在Plx和Adv組中內(nèi)皮細胞數(shù)量增加。Adv組中還含有大量外膜成纖維細胞和肌成纖維細胞。平滑肌細胞在Oblit和IMH組中居多。
 
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IPAH和對照肺動脈的細胞類型

 
4. 四種病變類型中遺傳性肺動脈高壓相關(guān)基因的表達


隨后研究了編碼23個遺傳性PAH相關(guān)基因的表達模式。在IPAH病變樣本中發(fā)現(xiàn)有13種基因表達,包括非TGFβ相關(guān)基因和TGFβ家族突變基因endoglin (ENG)、ACVRL1、BMPR2和SMAD4。Plx組中表達13個基因,其中ENG的表達量高。
 
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遺傳性肺動脈高壓基因的表達

 
02 總結(jié)


該研究利用DSP空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),證明叢狀(Plx)和IPAH外膜病變(Adv)與內(nèi)膜加中膜異常增生(IMH)和閉塞性(Oblit)病變相比,有更多的異常表達基因。Plx組富含干擾素和TNFα信號以及血管生成、TGFβ家族、上皮/內(nèi)皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)換和缺氧途徑參與炎癥等基因。Adv組富含炎癥標記物,特別是與補體激活相關(guān)的。這些證據(jù)表明肺血管結(jié)構(gòu)細胞和炎性細胞之間的關(guān)聯(lián)導(dǎo)致存在自體免疫和獲得性免疫,從而導(dǎo)致IPAH發(fā)病。這些發(fā)現(xiàn)為IPAH的研究提供了一個豐富的數(shù)據(jù)集,可以幫助設(shè)計新的治療靶點及開發(fā)新的治療手段。

來源:上海生物芯片有限公司
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