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多肽合成儀CarboMAX™ 應(yīng)用:在提高的溫度下增強(qiáng)的肽偶聯(lián)

瀏覽次數(shù):867 發(fā)布日期:2024-5-13  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
01  概述 Summary

CarboMAX 是一種創(chuàng)新的專禾刂偶聯(lián)技術(shù),專為高溫下的肽鏈合成而設(shè)計(jì)。該技術(shù)相較于現(xiàn)行的碳二亞胺方法,提供了更快的反應(yīng)激活速度,和減少相應(yīng)的外消旋化,從而顯著提升了合成效率。此外,CarboMAX 在高溫條件下增強(qiáng)了對(duì)酸敏感連接物的穩(wěn)定性,特別對(duì)于磷酸肽、糖肽的合成,以及在超酸敏感鏈接劑上進(jìn)行肽鏈合成時(shí),這一特性尤其有利。

02  引言 Introduction

近期研究表明,在 90°C 的條件下,利用高效固相肽合成過(guò)程(HE-SPPS)進(jìn)行的原位碳二亞胺激活可以實(shí)現(xiàn)快速且高效的肽偶聯(lián)。HE-SPPS 避免了使用基于季銨鹽的方法(例如 HCTU 和 HATU)時(shí)所需的大量強(qiáng)堿,從而減少了顯著的外消旋化問(wèn)題(特別是對(duì)于半胱氨酸),以及由于d-內(nèi)酰胺形成而導(dǎo)致的精氨酸缺失。CarboMAX 偶聯(lián)方法通過(guò)對(duì)現(xiàn)有碳二亞胺方法的兩個(gè)主要改進(jìn),進(jìn)一步提升了合成效果:

(i) 提升粗制品純度與減少外消旋化:

CarboMAX 通過(guò)提高相對(duì)于氨基酸的碳二亞胺用量(2當(dāng)量),加速了必要的O-;愲寮せ钪虚g體的形成,這一過(guò)程在碳二亞胺激活中通常較為緩慢。O-;愲逍纬傻乃俾试黾,使得偶聯(lián)步驟早期即可獲得更多的激活氨基酸。因此,實(shí)現(xiàn)了更快的偶聯(lián)速度,并相應(yīng)地降低了外消旋化的發(fā)生。在眾多實(shí)例中,CarboMAX 的應(yīng)用顯著提升了粗制品的純度。

(ii) 避免酸敏感官能團(tuán)/接頭的非期望裂解:

與碳二亞胺化學(xué)反應(yīng)配合使用的激活劑(如Oxyma Pure)具有酸性,可能在高溫下過(guò)早地移除酸敏感基團(tuán)。CarboMAX 方法通過(guò)使用少量的堿(相對(duì)于激活氨基酸 0.4 當(dāng)量的 DIEA)來(lái)穩(wěn)定這些酸敏感連接體。這些堿的用量足夠低,不會(huì)干擾激活過(guò)程,同時(shí)保持外消旋化降至蕞低。

03 材料與方法 Materials and Methods

試劑

所有標(biāo)準(zhǔn)的 Fmoc 氨基酸均購(gòu)自 CEM 公司(位于北卡羅來(lái)納州的馬修斯),包含以下側(cè)鏈保護(hù)基團(tuán):Arg(Pbf),Asn(Trt),Asp(OMpe),Cys(Trt),Gln(Trt),Glu(OtBu),His(Trt),Lys(Boc),Ser(tBu),Thr(tBu),Trp(Boc)和Tyr(tBu)。磷酸化氨基酸 Fmoc-Ser(PO(OBzl)OH)-OH和Fmoc-Thr(PO(OBzl)OH)-OH,Oxyma Pure 以及 Rink Amide ProTideTM LL 樹(shù)脂也購(gòu)自 CEM 公司(位于北卡羅來(lái)納州的馬修斯)。Fmoc-Thr(β-D-GlcNAc(Ac)3)-OH和Fmoc-Lys(palmitoyl-Glu-OtBu)-OH 購(gòu)自 Bachem(瑞士)。N,N-二異丙基碳二亞胺(DIC),N,N-二異丙基乙胺(DIEA),哌啶,三氟乙酉夋(TFA),3,6-二氧雜-1,8-辛二硫醇(DODT),三異丙基硅烷(TIS)和乙酸購(gòu)自 Sigma-Aldrich(密蘇里州圣路易斯)。二氯甲烷(DCM),N,N-二甲基甲酰胺(DMF)和無(wú)水乙酉迷(Et2O)購(gòu)自VWR(賓夕法尼亞州西切斯特)。HPLC級(jí)水(H2O)和HPLC級(jí)乙腈(MeCN)購(gòu)自Fisher Scientific(馬薩諸塞州沃爾瑟姆)。

肽合成

肽的制備采用 0.05 或 0.1 毫摩爾規(guī)模,使用 CEM Liberty Blue™ 自動(dòng)化微波肽合成儀,在 0.18 毫摩爾/克的 Rink Amide ProTide LL 樹(shù)脂(CEM零件號(hào)R002)上進(jìn)行,除非另有說(shuō)明。去保護(hù)反應(yīng)使用含有20% 哌啶的 DMF 進(jìn)行。偶聯(lián)反應(yīng)使用 5 當(dāng)量的氨基酸,以 Fmoc-AA-OH/DIC/Oxyma Pure 在 DMF 中進(jìn)行。切割步驟使用 CEM Razor 高通量肽切割系統(tǒng),在升高的溫度下用 TFA/H2O/TIS/DODT 進(jìn)行 30 分鐘。切割后,肽在冷乙酉迷中沉淀并過(guò)夜凍干。

肽分析

肽的分析在配備有 PDA 檢測(cè)器的 Waters Acquity UPLC 系統(tǒng)上進(jìn)行,該系統(tǒng)裝配了 Acquity UPLC BEH C8 柱(1.7 mm 和 2.1 x 100 mm)。UPLC 系統(tǒng)連接到 Waters 3100 Single Quad MS 以進(jìn)行結(jié)構(gòu)鑒定。峰分析通過(guò) Waters MassLynx 軟件實(shí)現(xiàn)。分離采用含有0.05% TFA 的 (i) H2O 和 (ii) MeCN 的梯度洗脫進(jìn)行。

04 結(jié)果 Results

通過(guò)采用 CarboMAX 策略(即相對(duì)于氨基酸使用 2 當(dāng)量的 DIC),相較于傳統(tǒng)的 1 當(dāng)量使用,顯著提升了肽的純度。

這一改進(jìn)在 8 種矢口名肽的合成過(guò)程中得到了驗(yàn)證,這些肽分別采用了標(biāo)準(zhǔn)碳二亞胺化學(xué)方法和 CarboMAX 策略進(jìn)行合成(見(jiàn)表1;圖1至6)。關(guān)鍵的是,在使用過(guò)量碳二亞胺的過(guò)程中,并未發(fā)現(xiàn)不良封端現(xiàn)象。

表1. 通過(guò)應(yīng)用 CarboMAX 偶聯(lián)方法改善了肽的純度

粗純度

(標(biāo)準(zhǔn))

粗純度 (CarboMAX)

Thymosin

63%

75%

GRP

62%

74%

Bivalirudin

80%

82%

1-34PTH

67%

85%

35-55MOG

77%

91%

Magainin 1

71%

79%

Dynorphin A

74%

82%

Liraglutide*

74%

88%

*用~0.32 mmol/g Fmoc-Gly-Wang PS樹(shù)脂合成

通過(guò)優(yōu)化O-;愲宓男纬蛇^(guò)程,CarboMAX 技術(shù)能夠迅速供應(yīng)更高濃度的活性氨基酸。這一優(yōu)勢(shì)對(duì)于縮短敏感酯類物質(zhì)在后續(xù);磻(yīng)前的存活時(shí)間至關(guān)重要。為了證實(shí)此效果,研究人員采用了水解、繼之衍生化以及氣相色譜(由 C.A.T. GmbH 執(zhí)行)等手段,對(duì) Liraglutide 序列中各氨基酸的差向異構(gòu)水平進(jìn)行了深入分析。表 2 的數(shù)據(jù)明顯顯示,在使用 CarboMAX 的過(guò)程中觀察到的差向異構(gòu)現(xiàn)象有減少的趨勢(shì),從而佐證了加速O-酰基異脲生成的理論。因此,相較于以往描述的任何高溫偶聯(lián)方法,CarboMAX 偶聯(lián)技術(shù)憑借其提升的偶聯(lián)效率和降低的差向異構(gòu)率,實(shí)現(xiàn)了更佳的粗制品純度。

表2. 利拉魯肽的差向異構(gòu)化水平

%-D 差向異構(gòu)體

2 分鐘 90 °C

標(biāo)準(zhǔn)

2 min-90 °C

CarboMAX

D-Ala

0.33

0.25

D-Arg

0.29

0.20

D-Asp

0.23

0.31

D-Glu

0.39

0.30

D-Ile

L-allo Ile

D-allo Ile

<0.10

<0.10

<0.10

<0.10

<0.10

<0.10

D-Leu

0.17

0.13

D-Lys

<0.10

0.10

D-Phe

0.20

0.16

D-Ser

0.16

0.12

D-Thr

L-allo Thr

D-allo Thr

<0.10

<0.10

<0.10

<0.10

<0.10

<0.10

D-Trp

0.24

<0.10

D-Tyr

0.12

0.11

D-Tyr

<0.10

<0.10

 

CarboMAX 策略的一個(gè)可選優(yōu)化是在氨基酸反應(yīng)中采用 0.4 當(dāng)量的堿。這一調(diào)整確保了在整個(gè)激活和偶聯(lián)過(guò)程中,DIEA(N,N-二異丙基乙胺)以催化量存在,有效地穩(wěn)固了酸敏感鍵合(詳見(jiàn)表 3)。該優(yōu)化最初通過(guò)應(yīng)用超酸敏感樹(shù)脂鏈接劑進(jìn)行了驗(yàn)證。在肽合成領(lǐng)域,運(yùn)用諸如2-Cl-三苯甲基、三苯甲基(Trt)以及 Cl-TCP 這類超酸敏感鏈接劑至關(guān)重要,它們促進(jìn)了受保護(hù)的肽段的縮合,防止了二酮哌口秦生成,規(guī)避了在樹(shù)脂裝載時(shí)的DMAP使用,并顯著減少了 C 端半胱氨酸殘基發(fā)生β消去的風(fēng)險(xiǎn)。

在 90°C 條件下,采用 DIC/Oxyma Pure 進(jìn)行的標(biāo)準(zhǔn)碳二亞胺偶聯(lián)反應(yīng)僅進(jìn)行了 2 分鐘,這導(dǎo)致了在三苯甲基樹(shù)脂連接劑上合成 ACP 肽的產(chǎn)率不盡人意。不過(guò),當(dāng)反應(yīng)中加入了 0.1 當(dāng)量的 DIEA 并在同樣的高溫下實(shí)施 CarboMAX 偶聯(lián)策略時(shí),不僅保護(hù)了三苯甲基連接劑的鍵穩(wěn)定性,還成功地將產(chǎn)率顯著提升,從原先的 38% 躍升至 96%。這一顯著的提升彰顯了 CarboMAX 偶聯(lián)方法在提高肽合成效率方面的優(yōu)越性。

表3. 使用高酸敏感型 Fmoc-Gly-NovaSyn TGT 樹(shù)脂合成ACP

偶聯(lián)溫度(°C)

偶聯(lián)時(shí)間(min)

激活

DIEA(當(dāng)量)

粗品純度(%)

粗品收率(%)

90

2

DIC/Oxyma Pure

0

90

38

90

2

DIC/Oxyma Pure

0.1

95

38

65-74ACP: VQAAIDYING

在高溫條件下,涉及磷酸氨基酸衍生物的合成反應(yīng)面臨著由β-消除引起的磷酰基團(tuán)丟失的風(fēng)險(xiǎn),這種風(fēng)險(xiǎn)在去保護(hù)和酸性切割過(guò)程中尤為顯著。此外,一旦磷酸氨基酸被引入到序列中,它所產(chǎn)生的顯著空間位阻會(huì)使得后續(xù)殘基的偶聯(lián)變得異常困難。采用 CarboMAX 偶聯(lián)方法并配合 0.4 當(dāng)量的 DIEA,研究成功合成了以 3 個(gè)磷酸氨基酸殘基為主的目標(biāo)磷酸肽,如圖 7a 所展示的成果。與此形成鮮明對(duì)比的是,未添加 DIEA 的合成實(shí)驗(yàn)未能檢測(cè)到目標(biāo)肽的存在(圖 7b)。

TpTGNGKPVECpSQPESSFKMpSFKR

圖7a. 使用 UPLC-MS 分析粗磷酸肽 0.4 等效 DIEA (CarboMAX)

圖7b. 粗磷酸肽的 UPLC-MS 分析(標(biāo)準(zhǔn)品)

 

此外,O-連接的糖基氨基酸含有可能在高溫碳二亞胺偶聯(lián)過(guò)程中斷裂的敏感鍵。通過(guò)采用 CarboMAX 偶聯(lián)技術(shù)并添加 0.4 當(dāng)量的 DIEA,實(shí)現(xiàn)了 MUC-1 糖肽的合成,粗品純度高達(dá) 72%,如圖 8 所示。值得一提的是,CarboMAX 方法僅需要使用 2 當(dāng)量的糖基氨基酸過(guò)量,這在考慮到糖基化氨基酸昂貴成本的情況下,顯著降低了材料費(fèi)用,經(jīng)濟(jì)效益顯著。

PAHGVT[β-D-GlcNAc(Ac)3]SAPDTRPAPGSTAP

圖8. 使用 UPLC-MS 分析粗 MUC-1 糖肽 0.4 等效 DIEA (CarboMAX)

05 結(jié)論 Conclusion

CarboMAX 方法通過(guò)微波輔助的固相肽合成技術(shù)實(shí)現(xiàn)了更快的偶聯(lián)反應(yīng)和較低的差向異構(gòu)化。對(duì)于昂貴或難以合成的氨基酸殘基,僅需使用 2 當(dāng)量即可有效進(jìn)行偶聯(lián)。此外,可選地加入催化量的 DIEA(0.4 當(dāng)量),有助于在高溫條件下預(yù)防酸敏感鍵的不必要斷裂,從而保護(hù)了肽鏈的完整性。

引用 References

(1) J. Collins, K. Porter, S. Singh and G. Vanier, “High-Efficiency Solid Phase Peptide Synthesis (HE-SPPS),” Org. Lett., vol. 16, pp. 940-943, 2014.

(2) Patent Pending: US15686719; EP17188963.7

(3) Patent Pending: US20160176918; EP3037430;JP2016138090; CN105713066; AU2017204172

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