TMT(Tandem Mass Tags)技術(shù)是蛋白質(zhì)組學研究中用于蛋白質(zhì)定量分析的一種先進方法。TMT標記涉及使用一系列重量不同的化學標簽,這些標簽可以結(jié)合到肽段的氨基末端和側(cè)鏈上。通過這種方法,可以同時處理多個樣本,然后將它們混合在一起進行質(zhì)譜分析。TMT技術(shù)允許多達16個不同的樣品同時進行定量分析,使其成為蛋白質(zhì)組學研究中的一個強大工具。這種技術(shù)的關(guān)鍵優(yōu)勢在于其能夠提供高通量、高靈敏度和高準確性的蛋白質(zhì)表達水平比較。TMT圖譜的特點和分析過程包括:
1.樣品標記:
TMT標記涉及將不同的化學標簽連接到樣品中的肽段上。每個標簽具有相同的質(zhì)量和結(jié)構(gòu),但在重同位素的組成上略有不同,從而在質(zhì)譜分析中產(chǎn)生不同的信號。
2.樣品混合和色譜分離:
標記后的樣品被混合在一起,然后通過液相色譜(LC)分離。
3.質(zhì)譜分析:
分離的肽段通過質(zhì)譜儀進行分析。在質(zhì)譜儀中,TMT標記的肽段首先產(chǎn)生前體離子信號,然后在碰撞誘導解離(CID)或高能碰撞解離(HCD)下分裂,產(chǎn)生獨特的標記離子。
4.定量分析:
TMT標記產(chǎn)生的報告離子在質(zhì)譜圖中用于定量分析。通過比較不同標簽的報告離子的強度,可以定量比較各個樣品中的蛋白質(zhì)表達水平。
5.數(shù)據(jù)處理和生物信息學:
數(shù)據(jù)處理包括對齊、峰識別、定量分析以及與蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫的匹配。
生物信息學分析用于鑒定蛋白質(zhì)、進行功能注釋和生物學通路分析。
圖1.基于TMT的蛋白質(zhì)組學服務(wù)工作流程
TMT技術(shù)的生物學意義
鑒定和定量后的數(shù)據(jù)用于進一步的生物信息學分析,如功能注釋、通路分析和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建。
這些分析有助于理解蛋白質(zhì)表達變化的生物學含義,如疾病機理、生物標志物的發(fā)現(xiàn)或藥物作用的研究。
TMT技術(shù)因其高度的靈敏度和適用于大規(guī)模比較分析的能力,在蛋白質(zhì)組學研究中越來越受到重視,特別是在疾病機理研究、藥物開發(fā)和生物標志物篩選等領(lǐng)域。