一、引言
當(dāng)提及生命科學(xué)、藥物研發(fā)這個(gè)時(shí)代的活動(dòng),我們離不開一個(gè)與之緊密相連的研究領(lǐng)域——蛋白質(zhì)組學(xué)。本文主要以非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué),尤其是4D-Label Free蛋白質(zhì)組學(xué)為核心,對(duì)蛋白定量,特別是解析細(xì)菌樣本中的蛋白質(zhì)的比較與分析進(jìn)行深入的論述。
二、簡(jiǎn)析非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)
非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)是通過蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析,無需使用疏水標(biāo)記或附帶熒光標(biāo)簽的方法,實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的定量和分析。這些不使用標(biāo)簽的方法的主要優(yōu)點(diǎn)在于其適應(yīng)性強(qiáng),可以用于從細(xì)胞、組織到血液樣品的寬泛樣本類型。
三、4D-Label Free蛋白質(zhì)組學(xué):概述
4D-Label Free蛋白質(zhì)組學(xué)是基于最先進(jìn)的高通量質(zhì)譜技術(shù)和算法的非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法。4D指的是四個(gè)維度:質(zhì)量、荷載、離子移動(dòng)度和時(shí)間。這種技術(shù)結(jié)合了液相色譜、離子遷移和四極桿-飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù),以實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的多維度定量,從而達(dá)到更高的分辨力和發(fā)現(xiàn)力。
四、非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)在解析細(xì)菌樣本中的應(yīng)用
細(xì)菌是豐富而重要的生物資源,其蛋白質(zhì)組學(xué)研究成為諸多學(xué)科研究中不可或缺的一環(huán)。非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)的出現(xiàn),特別是4D-Label Free蛋白質(zhì)組學(xué)的產(chǎn)生,極大地推動(dòng)了這一研究領(lǐng)域的發(fā)展。“無標(biāo)簽”帶來的是“無限可能”。
本方法在解析細(xì)菌樣本中的應(yīng)用首先包括基礎(chǔ)的細(xì)菌蛋白質(zhì)的無標(biāo)簽定量和分析。更進(jìn)一步,有研究者通過這種技術(shù)了解到細(xì)菌的表型,例如抵抗藥物、耐受環(huán)境壓力等,并利用這些信息來研發(fā)新型藥物或環(huán)保技術(shù)。
五、結(jié)論
非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)的應(yīng)用前景廣闊,不僅可以推動(dòng)基礎(chǔ)研究的發(fā)展,還有望帶動(dòng)應(yīng)用研究的推進(jìn)。而鑒于細(xì)菌中包含了豐富的蛋白質(zhì)資源,非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)在細(xì)菌蛋白質(zhì)分析中的應(yīng)用具有深遠(yuǎn)的意義。4D-Label Free蛋白質(zhì)組學(xué)作為非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)的最新技術(shù),將為蛋白質(zhì)組學(xué)研究和應(yīng)用帶來新的可能。
圖1