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產(chǎn)量和平行合成問(wèn)題、合成規(guī)模等介紹選擇多肽合成儀應(yīng)考慮的5個(gè)因素

瀏覽次數(shù):1121 發(fā)布日期:2023-12-6  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

選擇一臺(tái)能滿足您特定需求的多肽合成儀可能是一項(xiàng)艱巨的任務(wù)。以下是一些需要考慮的關(guān)鍵因素,以便能夠合成高質(zhì)量的多肽,并使其數(shù)量和規(guī)模與您的應(yīng)用相匹配。

01 產(chǎn)量和平行合成問(wèn)題

不同的應(yīng)用和研究階段需要不同數(shù)量的多肽。肽類藥物發(fā)現(xiàn)項(xiàng)目可能需要篩選數(shù)百(甚至數(shù)千)種肽來(lái)尋找目標(biāo)肽,然后利用構(gòu)效關(guān)系(SAR),最終確定一種可用于臨床的候選藥物。因此,成功的關(guān)鍵在于選擇一種合成儀,它的反應(yīng)容器要能提供與您的應(yīng)用相匹配的并行合成水平1。 
 


02 合成規(guī)模
研發(fā)過(guò)程的不同階段也需要不同數(shù)量的多肽。例如,隨著多肽療法從早期篩選到先導(dǎo)化合物的優(yōu)化和臨床前開(kāi)發(fā),所需數(shù)量也會(huì)增加。合適的多肽合成器可以滿足當(dāng)前的規(guī)模需求,甚至可以靈活地進(jìn)行擴(kuò)展升級(jí)以擴(kuò)大規(guī)模,可以滿足下一步的需求1
 


03 序列難度和多肽長(zhǎng)度
合成多肽可能會(huì)遇到許多基于序列的難題,例如某些殘基組合導(dǎo)致的聚集或二級(jí)結(jié)構(gòu)形成。要克服這些難題,就必須選擇一款能幫助您優(yōu)化合成的多肽合成儀。追求盡可能高的純度包括優(yōu)化許多參數(shù),如反應(yīng)時(shí)間、偶聯(lián)試劑的選擇、濃度、樹脂類型、溫度和結(jié)構(gòu)破壞殘基的位置2,3。


多通道合成儀儀器是并行測(cè)試不同參數(shù)的理想選擇。

加熱可加速化學(xué)反應(yīng)并提高許多困難序列的純度,這意味著具有可選加熱功能的儀器可成為首選系統(tǒng)。例如,感應(yīng)加熱可以獨(dú)立設(shè)置多個(gè)反應(yīng)容器的溫度,從而在尋找最佳合成條件時(shí)提供最大的靈活性 4,5
 


在合成高難度多肽時(shí),盡量減少試錯(cuò)的一種方法是使用實(shí)時(shí)紫外監(jiān)測(cè),而不是像大多數(shù)市售儀器那樣監(jiān)測(cè)廢液流。在反應(yīng)溶液混合時(shí)對(duì)其進(jìn)行監(jiān)測(cè)的合成器可對(duì)反應(yīng)時(shí)間進(jìn)行過(guò)程控制,從而大大提高產(chǎn)量和純度6
 

如果您合成的是長(zhǎng)肽,那么最大限度地提高每個(gè)步驟的反應(yīng)效率至關(guān)重要,因?yàn)榧词故俏⑿〉牡托Ш透狈磻?yīng)也會(huì)導(dǎo)致純度和產(chǎn)量的急劇下降。為了提高合成效率,一些儀器配備了流體系統(tǒng),可確保反應(yīng)步驟之間無(wú)死體積和無(wú)交叉污染,從而最大限度地減少固相多肽合成中的添加、刪除和其他常見(jiàn)副反應(yīng)。

04 對(duì)特殊化學(xué)的需求

您是要合成標(biāo)準(zhǔn)線性肽,還是要合成環(huán)肽、擬肽或其他擬肽化合物?您是否要使用 PNA、PMO 或寡聚物?環(huán)肽的合成通常需要使用特殊保護(hù)的氨基酸衍生物以及正交脫保護(hù)和環(huán)化反應(yīng)步驟。合成擬肽和其他類型的擬肽物以及 PNA、寡聚物和寡聚擬物都需要獨(dú)特的單體和試劑。制備這些類型的分子需要一臺(tái)在合成方案和氨基酸瓶位置方面具有最大靈活性的儀器。這就是為什么有些儀器在合成過(guò)程中使用多達(dá) 40 種氨基酸或其他單體,而不是將天然氨基酸限制在 20 個(gè)位置的原因。用于這些特殊化學(xué)反應(yīng)的許多單體和試劑可能非常昂貴或珍貴,因此有些合成儀還提供從任何氨基酸/單體瓶位進(jìn)行"Single-Shot"的功能,以確保不造成任何浪費(fèi)。
 

在某些情況下,特殊步驟可能會(huì)使用對(duì)空氣或濕氣敏感的催化劑,因此必須在惰性氮?dú)饣驓鍤猸h(huán)境下的封閉系統(tǒng)中進(jìn)行化學(xué)反應(yīng)。雖然目前大多數(shù) SPPS 都使用 Fmoc 保護(hù)氨基酸,但有些研究小組仍在使用 Boc 化學(xué),而在這種環(huán)境下使用的儀器必須與濃三氟乙酸 (TFA) 溶液兼容。因此,關(guān)鍵還在于選擇一款能靈活處理實(shí)驗(yàn)室所用特殊化學(xué)成分的多肽合成儀。

05 尋找能提供經(jīng)濟(jì)高效、面向未來(lái)的解決方案的合作伙伴,以滿足您的多肽合成需求
對(duì)于大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室和生產(chǎn)設(shè)施來(lái)說(shuō),購(gòu)買一臺(tái)多肽合成儀是一筆不小的開(kāi)支,需要根據(jù)投資回報(bào)率來(lái)進(jìn)行評(píng)估。該儀器預(yù)計(jì)可無(wú)憂運(yùn)行多年,并能提高團(tuán)隊(duì)的生產(chǎn)率。理想情況下,儀器應(yīng)具有滿足當(dāng)前和未來(lái)預(yù)期需求的靈活性。如果目前的預(yù)算有限,或者團(tuán)隊(duì)的需求發(fā)生了變化,應(yīng)該可以升級(jí)或提供以舊換新的價(jià)值,以換取功能或容量更強(qiáng)的系統(tǒng)。自始至終,您的儀器合作伙伴都應(yīng)為您提供支持,確保您能實(shí)現(xiàn)目標(biāo)。
 


 

自 20 世紀(jì) 80 年代以來(lái),Gyros Protein Technologies公司一直是自動(dòng)化 固相多肽合成(SPPS)領(lǐng)域的創(chuàng)新者,如今已成為世界領(lǐng)先的多肽合成儀器供應(yīng)商。所有儀器均采用專有的 PurePepTM Pathway 專利矩陣式液體傳輸技術(shù),以最大限度地提高純度并提供行業(yè)領(lǐng)先的可靠性。

為了滿足不同用戶的需求,Gyros Protein Technologies公司的合成儀提供不同級(jí)別的通量。例如,PurePep® Chorus一次可以合成1到6條多肽,而 Symphony® X 可以同時(shí)合成多達(dá) 24 條多肽。使用Symphony® X 采用快速方案合成的短肽甚至長(zhǎng)肽肽庫(kù)可在一夜之間制備完成,一周內(nèi)可生產(chǎn)多達(dá) 120 條肽。PurePep® Chorus和 Symphony® X均可使用 IntellisynthTM 系統(tǒng)進(jìn)行實(shí)時(shí)紫外監(jiān)測(cè),并提供加熱選項(xiàng)。


Gyros Protein Technologies公司的所有合成儀都可用于高效合成微摩爾級(jí)的多肽,根據(jù)序列的長(zhǎng)度,合成量可從幾毫克到 50 毫克左右不等。在這些系統(tǒng)中,每個(gè)反應(yīng)容器的最大刻度約為 1 mmol,這意味著在PurePep® Chorus和 Symphony® X上合成中等長(zhǎng)度的多肽,刻度分別超過(guò) 25 g和 100 g。如果您需要數(shù)百克的肽用于動(dòng)物實(shí)驗(yàn),那么 Sonata® + 的最大合成量可達(dá) 200 mmol左右。

普瑞麥迪(北京)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)有限公司是Gyros Protein Technologies公司中國(guó)區(qū)總代理,普瑞麥迪的員工在多肽化學(xué)領(lǐng)域擁有數(shù)十年的經(jīng)驗(yàn),可提供高水平的客戶服務(wù)和技術(shù)支持。普瑞麥迪一定是您值得信賴的多肽合成解決方案合作伙伴。


References
1.    Cyf Ramos-Colón, Daniel Martinez, Andrew Kennedy and James Cain. High-throughput parallel synthesis optimization of Glucagon-like Peptide 1 receptor agonists. Poster presented at EPS 2018
2.    Cyf Ramos-Colón, Daniel Martinez, Andrew Kennedy and James Cain. Turning up the heat on peptide purity. Chemistry Today – vol. 36(4) July/August 2018
3.    Daniel Martinez, Cyf Ramos-Colón, and James P Cain. Efficient synthesis of 84-mer human parathyroid hormone for the study of osteoporosis and hypoparathyroidism. Poster presented at APS 2017.
4.    James P. Cain, Daniel Martinez, and Cyf Ramos-Colón. Optimized crude purity of cyclic melanocortin receptor agonist Melanotan II using induction heating. Poster presented at German Peptide Symposium 2018
5.    Andrew Kennedy, Daniel Martinez, James Cain and Cyf Ramos-Colón. Fast solid phase peptide synthesis method development for the synthesis of complex peptides. Poster presented at German Peptide Symposium 2019
6.    Comparison of Alternative Deprotection Reagents to Piperidine for the Synthesis of a Poly-Alanine Peptide. Application Note #20
7.    Paramjit Arora and Ganesh Jedhe. Fully Automated Synthesis of Oxopiperazine Helix Mimics on Prelude® X. Application note #25
8.    Cyf Ramos-Colón, Daniel Martinez, and James P. Cain. Synthesis of [des-Arg7]-Dynorphin A peptoid analogue: faster methods using parallel automated synthesis and induction heat. Poster presented at Foldamers 2018
9.    James Cain, Daniel Martinez, Andrew Kennedy, and Cyf Ramos-Colón. Synthesis of therapeutic stapled peptides: Fully automated peptide cyclization via olefin metathesis, Poster presented at EPS 2018
10.  Cyf Ramos-Colón, Daniel Martinez, Andrew Kennedy, and James Cain. Parallel automated solid phase synthesis: efficient high-throughput optimization for therapeutic discovery and development of peptide nucleic acids. Poster presented at TIDES 2018

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