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在創(chuàng)新 HTRF 測(cè)定開發(fā)中采用低體積液體處理自動(dòng)化的成本效益分析

瀏覽次數(shù):680 發(fā)布日期:2023-10-10  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
介紹
 
免疫測(cè)定法的開發(fā)非常具有挑戰(zhàn)性,這是因?yàn)楂@得特定信號(hào)需要正確組合樣品和檢測(cè)底物。
 
多年來,Cisbio 開發(fā)了數(shù)百種測(cè)定方法。在本應(yīng)用說明中,我們將展示 MANTIS® 液體處理器及其大容量芯片更換器 (LC3) 配件如何幫助我們?cè)谝韵滤嘘P(guān)鍵點(diǎn)上改進(jìn)我們的工藝:可重復(fù)性、時(shí)間、成本和減少操作者肌肉骨骼疾病。在這里,我們將重點(diǎn)介紹兩種類型的均相時(shí)間分辨熒光 (HTRF)®檢測(cè)分析:生物標(biāo)志物和磷蛋白分析。 HTRF 將 TR-FRET(時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移)的熒光靈敏度、時(shí)間分辨率和低背景特性與 FRET(熒光共振能量轉(zhuǎn)移)的同質(zhì)性結(jié)合在一起。
 

圖 1. MANTIS 液體處理器 和 LC3
 
背景知識(shí)
 
HTRF 使用兩個(gè)熒光團(tuán),一個(gè)能量供體和一個(gè)能量受體,它們?cè)诒舜丝拷鼤r(shí)轉(zhuǎn)移能量。這創(chuàng)建了一種同質(zhì)的測(cè)定形式,其中結(jié)合和未結(jié)合的分子不需要分開,因?yàn)閬碜允荏w的熒光發(fā)射僅在分子結(jié)合時(shí)產(chǎn)生。
 
每種測(cè)定都使用夾心形式,其中兩種抗體用HTRF專用熒光團(tuán)標(biāo)記。生物標(biāo)志物檢測(cè)使用兩種對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)具有特異性的抗體(參見圖 2A),而磷蛋白分為兩種測(cè)定方法(參見圖2B)。其中第一個(gè)測(cè)定方法是磷酸化試劑盒,在試劑盒中一種抗體靶向磷酸化位點(diǎn),而另一種抗體靶向整個(gè)蛋白質(zhì)。
 
 

圖 2A. 生物標(biāo)志物測(cè)定的測(cè)定形式
 
 
圖 2B. 磷酸化和總測(cè)定的測(cè)定形式
 
磷蛋白測(cè)定中的第二個(gè)測(cè)定方法是總測(cè)定試劑盒,它使用兩種抗體靶向目標(biāo)蛋白上的兩個(gè)獨(dú)立表位。為了獲得一對(duì)功能正常的抗體配對(duì),我們通常篩選 10 種抗體用于生物標(biāo)志物測(cè)定。每種抗體都用熒光團(tuán)、穴狀化合物和d2標(biāo)記。HTRF 供體熒光團(tuán)穴狀化合物由稀土配合物組成,其中嵌入了鑭系離子,如銪或鋱,并產(chǎn)生 1 至 2 毫秒范圍內(nèi)的長壽命發(fā)射,這是時(shí)間分辨檢測(cè)的基本特征。d2 HTRF 受體由于其小尺寸和設(shè)計(jì),在免疫競(jìng)爭性測(cè)定中具有更高的穩(wěn)定性,并且在某些情況下會(huì)提高測(cè)定靈敏度。
 
對(duì)于磷酸化蛋白分析,我們測(cè)試了五種磷酸化抗體和五種總抗體。
 
為了測(cè)試這些抗體配對(duì),我們使用重組蛋白作為生物標(biāo)志物,使用細(xì)胞裂解物作為磷酸化蛋白。這些樣品中的每一個(gè)都被稀釋兩次以評(píng)估動(dòng)態(tài)范圍。這些稀釋會(huì)在最終用戶實(shí)施的培養(yǎng)基中進(jìn)行(例如,用于分泌生物標(biāo)志物的培養(yǎng)基,或用于細(xì)胞內(nèi)磷酸蛋白的裂解緩沖液)。由于HTRF使用同質(zhì)形式的一步檢測(cè)實(shí)驗(yàn)方案,因此緩沖區(qū)組成可能對(duì)信號(hào)產(chǎn)生巨大影響。因此,我們開發(fā)了 4 種裂解緩沖液來匹配任何抗體對(duì)去污劑的敏感性。
 
討論
 

在使用MANTIS之前,我們使用 384 孔板,一式三份。所有這些孔板加起來,其中1080 個(gè)孔將留給生物標(biāo)志物試劑盒 ,3360 個(gè)孔留給為磷酸化/總篩選。3 到 9 號(hào)之間的微孔板編號(hào) (見圖3)。
 
 
圖 3. 生物標(biāo)志物和磷/總測(cè)定的抗體配對(duì)匹配
 
此實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)不可能在一次操作中完成,而且最多需要 3 天才能進(jìn)行一次篩選。因?yàn)槎嗤ǖ酪埔浩鞑贿m合我們的操作,所以我們使用重復(fù)液體分配器完成這些操作,比如Eppendorf的Multipette。2 µL 精確分液的精度太低,板孔之間的交叉污染過多。
 
因此,對(duì)于單塊384 孔板,需要混合三種試劑,每塊板總共有 1152 次移液動(dòng)作。一年后,操作者的肌肉骨骼疾病成為了我們實(shí)驗(yàn)室的一個(gè)真正需要正視的問題。
 
由于 MANTIS 能夠分配到 1536 孔板形式中,因此我們能夠按比例縮小 1536 孔尺寸的測(cè)定體積。
 
我們能夠?qū)Ⅲw積從 16 µL 樣品和 2 µL 每種抗體減少到 4 µL 樣品和 0.5 µL 每種抗體,而不會(huì)造成任何損失。此外,由于MANTIS 分配 5 µL 比分配 4 µL 更快,我們選擇了它來完成我們的實(shí)驗(yàn)方案。(見 圖 4)
 



圖 4. HTRF測(cè)定在信號(hào)和變異系數(shù)方面的比例縮小
 
所以,我們準(zhǔn)備好了。使用 1536 孔板,一次完整的篩選只需要 1 到 3塊微孔板,每塊板只需大約 30 分鐘即可完成分配。這個(gè)時(shí)間還包含了自動(dòng)芯片清洗時(shí)間,在這段時(shí)間內(nèi)用戶可以自由地做其他事情。顯示實(shí)驗(yàn)設(shè)置的磷蛋白測(cè)定示例和結(jié)果如下所示 (見 圖 5)。
 
圖 5. 磷/總測(cè)定的最佳抗體配對(duì)結(jié)果示例
 
總結(jié)
 
在一年多的工作里我們對(duì)這些改進(jìn)進(jìn)行了總結(jié),這些總結(jié)包含了針對(duì)每種類型的至少十個(gè)項(xiàng)目,我們?cè)谠S多層面上節(jié)省了時(shí)間、金錢和大量的勞動(dòng)。
 
在使用MANTIS 之前,這些項(xiàng)目消耗了 130塊384 孔板。通過改用 1536 孔板,我們成功將消耗的板數(shù)量減少 75%。(見 圖 6A)。這一數(shù)量的板轉(zhuǎn)為總共分配的44400個(gè)板孔。 每個(gè)板孔需要三次分液,總共13.32萬次,這些全部由MANTIS操作完成,而非人工操作(見 圖 6B)。
 
 
圖 6. (A) 超過 20 個(gè)項(xiàng)目所使用的微孔版數(shù)量。
 (B) 手動(dòng)分配微孔板的數(shù)量。 
(C) 所用消耗品的成本。
(D) 使用的抗體量。
 (E) 最佳抗體配對(duì)篩選所用的時(shí)間。
 
由于 MANTIS 芯片被設(shè)計(jì)成能夠清潔和使用多達(dá) 100 萬次分液循環(huán),因此我們不必再擔(dān)心耗材成本 (見圖6C)。以前我們使用非常昂貴的重復(fù)分液器吸頭,但是,當(dāng)使用 MANTIS時(shí),我們只需要一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)吸頭來處理在使用時(shí)添加到芯片中的每種試劑。我們還減少了試劑浪費(fèi),因?yàn)橥ǔT嚬苤械乃荔w積可達(dá) 200 µL,但使用MANTIS,其死體積僅有 20 µL。再加上通過將 HTRF 試劑體積除以四來縮小我們的測(cè)定規(guī)模,我們節(jié)省了超過 1500 µg 的標(biāo)記抗體 (見圖 6D)。 
 
還通過在一次操作中進(jìn)行全面篩選,我們估計(jì)節(jié)省了 25 天的手動(dòng)工作量,這樣就不必拆分操作以便由研究人員手動(dòng)執(zhí)行(見圖6E)。手動(dòng)分配需要許多控制和校正步驟,而 MANTIS 提高了可靠性,且將誤差降至最低。
 
總之,MANTIS 正在成為我們實(shí)驗(yàn)室真正的游戲規(guī)則改變者。液體處理器使我們能夠在各個(gè)方面改進(jìn)我們的流程,考慮到一些我們熟知的不可能手動(dòng)執(zhí)行的操作,MANTIS會(huì)幫助到我們開辟新的可能性。
來源:富默樂國際貿(mào)易(上海)有限公司
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