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                                當(dāng)前位置 > 首頁 > 技術(shù)文章 > 舉例分享對(duì)黑膠蟲樣本進(jìn)行DNA測(cè)序鑒定其為細(xì)菌的依據(jù)

                                舉例分享對(duì)黑膠蟲樣本進(jìn)行DNA測(cè)序鑒定其為細(xì)菌的依據(jù)

                                瀏覽次數(shù):746 發(fā)布日期:2023-5-23  來源:absin

                                黑膠蟲污染是一個(gè)老生常談的話題。目前,科研界對(duì)黑膠蟲的污染特征沒有統(tǒng)一的判定標(biāo)準(zhǔn),通常污染特征總結(jié)有:

                                1)活躍游動(dòng)、旋轉(zhuǎn)梭動(dòng)或原地顫動(dòng)
                                2)呈桿狀、球狀、卵圓狀;

                                3)培養(yǎng)基不渾濁;

                                4)復(fù)蘇或傳代時(shí)往往會(huì)出現(xiàn)黑膠蟲污染,并且與細(xì)胞呈現(xiàn)此消彼長的現(xiàn)象。
                                 

                                我們對(duì)多個(gè)黑膠蟲樣本進(jìn)行測(cè)序鑒定,這里舉兩個(gè)典型鑒定結(jié)果給大家分享:


                                圖1 Sphingomonas(鞘氨醇單胞菌)單個(gè)及菌落圖
                                 

                                屬名 樣本2,15,21,27鑒定為Sphingomonas sp.(鞘氨醇單胞菌屬)
                                能否游動(dòng) 以單側(cè)生極性鞭毛運(yùn)動(dòng)
                                類別 G-菌
                                形狀 桿狀;菌落為黃色
                                大小 0.3-0.8 * 1.0-2.7µm
                                特點(diǎn) 該菌屬至今共有12個(gè)種,是一類豐富的新型微生物資源,可用于芳香化合物的生物降解,在環(huán)境保護(hù)及工業(yè)生產(chǎn)方面具有巨大的應(yīng)用潛力
                                分布范圍 河水、根際、地表及深層的地下的沉積物、海洋,甚至極地土壤中都有它們的蹤跡


                                圖2 Brevundimonas vesicularis(泡囊假單胞菌)單個(gè)及菌落圖
                                 

                                屬名 樣本4,19鑒定為Brevundimonas vesicularis(泡囊假單胞菌)屬于Brevundimonas sp.(短波單胞菌屬)
                                類別 G-菌
                                形狀 桿狀;菌落為圓形,凸起,表面濕潤光滑,邊緣整齊
                                大小 0.4-0.5X 1-2μm
                                代表種 泡囊短波單胞菌是一種較罕見的非發(fā)酵性病原性假單胞菌,在人體可引起肺炎、敗血癥、皮膚炎癥和壞死性蜂窩織炎等
                                分布范圍 通常存在于土壤、河流等自然界中


                                這些黑膠蟲樣本被鑒定為細(xì)菌。另外我們也查閱了大批文獻(xiàn),十幾年前就有人做了相關(guān)研究,很多都鑒定為細(xì)菌,例如以下這篇[1]:


                                圖3 客戶文獻(xiàn)截圖


                                這篇文章講述的是,首先從黑膠蟲污染細(xì)胞樣本中分離得到黑膠蟲,然后從黑膠蟲中提取基因組DNA進(jìn)行基因測(cè)序及分析,鑒定出的黑膠蟲為無色桿菌屬(Achromobacter)。
                                 

                                細(xì)菌已經(jīng)在地球上存在三十多萬年了,具有不同的形狀,根據(jù)形狀主要分為三類,即:球菌、桿菌和螺旋菌(包括弧菌、螺菌、螺桿菌)(圖4)。鞭毛是著生在細(xì)菌表面的絲狀運(yùn)動(dòng)器官。由于鞭毛很細(xì),只有用特殊的染色法,才能用光學(xué)顯微鏡觀察到。直徑12~25nm,長3~12μm,柔軟、波形(圖5)。


                                圖4 細(xì)菌模式圖和細(xì)菌形狀分類

                                 


                                圖5 細(xì)菌鞭毛分布圖

                                單生(一根鞭毛著生于一端)

                                雙生(兩根鞭毛分別著生于兩端)

                                單叢生(一叢鞭毛著生于一端)

                                雙叢生(兩叢鞭毛分別著生于兩端)

                                周生(多根鞭毛遍布于菌體上)

                                 

                                鞭毛有三種運(yùn)動(dòng)方式:在液體中泳動(dòng),在固體表面上滑行,在液體中旋轉(zhuǎn)梭動(dòng)。所以難怪,我們看到的黑膠蟲不是在液體中活躍游動(dòng),就是在液體中旋轉(zhuǎn)梭動(dòng),這就和黑膠蟲被鑒定為細(xì)菌的結(jié)果相吻合了。

                                來源:愛必信(上海)生物科技有限公司
                                聯(lián)系電話:021-38015121
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