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DAP-seq應用于褪黑素促進種子萌發(fā)的分子機制研究

瀏覽次數(shù):478 發(fā)布日期:2023-5-11  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

2022年8月,安徽農(nóng)業(yè)大學、中國水稻研究所和上海市農(nóng)業(yè)科學院作物育種栽培研究所在The Plant Journal(IF=5.726)期刊聯(lián)合發(fā)表了題為“OsSGT1 promotes melatonin-ameliorated seed tolerance to chromium stress by affecting the OsABI5-OsAPX1 transcriptional module in rice”的文章,揭示了OsSGT1和ABI5相互作用,調(diào)控OsAPX1的表達,促進褪黑素改善種子在鉻污染條件下萌發(fā)的分子機制。其中藍景科信河北生物科技有限公司提供了DAP-seq的技術支持。

 

隨著人類活動的加劇,重金屬污染日益成為威脅人類健康、生態(tài)安全的全球性問題。其中,鉻污染已成為世界范圍內(nèi)的環(huán)境問題。鉻抑制種子萌發(fā)、光合作用和礦質(zhì)的吸收。種子萌發(fā)在后續(xù)幼苗形態(tài)建成中起著關鍵作用,由于其固著的生活方式,更容易受到不利環(huán)境的影響。已有研究表明褪黑素(Mel)可以緩解鉻脅迫,促進植物生長發(fā)育。但Mel緩解Cr毒性的機制,并不完全清楚。

 

該研究發(fā)現(xiàn)Mel在水稻種子萌發(fā)過程中顯著緩解了Cr脅迫,并且在OsSGT1過表達材料中觀察到萌發(fā)性能有顯著改善,而OsSGT1和/或OsABI5的突變顯著消除了Mel介導的對Cr脅迫的緩解作用;パa實驗表明,恢復OsSGT1的表達并不能彌補sgt1-1abi5突變體中Mel介導的Cr脅迫下微弱的萌發(fā)表現(xiàn),但恢復OsSGT1驅動下的OsABI5的表達,sgt1-1abi5突變體中Mel介導的種子萌發(fā)和OsAPX1的表達顯著恢復。通過DAP-seq實驗,找到了OsABI5直接調(diào)控的OsAPX1基因,其編碼產(chǎn)物促進H2O2清除以維持氧化還原穩(wěn)態(tài),這對種子萌發(fā)至關重要。

圖1. 褪黑素對OsAPX1表達的影響

(a) WT、sgtlsgtl-labi5abi5材料在鉻(Cr)脅迫7天后OsAPX1的表達情況。(b) WTemptyOEl、OE2OE3、sgtl-labi5-ICOMAS、sgtl-labi5-2COMAS、sgtl-labi5-1COMSAsgtl-labi52COMSA在Cr脅迫7天后OsAPX1的表達情況。 (c) DAP-seq分析OsABI5結合到OsAPX1的peak分布圖。(d) EMSA驗證OsABI5與OsAPX1啟動子有相互作用。 (e) OsAPX1啟動子區(qū)域的ChIP-qPCR分析。(f) 酵母單雜交(Y1H)檢測OsABI5與OsAPX1啟動子區(qū)域的結合。

 

本文總結

本研究表明OsSGT1協(xié)調(diào)OsABI5靶向OsAPX1,介導褪黑素緩解Cr脅迫對種子萌發(fā)的影響,這為Mel在生產(chǎn)中的應用提供了指導。
 


DAP-seq高通量地鑒定轉錄因子在基因組上的結合位點,預測下游基因。藍景科信擁有100+物種,1000+轉錄因子的DAP-seq實戰(zhàn)經(jīng)驗。我們使用該技術已助力客戶在許多期刊發(fā)表文章,例如:Molecular Plant,The Plant Cell,Plant Physiology,Plant Biotechnology Journal,Journal of Integrative Plant Biology,New Phytologist等。
來源:藍景科信河北生物科技有限公司
聯(lián)系電話:15632249798
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