病毒載體概述
根據(jù)病毒載體使用目的可將病毒載體劃分為兩類(lèi):一種是廣泛應(yīng)用于科研的“基因表達(dá)載體”,另一種“基因治療載體”則應(yīng)用于臨床居多。病毒載體具有保留病毒高效感染、轉(zhuǎn)染能力以及去除或減少病毒病理功能基因的特征。現(xiàn)在被使用的病毒載體被稱(chēng)為“重組病毒載體”。
重組病毒載體包含三大特征:
重組病毒構(gòu)建的模式首先應(yīng)保證:組裝與復(fù)制序列不在同一個(gè)質(zhì)粒上,并且最終組裝病毒所包裹的基因組序列只含表達(dá)的外源基因以及外源基因的輔助片段,不可包含控制病毒復(fù)制的序列。如果包裝出來(lái)的新一代病毒,仍然具有復(fù)制序列,那么它的生物安全性會(huì)存在巨大的隱患。因此“重組病毒”又可稱(chēng)為 “復(fù)制功能缺陷重組病毒”。
病毒載體直接注入
中樞神經(jīng)系統(tǒng)及其表達(dá)分析
目前,病毒載體在實(shí)驗(yàn)室神經(jīng)科學(xué)活體研究中,通常是應(yīng)用病毒直接注射的方式注射到目標(biāo)腦區(qū),然后再進(jìn)行后續(xù)研究。病毒表達(dá)的鑒定包括:鑒定基因表達(dá)、鑒定蛋白表達(dá)和鑒定神經(jīng)元亞型,具體參考下圖所示。
病毒載體在
中樞神經(jīng)系統(tǒng)中的傳遞模式
根據(jù)我們注射方式的不同,病毒載體在中樞神經(jīng)系統(tǒng)中的傳遞模式和表達(dá)方式也不盡相同。使用立體定位儀注射模式大多數(shù)會(huì)產(chǎn)生垂直的孔,注射理想狀態(tài)是產(chǎn)生球型擴(kuò)散,實(shí)際情況由于操作精度及針頭停留時(shí)間的一個(gè)情況影響最后擴(kuò)散的模式往往是沿著注射孔徑分布。軸突注射模式主要沿軸突傳遞。腦室/脊髓注射模式則沿腔壁分布。血管注射模式會(huì)沿血管網(wǎng)分布。
常用的病毒載體分類(lèi)為:CMV質(zhì)粒、EBV質(zhì)粒。逆轉(zhuǎn)錄病毒載體為:皰疹病毒 、腺病毒、腺相關(guān)病毒、狂犬病毒。關(guān)于病毒載體的優(yōu)劣勢(shì)如下圖所見(jiàn):
▲(圖片來(lái)源:https://www.addgene.org/guides)
病毒載體的具體分析
慢病毒是一種逆轉(zhuǎn)入病毒,它是RNA逆轉(zhuǎn)為雙鏈DNA整合到宿主細(xì)胞基因組。質(zhì)粒來(lái)源廣泛,主要來(lái)源于免疫缺陷病毒,比較常用的有HIV-1。慢病毒(Lentivirus)具有的一大特點(diǎn)是廣泛細(xì)胞感染能力,無(wú)論是神經(jīng)元、膠質(zhì)細(xì)胞、還是神經(jīng)干細(xì)胞均可感染,在Lentivirus包裝過(guò)程中它的膜蛋白VSV-G必須要放在包裝質(zhì)粒當(dāng)中,出于對(duì)Lentivirus生物安全性的考慮,我們把真正轉(zhuǎn)入的目標(biāo)外源基因的序列包裝在轉(zhuǎn)染質(zhì)粒上。具體可參考下圖:
腺病毒基因組的容量特別大(36KB),是DNA類(lèi)型病毒。在DNA序列當(dāng)中,目前通常將E1替換為外源基因,由于E1基因?qū)τ谙俨《镜纳芷谑呛苤匾模鎿Q掉后只能把改造后的腺病毒基因?qū)氲椒(wěn)定表達(dá)E1蛋白中HEK293細(xì)胞中包裝。包裝完成所產(chǎn)生的病毒溶液會(huì)導(dǎo)致一定程度的炎癥反應(yīng),容易對(duì)神經(jīng)元造成水腫,對(duì)后續(xù)的行為學(xué)研究、形態(tài)學(xué)研究產(chǎn)生很大的影響,應(yīng)用神級(jí)科學(xué)手術(shù)存在比較明顯的缺陷,因此不適合作為基因治療載體。
腺相關(guān)病毒是48KB單鏈的DNA,基因組包括Rep編碼的AAV生命周期相關(guān)蛋白 、Cap編碼的AAV衣殼蛋白兩個(gè)開(kāi)放閱讀框,另外需要helper plasmid編碼AAV復(fù)制相關(guān)蛋白,待三個(gè)質(zhì)粒全部轉(zhuǎn)染進(jìn)入HEK293細(xì)胞后,便可包裝成為具有感染能力,但無(wú)復(fù)制能力的AAV病毒顆粒。
重組腺相關(guān)病毒是目前已發(fā)現(xiàn)的結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單的一類(lèi)單鏈DNA復(fù)制缺陷型病毒,具有安全性高、免疫原性低、宿主細(xì)胞范圍廣和在體內(nèi)表達(dá)時(shí)間長(zhǎng)等特點(diǎn)?茖W(xué)界現(xiàn)普遍認(rèn)為AAV不會(huì)導(dǎo)致人類(lèi)疾病,是目前最有前景的基因治療載體。基因工程化的AAV能轉(zhuǎn)導(dǎo)外源基因,借助特定啟動(dòng)子、光遺傳學(xué)/化學(xué)遺傳學(xué)元件、鈣指示劑、神經(jīng)遞質(zhì)探針或Cre/lox P,F(xiàn)lp/FRT重組酶技術(shù),可選擇性地標(biāo)記特定的神經(jīng)元?筛鶕(jù)感染對(duì)象細(xì)胞有針對(duì)選擇不同AAV的血清型,越來(lái)越多的神經(jīng)環(huán)路研究使用AAV作為神經(jīng)示蹤工具。
狂犬病毒不同于其它病毒載體,不可以作為廣普的病毒載體感染各類(lèi)細(xì)胞。作為神經(jīng)科學(xué)研究的工具,狂犬病毒被應(yīng)用的點(diǎn)在于其神經(jīng)專(zhuān)嗜性(neurotropic viruses)。野生型狂犬病毒細(xì)胞內(nèi)高拷貝數(shù)具有細(xì)胞病毒,可逆行多級(jí)神經(jīng)元影響環(huán)路研究分析。產(chǎn)生移除糖蛋白G,重組SAD△G-GFP狂犬病毒不能逆行感染神經(jīng)元。后來(lái)通過(guò)產(chǎn)生引入外源膜蛋白EnVA重組EnVA-SAD△G-GFP特異感染表達(dá)受體TVA的細(xì)胞進(jìn)行感染。
病毒的注射與表達(dá)
瑞沃德71000全自動(dòng)腦立體定位儀、R-480玻璃微電極注射泵及MP-500微電極拉制儀拉制出的電極來(lái)共同使用:
將小鼠誘導(dǎo)麻醉后套好麻醉面罩,進(jìn)行頭部固定,在立體定位儀上切開(kāi)頭頂皮膚,清理顱骨表面。
病毒注射前需將小鼠的頭部調(diào)平,調(diào)整鼻夾和耳肝Z軸高度,使小鼠顱骨表面前后左右Z軸高度一致。
根據(jù)目標(biāo)腦區(qū)的立體定位圖譜坐標(biāo)進(jìn)行調(diào)整,用顱骨鉆鉆開(kāi)小鼠顱骨,用針尖挑破硬腦膜。
模式設(shè)置與速度選擇
四種組合工作方式:注射、抽吸、注射/抽吸、抽吸/注射。
流量速率設(shè)置可達(dá)到PI級(jí)別,時(shí)間參數(shù)Hr/Min/Sec都可選,病毒注射速率控制在20nl/min-40nl/min。
設(shè)置速率后,可以選擇定時(shí)或定量注射。
注射/抽吸過(guò)程,可以實(shí)時(shí)觀察當(dāng)前狀態(tài)。
玻璃微電極的尖端插入到目標(biāo)腦區(qū)的坐標(biāo)深度,注射完畢后電極停留10min,縫合傷口并將動(dòng)物放回籠內(nèi)。
新一代的示蹤方法——病毒載體具有突出優(yōu)勢(shì)。病毒載體采用改造后的病毒,安全性高、毒性低、能轉(zhuǎn)入目的基因且選擇范圍廣。依據(jù)其特性可供研究者自由組合使用?茖W(xué)家們一直努力研究改造病毒,以期獲得毒性更低,感染、傳播、跨突觸機(jī)制更加明確的神經(jīng)示蹤工具病毒,為腦科學(xué)研究提供更強(qiáng)大的工具。