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SCIEX在PROTAC藥物定量分析中的解決方案

瀏覽次數(shù):1081 發(fā)布日期:2023-3-29  來源:SCIEX
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PROTAC即靶向蛋白降解嵌合體(Proteolysis-Targeting Chimeras),是一種利用泛素-蛋白酶系統(tǒng) (Ubiquitin-Proteasome System, UPS) 對靶蛋白進行降解的藥物開發(fā)技術(shù)。PROTAC是一個兩端含有不同配體的化學分子,一端是結(jié)合E3連接酶的配體,另一端是結(jié)合細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的配體,這兩個配體再由一段連接子連接起來。這樣的化學分子既可以結(jié)合E3泛素連接酶,又可以結(jié)合細胞內(nèi)蛋白質(zhì),通過把靶向的蛋白質(zhì)招募到E3泛素連接酶附近來實現(xiàn)靶向蛋白質(zhì)的多泛素化,最后被蛋白酶體降解。

PROTAC的特點是可以循環(huán)使用,而不被蛋白酶體降解。在患者體內(nèi),PROTAC的靶蛋白配體和靶蛋白結(jié)合,E3泛素連接酶配體和細胞內(nèi)的E3泛素連接酶的底物結(jié)合區(qū)結(jié)合,從而通過連接子把靶蛋白拉進到E3泛素連接酶旁邊,實現(xiàn)UPS系統(tǒng)將靶蛋白降解[1]。


傳統(tǒng)小分子需要知曉靶蛋白的內(nèi)在位點和機制來結(jié)合然后起效,而PROTAC則不用重視靶蛋白本身機制,無需競爭位點,只要結(jié)合上就直接將靶蛋白泛素化標記后降解[2]。由于它的機制特殊,僅需要少量就可發(fā)揮藥效,用量常常是納摩爾級別,這也給它的安全性和活性評價帶來一定難度。

SCIEX已開發(fā)多種PROTAC類藥物的血漿基質(zhì)定量方案,本文將介紹其中的兩種。
 


ARV-110 (Bavdegalutamide)是一種治療轉(zhuǎn)移性去勢抵抗性前列腺癌的PROTAC藥物,目前的報道顯示其在臨床試驗中展現(xiàn)出持續(xù)的抗腫瘤活性和患者獲益證據(jù)。

本方法采用沉淀蛋白后再吹干復(fù)溶的方式進行血漿前處理,通過SCIEX Triple Quad 系統(tǒng)對大鼠血漿中ARV-110進行直接定量分析,在血漿基質(zhì)中定量下限LLOQ可達5 pg/mL(圖1),方法選擇性好,靈敏度高。ARV-110化合物的回歸方程和線性范圍見圖2,ARV-110在5~5000 pg/mL的濃度范圍內(nèi)線性關(guān)系良好。
 

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圖1. ARV-110在空白血漿、5 pg/mL、10 pg/mL、
20 pg/mL和50 pg/mL大鼠血漿基質(zhì)中峰圖信息。

 

 

圖2. ARV-110的標準曲線和線性圖譜,
線性范圍5~5000 pg/mL,線性相關(guān)系數(shù) r=0.998

 

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GNE-987是一種降解溴結(jié)構(gòu)域蛋白4 (BRD4) 的PROTAC,由VHL配體、BRD4配體與間隔基團組成,具有皮摩爾級別的BRD4降解活性,所以這也給它的安全性和活性評價帶來了一定難度。

本方法采用甲基叔丁基醚萃取后再用氮氣吹干并復(fù)溶的方式進行血漿前處理,通過SCIEX Triple Quad™ 系統(tǒng)對大鼠血漿中PROTAC藥物GNE-987進行直接定量分析。方法前處理簡單,靈敏度高,定量下限LLOQ可達2 pg/ml(圖3),濃度范圍在2 pg/ml ~ 10 ng/ml呈良好的線性關(guān)系(圖4)。

 

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圖3. GNE-987在空白血漿和
不同濃度血漿樣品中的峰圖信息

 

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圖4. GNE-987的線性關(guān)系圖

參考文獻
1. Louise M. Sternicki, Jim Nonomiya, Miaomiao Liu, et al. Native Mass Spectrometry for the Study of PROTAC GNE-987-Containing Ternary Complexes [J]. Chem Med Chem, 2021, 16, 1-6.

2. Lawrence B. Snyder, ArvinasInc, New Haven, CT. Discovery of ARV-110, a first in class androgen receptor degrading PROTAC® for the treatment of men with metastatic castration resistant prostate cancer. www.arvinas.com

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來源:SCIEX
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