紐約——SCIEX證明聲波激發(fā)液體進樣Echo™ MS系統(tǒng)與基于質(zhì)譜的肽定量工作流程的兼容性，從而將該系統(tǒng)應用范圍從小分子工作流程擴展到生物制藥開發(fā)和大規(guī)模蛋白質(zhì)生物標記物研究等應用。
 
在2022年3月舉行的美國人類蛋白質(zhì)組組織(US HUPO)年會上，來自位于馬薩諸塞州弗雷明翰的SCIEX科學家們提供了原始數(shù)據(jù)證明，該公司由生命科學巨頭Danaher所有，該公司的Echo MS系統(tǒng)可以每秒檢測多達三個樣本，應用于肽段定量工作流程分析肽段，該工作流程利用穩(wěn)定同位素標記并通過抗肽抗體（SISCAPA）捕獲肽段。
 
SCIEX液相和集成解決方案高級總監(jiān)Gavin Fischer表示，該公司現(xiàn)在開始使用基于上述系統(tǒng)，開發(fā)肽段定量應用。他補充道，雖然其最初的目標是生物制藥工作流程中的肽段定量，但也可以擴展到蛋白生物標記物研究。Fischer說，公司研究人員在方法開發(fā)過程中，使用了一組來源于SARS-CoV-2核衣殼蛋白的20個肽段。
 
Echo MS系統(tǒng)是SCIEX和Labcyte合作開發(fā)的，該系統(tǒng)使用聲波激發(fā)液體處理將樣品快速噴射到質(zhì)譜儀中。SCIEX于2020年推出該系統(tǒng)，并已將其主要用于小分子分析方法。在美國HUPO上的詳細工作展示，旨在表明該系統(tǒng)也可用于分析肽段和蛋白質(zhì)等大分子。
 
Echo MS系統(tǒng)可能會引起蛋白生物標記物研究人員的興趣，因為它將允許進行超高通量實驗。例如，F(xiàn)ischer指出，在探索使用該設備進行肽段測定的第一個項目中，SCIEX團隊在含有約100個肽段的β-半乳糖苷酶蛋白質(zhì)的消化物中定量了一對β-半乳糖苷酶肽段。通過Echo MS系統(tǒng)，能夠在5小時內(nèi)對10260個樣本中的2種肽段進行定量。如果使用傳統(tǒng)的液相色譜質(zhì)譜儀進行同樣的實驗，需要運行大約7分鐘的液相色譜梯度，那么幾乎需要50天的全天候質(zhì)譜檢測工作。“我們正在研究高通量肽段定量，”Fischer說，并指出研究人員將系統(tǒng)設置為每1.5秒分析一個樣本。“我們在整個樣品板上獲得了很好的重現(xiàn)性，很好的變異系數(shù)。”
 
SCIEX團隊遵循最初的Echo MS系統(tǒng)工作流程，使用SISCAPA工作流程進行實驗，該工作流程使用前期抗體富集目標肽段來測定20個SARS-CoV-2肽段。SCIEX首席應用科學家兼該項目負責人Christie Hunter在一封電子郵件中表示，SISCAPA是一種很有前途的利用Echo MS系統(tǒng)進行蛋白定量的技術，因為前期抗體富集足以簡化樣品，使其在無需液相分離的情況下即可進行分析。
 
她指出：“這里的關鍵是找到正確的前期樣品制備方法，簡化蛋白組學樣品，從而使液體流動注射方法可行。” “目標肽段的抗體富集非常引人注目方法，是與Echo MS系統(tǒng)配對的合適樣品制備工作流程，高度自動化，執(zhí)行速度快，制備出高度富集的樣品，并且可以根據(jù)目標蛋白的靈敏度進行調(diào)整。” 她補充說，這樣的工作流程“可以針對那些有大量蛋白質(zhì)組樣本需要分析并想要定量一小部分蛋白質(zhì)的實驗室。”
 
Fischer說，研究人員研究了20種肽段的定量限(LOQ)，發(fā)現(xiàn)該系統(tǒng)采用比較靈敏的肽段分析方法平均LOQ為1 fmol/µL，可將其目標分析物定量至0.4 fmol/µL至3.7 fmol/µL。“[美國HUPO]的演示，非常有力地證明了我們的儀器可以做非小分子的工作，”他補充說，公司現(xiàn)在計劃“在Echo MS系統(tǒng)上測試更大的分子和不同質(zhì)量的分子，并在更多的工作流程擴展到更多的市場時，向客戶演示該系統(tǒng)實用性。”
 
當被問及該系統(tǒng)是否可以用于血漿中肽段的靶向定量等應用時，F(xiàn)ischer表示，公司尚未通過實驗證明這一點，但“有理論證據(jù)相信這個應用可以實現(xiàn)。”他指出，SCIEX已證明該系統(tǒng)能夠定量血漿中的小分子。
 
他說：“我們正致力于將[這項技術]應用到更多不同的基質(zhì)中，并探索更大尺寸的包膜蛋白分析，從肽段到完整蛋白。” “我們將繼續(xù)打破所有這些研究方向的邊界。”公司將尋求將該技術應用于其他市場，包括潛在的蛋白質(zhì)生物標志物研究。
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聲明：SCIEX Echo™ MS系統(tǒng)、SCIEX Triple Quad™ 5500+系統(tǒng)和SCIEX Triple Quad™ 7500系統(tǒng)在中國為非醫(yī)療器械，僅能用于科研用途，不得用于以診斷為目的病人檢測。
 
 
參考文獻與信息
1.新聞來源：https://www.genomeweb.com/proteomics-protein-research/sciex-developing-peptide-quantitation-assays-using-acoustic-ejection
2. 獲取有關SCIEX Echo™ MS系統(tǒng)的更多信息，請訪問 https://sciex.com.cn/products/integrated-solutions/Echo-ms