根據(jù)樣本選擇適當(dāng)濃縮離心管的方法及其應(yīng)用
瀏覽次數(shù):2086 發(fā)布日期:2022-1-18
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一提起蛋白質(zhì)濃縮、更換緩沖液,我們都會想起超濾。這是一種我們都很熟悉的膜分離技術(shù)。它可用來分離溶液中極小的顆粒和溶解的分子。這種方法的最大特點是操作簡便,只需要濃縮離心管和離心機,即可圓滿完成我們的任務(wù)。
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與層析、透析等方法相比,超濾對被處理的分子更加溫和。它不需要有機萃取,就不會導(dǎo)致蛋白變性。這種方法非常高效,可同時濃縮和純化分子。操作可在低溫(比如冷庫)下進行。另外,快速、便宜,也是許多人青睞它的原因。
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濃縮離心管的操作很簡單。選擇適當(dāng)?shù)臐饪s離心管,加入待處理的樣本,按照離心管的指示進行離心操作,最后回收截留的樣本。在離心力的作用下,溶液中的小分子溶質(zhì)和溶劑透過超濾膜,被收集在濾過液收集瓶中,而大分子溶質(zhì)被超濾膜截留在濃縮離心管中。這種分離的主要依據(jù)是分子大小,但分子形狀和電荷等其他因素也會有影響。
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一般來說,超濾的回收率可達(dá)90%以上。樣本損失大多是由于濾膜表面和容器表面的非特異性吸附引起的。因此,選擇口碑好、高品質(zhì)的濃縮離心管非常重要。頗爾作為全球最大的過濾企業(yè),提供了多種濃縮離心管,可對50 μl到60 ml的樣本進行高效的濃縮和脫鹽。它配備了Omega(改良的聚醚砜)膜,確保低的非特異性吸附和高的回收率。當(dāng)然,這個的前提是你選對了濃縮離心管。
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如何選擇濃縮離心管?
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1、按體積
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頗爾公司實驗室提供了4個系列的濃縮離心管,適合處理不同體積的樣本。你可以根據(jù)你的樣本量來選擇。不過,如果樣本濃度低體積大,可以選擇較小容積的濃縮離心管多次重復(fù)加樣離心。
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樣品 |
樣本體積 |
Nanosep® 濃縮離心管 |
< 0.5 mL |
Microsep™ Advance 濃縮離心管 |
0.5-5.0 mL |
Macrosep® Advance 濃縮離心管 |
5-20 mL |
Jumbosep™ 濃縮離心管 |
20-60 mL |
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2、選擇適當(dāng)?shù)慕亓舴肿恿浚∕WCO)
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一旦樣本體積確定,下一步就是選擇適當(dāng)?shù)腗WCO。對于蛋白質(zhì)而言,建議所選濾膜的MWCO是欲截留分子大小的1/6-1/3。通常,截留孔徑越小,流速越慢,但截留比例更大。因此,如果流速是主要的考慮因素,建議選擇MWCO為1/3的濾膜;如果重點考慮截留比例,那么最好選擇更致密的膜。
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友情提示一下,超濾膜對分子的截留是由多個因素決定的。在截留分子量之外,你還有必要考慮分子形狀、電荷、樣本濃度、樣本組成及操作條件。也許,線性的DNA分子溜走了,而球狀的分子卻被保留下來?傊鶕(jù)下表來選擇MWCO就基本沒錯了。為了防止大家拿錯管子,頗爾實驗室還貼心地將不同MWCO的濃縮離心管設(shè)置成不同的顏色,以方便識別。
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核酸應(yīng)用的MWCO選擇
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MWCO |
堿基對(雙鏈) |
堿基(單鏈) |
3K |
16-32 bp |
32-65 bs |
5K |
25-50 bp |
50-95 bs |
10K |
50-145 bp |
95-285 bs |
30K |
145-285 bp |
285-570 bs |
50K |
240-475 bp |
475-950 bs |
100K |
475-1450 bp |
950-2900 bs |
300K |
1450-2900 bp |
2900-5700 bs |
1000K |
4800-9500 bp |
> 9500 bs |
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MWCO |
膜額定的孔徑大小 |
生物分子的大小 |
生物分子的分子量 |
3K |
- |
- |
10K-20K |
5K |
- |
- |
15K-30K |
10K |
- |
- |
30K-90K |
30K |
- |
- |
90K-180K |
50K |
5 nm |
15-30 nm |
150K-300K |
100K |
10 nm |
30-90 nm |
300K-900K |
300K |
35 nm |
90-200 nm |
900K-1800K |
1000K |
100 nm |
300-600 nm |
> 3000K |
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濃縮離心管的應(yīng)用
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濃縮
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這是大家都很熟悉的應(yīng)用。超濾可很方便地濃縮經(jīng)過稀釋的蛋白質(zhì)或DNA/RNA樣本。它很溫和,不會打斷長達(dá)100 kb的DNA,也不會導(dǎo)致蛋白酶活的損失,同時也很高效,回收率通常高于90%。
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脫鹽和緩沖液交換
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超濾帶來了一種方便而高效的方法,可去除和交換溶液中的鹽、去除變性劑、分離復(fù)合分子、去除低分子量組分,或者快速改變離子或者pH環(huán)境。比如在用兩種或兩種以上的限制性內(nèi)切酶進行酶切時,有時找不到通用的酶切緩沖液,就可以借助濃縮離心管,更換緩沖液。
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組分分離
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當(dāng)然,超濾無法完全分離兩種分子量接近的分子。為了有效分離,待分離分子的分子量至少要相差一個數(shù)量級(10X)。對于PCR產(chǎn)物的純化和回收,超濾就很適合。PCR反應(yīng)混合物里含有多種鹽、游離的核酸、甘油、蛋白和引物,因此大多數(shù)的下游應(yīng)用都要求對PCR產(chǎn)物進行某種純化。超濾的方法快速,操作少,產(chǎn)率高,也不損傷DNA。
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最后提醒一下,濃縮離心管是一次性的工具,不建議重復(fù)使用。頗爾實驗室可以為您降低成本,為您的科研保駕護航。
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