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發(fā)現(xiàn)代謝組學-親水版技術介紹與應用案例分析

瀏覽次數(shù):1033 發(fā)布日期:2021-12-22  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

「發(fā)現(xiàn)代謝組學-親水版」是代謝組學核心研究手段之一,可高效完成樣本中親水性代謝物的檢測定性,即通過液質聯(lián)用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化,重點尋找在實驗組和對照組中有顯著變化的代謝物,進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關關系,其研究對象大都是分子量1500Da以內的小分子物質。 

技術優(yōu)勢
• 較高的靈敏度、分辨率
• 較寬的動態(tài)范圍
• 適合于生物樣本中復雜代謝產(chǎn)物的檢測和潛在標志物的鑒定
• 適合對標本中未知代謝物的探索研究
• 定性準:6D質控體系


技術路線


技術參數(shù)
樣本要求
血清、血漿:200 μL/sample
尿液:1 mL/sample
組織:200 mg/sample
糞便、腸道內容物:200 mg/sample
細胞、微生物:1X 107 cells/sample
培養(yǎng)液:200 μL/sample


生物學重復
樣本數(shù)量:植物和微生物n≥6,動物樣本n≥10,臨床樣本n≥30,所有重復樣本獨立分析
其他種類的樣品在收集之前請聯(lián)系我司銷售工程師


檢測平臺
UHPLC-QE-MS(Thermo Vanquish UHPLC-Thermo Q Exactive HFX)

常規(guī)項目周期
17個自然日,含基礎數(shù)據(jù)分析


應用方向
• 表型和生理功能研究
• 疾病病理研究
• 臨床診斷及治療
• 藥物研究
• 中醫(yī)理論研究
• 食品科學與營養(yǎng)學研究
• 畜牧與農(nóng)林業(yè)研究
• 環(huán)境毒理研究


案例分析
標題:IgG4相關性硬化性膽管炎和原發(fā)性硬化性膽管炎中糞便微生物組和代謝組的改變

研究對象: 硬化性膽管炎
期刊: Gut
影響因子: 23.059
時間: 2021年


研究背景
IgG4相關硬化性膽管炎(IgG4-SC)與原發(fā)性硬化性膽管炎(PSC)有多種臨床相似之處,但皮質類固醇治療對大多數(shù) IgG4-SC 患者有效,而對 PSC 患者存在無效性,且兩種疾病的預后也不同,PSC發(fā)生肝硬化、 膽管癌和結直腸癌的風險高于IgG4-SC。這兩種硬化性膽管炎的發(fā)病機制目前尚不清楚。雖然在PSC中腸道菌群失調已被廣泛研究,但腸道菌群在IgG4-SC中的作用機制仍不清楚。

研究結果
IgG4-SC和PSC具有不同的宿主—微生物相互作用,可能參與疾病的發(fā)病機制。研究數(shù)據(jù)強調了 IgG4-SC的獨特性。在IgG4-SC患者中,差異菌群和代謝物與轉氨酶顯著相關。Blautia菌的顯著降低和琥 珀酸的顯著升高可能是IgG4-SC中肝臟炎癥的基礎。相比之下,在 PSC中,菌群和代謝特征的改變與膽汁淤積表型相關,尤其是Eubacterium和菌群代謝物(包括次級膽汁酸)在PSC中均顯著降低。而且,基于代謝物的預測模型在區(qū)分疾病狀態(tài)方面比基于菌群的預測模型更有效。

研究思路


結果展示
在IgG4-SC中唯一改變的27種代謝物中,大多數(shù)(n=23,85%)在疾病組增加。這些包括幾種潛在的促炎癥介質、二十二碳五烯酸、8,11,14-二十碳三烯、花生四烯酸、羥基異丙酸等。在PSC中鑒定出67種代謝物發(fā)生了變化。與IgG4-SC相比,大多數(shù)代謝物(n=49,73%)在疾病組表現(xiàn)出較低的水平。由腸道細菌代謝的次級膽汁酸,包括脫氧膽酸(DCA)、石膽酸(LCA)和甘氨酸結合石膽酸(GLCA),在 PSC中顯著減少。
 


參考文獻
Qiaoyan Liu,Bo Li, et al. Altered faecal microbiome and metabolome in IgG4- related sclerosing cholangitis  and primary sclerosing cholangitis[J]. Gut,2021.

來源:上海百趣生物醫(yī)學科技有限公司
聯(lián)系電話:021-61531195
E-mail:chengyichun@biotree.cn

標簽: 代謝組學
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