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                                如何避免小鼠微生物組的穩(wěn)定性影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果

                                瀏覽次數(shù):1402 發(fā)布日期:2021-12-17  來(lái)源:杰克森實(shí)驗(yàn)室
                                小鼠微生物組的穩(wěn)定性影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果?如何解決?
                                 
                                好激動(dòng)!😄新的研究項(xiàng)目要開展起來(lái)了!
                                但是卻不知道如何挑選小鼠品系😭

                                小鼠品系的選擇對(duì)于研究結(jié)果至關(guān)重要。
                                特別是可以從多個(gè)來(lái)源(比如不同供應(yīng)商、當(dāng)?shù)匮芯恐行倪是合作者)獲得類似品系的情況下。

                                 
                                 
                                那么,小鼠品系該如何選擇呢?


                                不同來(lái)源的小鼠的微生物群落差異較大,而這個(gè)差異可能會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)論——這是一個(gè)非常重要但是常常被忽略的信息。
                                 
                                例如,一項(xiàng)研究報(bào)告了Th17免疫細(xì)胞豐度的巨大差異。Th17免疫細(xì)胞是小腸炎癥反應(yīng)的重要群體,這些細(xì)胞可能受腸道微生物群體的影響 (Ivanov 2008 Cell Host Microbe, PMID 18854238)。有研究者比較了不同來(lái)源的C57BL/6品系中Th17 胞的豐度,包括多個(gè)基礎(chǔ)研究的實(shí)驗(yàn)室和商業(yè)供應(yīng)商(例如 Taconic)。
                                 
                                結(jié)果表明,和其他來(lái)源比起來(lái),杰克森實(shí)驗(yàn)室 (JAX) 小鼠的Th17 胞非常少。后來(lái)的研究明確了其中的原因,即腸道分節(jié)絲狀菌 (segmented filamentous bacteria, SFB)可以誘導(dǎo)Th17細(xì)胞發(fā)育,該發(fā)育過(guò)程在缺乏SFB 小鼠中受阻(Ivanov 2009 Cell PMID 19836068)。
                                 
                                其實(shí),不同機(jī)構(gòu)的小鼠微生物組差異化這一結(jié)果其實(shí)并不讓人意外,因?yàn)槊考覚C(jī)構(gòu)在食物、水和墊料來(lái)源、設(shè)施涉及以及操作實(shí)踐(包括健康檢測(cè))等方面往往不盡相同。
                                 
                                除了這些外在因素外,小鼠的內(nèi)在因素也會(huì)影響微生物特征:
                                由于遺傳漂變的存在,即使是名稱相似的小鼠品系,其精確的遺傳特征也會(huì)有所不同。
                                基于科學(xué)問題的復(fù)雜性,要提前預(yù)測(cè)哪些微生物會(huì)影響您的研究是極其困難的。因此,使用微生物組穩(wěn)定的小鼠模型開展實(shí)驗(yàn),確保得到穩(wěn)定、可重復(fù)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,是規(guī)避此類風(fēng)險(xiǎn)的最優(yōu)的方式。
                                 
                                 
                                JAX小鼠具有
                                良好的腸道微生物組穩(wěn)定性

                                 
                                在過(guò)去一項(xiàng)研究中,我們報(bào)告了JAX的3種常用小鼠品系的微生物組在5個(gè)月內(nèi)均保持穩(wěn)定,且每個(gè)小鼠品系都有獨(dú)特的微生物特征。
                                 
                                 
                                這項(xiàng)觀察結(jié)果還促使我們開展了一項(xiàng)伴隨研究——我們比較了JAX小鼠與市面上其他2家主要供應(yīng)商的類似品系的腸道微生物組。
                                 
                                結(jié)果發(fā)現(xiàn),JAX不同設(shè)施的C57BL/6小鼠的腸道微生物相似性非常高,而而另外兩家供應(yīng)商不同設(shè)施的C57BL/6小鼠則往往有所差異。(比較數(shù)據(jù)和采樣方法如圖所示)
                                 
                                (將不同JAX不同設(shè)施(Bar Harbor、Sacramento)的C57BL/6NJ和市面上另外兩家供應(yīng)商(A和B)兩個(gè)設(shè)施(分別是W、X和Y、Z)的C57BL/6N小鼠運(yùn)送至專門從事微生物組研究的學(xué)術(shù)動(dòng)物研究機(jī)構(gòu)。從收雄性和雌性小鼠身上采集新鮮的糞便樣本并進(jìn)行16S rRNA V1V3區(qū)域的測(cè)序以比較微生物組成。來(lái)自JAX 的C57BL/6J小鼠樣本也包含在我們的分析中,作為評(píng)估亞系中細(xì)菌群落差異的參考。)
                                 
                                 
                                這個(gè)結(jié)果表明,JAX對(duì)多種健康狀況和不同設(shè)施的JAX小鼠的腸道微生物有較好的穩(wěn)定性。
                                  
                                 
                                決策至關(guān)重要
                                 
                                關(guān)于小鼠的采購(gòu)來(lái)源,您需要做出許多決定,其中不能妥協(xié)的一個(gè)決定是所用小鼠的質(zhì)量,因?yàn)檫@關(guān)系到研究結(jié)果的可重復(fù)性。

                                作為提供可靠研究模型的小鼠供應(yīng)商,JAX負(fù)責(zé)為世界各地的研究人員提供始終處于良好健康狀況的小鼠。我們希望通過(guò)這些健康狀況良好、遺傳背景清晰可靠的小鼠模型,助力每一位科學(xué)家,共同確保科研結(jié)果的可重復(fù)性。
                                 
                                 
                                為了確保小鼠的健康狀況和穩(wěn)定,JAX還設(shè)立了極為嚴(yán)格的流程和系統(tǒng)管理措施。 
                                 
                                在JAX各個(gè)等級(jí)的SPF屏障中,“飼料;經(jīng)過(guò)濾的酸化飲用水;墊料和微隔離(單獨(dú)經(jīng)過(guò) HEPA 過(guò)濾)籠等;\具設(shè)備在高壓滅菌前通過(guò)隧道清洗機(jī)進(jìn)行消毒。動(dòng)物技術(shù)人員需遵守嚴(yán)格的房間進(jìn)入程序,包括穿戴多種形式的個(gè)人防護(hù)裝備(包括面罩和頭罩)。“最高等級(jí)的SPF屏障中,技術(shù)人員還必須穿戴經(jīng)HEPA過(guò)濾的空氣帽并通過(guò)風(fēng)淋室入口,才能進(jìn)入。
                                 
                                 
                                同時(shí),JAX也設(shè)置了一套非常嚴(yán)密的健康檢測(cè)措施,以驗(yàn)證上述過(guò)程并確保小鼠質(zhì)量。
                                 
                                了解JAX通過(guò)哪些項(xiàng)目改善所生產(chǎn)小鼠的質(zhì)量:
                                 


                                JAX健康監(jiān)測(cè)項(xiàng)目:
                                https://www.jax.org/jax-mice-and-services/customer-support/customer-service/animal-health/animal-health-program
                                 
                                JAX遺傳穩(wěn)定項(xiàng)目:
                                https://www.jax.org/jax-mice-and-services/find-and-order-jax-mice/why-jax-mice/patented-genetic-stability-program
                                 
                                JAX遺傳質(zhì)量控制項(xiàng)目:
                                https://www.jax.org/jax-mice-and-services/find-and-order-jax-mice/why-jax-mice/genetic-quality-control-program
                                 
                                 
                                參考文獻(xiàn)

                                Ivanov II., 2008. Specific microbiota direct the differentiation of IL-17-producing T-helper cells in the mucosa of the small intestine. Cell Hose Microbe. 4(4):337-49. PMID 18854238
                                 
                                Ivanov II., 2009. Induction of intestinal Th17 cells by segmented filamentous bacteria. Cell. 139(3):485-98. PMID 19836068
                                來(lái)源:杰克森醫(yī)療科技(上海)有限公司
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                                標(biāo)簽: 微生物組 免疫
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