利用MALDI-TOF微生物質(zhì)譜技術(shù)推進(jìn)傳染病檢測(cè)
作者:Ike Northern,CompuNet臨床實(shí)驗(yàn)室傳染病檢測(cè)與免疫學(xué)主任
全世界每年有20%的死亡與敗血癥有關(guān),影響人口達(dá)4700萬~5000萬。¹ 對(duì)敗血癥的早期識(shí)別與適當(dāng)治療,可有效改善患者預(yù)后。敗血癥治療每延遲一小時(shí),患者的存活率就會(huì)降低7.6%。2
治療敗血癥的標(biāo)準(zhǔn)程序從使用廣譜抗菌藥物開始,但是,在不了解微生物特性的情況下,治療的效果十分有限,并有可能給患者帶來不利的健康影響。很多曾經(jīng)很容易通過新型抗生素治療的疾病,現(xiàn)在又重新出現(xiàn)了耐藥性。
利用MALDI-TOF技術(shù)進(jìn)行快速微生物鑒定
CompuNet臨床實(shí)驗(yàn)室可提供包括敗血癥檢測(cè)在內(nèi)的先進(jìn)診斷服務(wù)。該實(shí)驗(yàn)室使用布魯克的基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間(MALDI-TOF)微生物質(zhì)譜儀來生成質(zhì)譜圖,供鑒定微生物的“蛋白指紋圖譜”之用,從而顯著提高通量。
CompuNet還采用布魯克的MALDI Sepsityper® Kit 50(僅供研究用,即RUO),它可以直接從陽性血液培養(yǎng)物(PBC)中快速鑒定微生物。采用MALDI Sepsityper Kit 50從PBC中進(jìn)行鑒定比傳統(tǒng)的表型與生化方法要快得多。
患者可以更快轉(zhuǎn)到靶向治療,除了盡量減少長(zhǎng)期接受潛在的過度治療之外,從廣譜抗菌藥物迅速降級(jí)為靶向型抗菌藥物的另一項(xiàng)優(yōu)勢(shì)是,降低產(chǎn)生多藥耐藥微生物的風(fēng)險(xiǎn),這與世界衛(wèi)生組織(WHO)的全球耐藥行動(dòng)計(jì)劃相一致,3
CompuNet使用MALDI Biotyper進(jìn)行MALDI Sepsityper Kit 50驗(yàn)證研究,并對(duì)82%的樣本進(jìn)行了鑒定,醫(yī)生能比之前提前至少48小時(shí)優(yōu)化患者治療(表1)。CompuNet還計(jì)劃采用新近獲FDA批準(zhǔn)的MBT Sepsityper Kit US IVD,對(duì)陽性血培養(yǎng)中的400多種微生物進(jìn)行快速、經(jīng)濟(jì)的鑒定。
種水平
74/106 = 70% |
屬水平
13/106 = 12% |
金黃色葡萄球菌 |
17 |
屎腸球菌 |
2 |
摩根摩根菌 |
1 |
凝固酶陰性葡萄球菌 |
3 |
頭狀葡萄球菌 |
2 |
咽峽炎鏈球菌 |
1 |
銅綠假單胞菌 |
3 |
α-鏈球菌 |
1 |
表皮葡萄球菌 |
8 |
A群鏈球菌 |
1 |
普通變形桿菌 |
1 |
β-鏈球菌 |
1 |
溶血性鏈球菌 |
2 |
B群鏈球菌 |
1 |
粘質(zhì)沙雷菌 |
2 |
芽孢桿菌屬 |
3 |
人葡萄球球菌 |
2 |
陰溝腸桿菌 |
1 |
白色念珠菌 |
1 |
棒桿菌屬 |
3 |
藤黃微球菌 |
3 |
大腸桿菌 |
18 |
|
|
腸桿菌屬 |
1 |
糞鏈球菌 |
4 |
肺炎克雷伯菌 |
5 |
|
|
擬桿菌屬 |
1 |
表1:CompuNet MALDI Sepsityper Kit 50驗(yàn)證
鑒定微生物總數(shù) – 87/106(82%)
用戶長(zhǎng)期受益
與通過多重PCR檢測(cè)進(jìn)行PBC常規(guī)測(cè)試相比,使用MALDI-Sepsityper作為篩選手段是更為經(jīng)濟(jì)高效的選擇,可以幫助確定該下一步該做哪些檢查。布魯克未來開發(fā)的目標(biāo)包括增加耐藥標(biāo)志物,以幫助應(yīng)對(duì)耐多藥微生物 (如產(chǎn)肺炎克雷伯菌碳青霉烯(KPC)、MRSA(耐甲氧西林金黃色葡萄球菌)、脆弱擬桿菌陽性菌株、伊麗莎白菌屬以及嵌合體分枝桿菌),并進(jìn)一步擴(kuò)大微生物鑒定能力。
Bruker MALDI Sepsityper Kit 50僅供研究使用(RUO)。
*CompuNet臨床實(shí)驗(yàn)室從布魯克購(gòu)買MALDI Sepsityper Kit 50(RUO)
*CompuNet臨床實(shí)驗(yàn)室開發(fā)并驗(yàn)證了自己的內(nèi)部分析方法,用于臨床診斷
*Sepsityper分析按照內(nèi)部制定的方案僅在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)使用。
關(guān)于作者
Ike Northern自1989年起在俄亥俄州代頓市的Compunet臨床實(shí)驗(yàn)室工作,并擔(dān)任傳染病檢測(cè)主管。
參考文獻(xiàn)
2Kumar A, Roberts D, Wood KE, Light B, ParrilloJE, Sharma S, Suppes R, Feinstein D, ZanottiS, Taiberg L, Gurka D, Kumar A and Cheang M:Duration of hypotension before initiation of effectiveantimicrobial therapy is the critical determinantof survival in human septic shock. Crit CareMed 2006, 34(6):1589-96, DOI: