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                                His標(biāo)簽蛋白純化試劑盒操作步驟(以大腸桿菌為例)

                                瀏覽次數(shù):5049 發(fā)布日期:2021-1-14  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

                                使用說明:
                                對(duì)于用鎳柱純化大腸桿菌中His標(biāo)簽蛋白比較熟悉的使用者可以直接參考“4. 簡化的操作流程”。否則請(qǐng)參考如下詳細(xì)內(nèi)容:
                                如下以最常見的大腸桿菌中表達(dá)純化His標(biāo)簽重組蛋白為例,說明本產(chǎn)品的使用方法。在其它體系中表達(dá)時(shí),請(qǐng)參考該表達(dá)體系的相關(guān)使用說明,并借鑒大腸桿菌中純化His標(biāo)簽重組蛋白的使用說明。


                                1.大腸桿菌中可溶性His標(biāo)簽重組蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)
                                如下以最常用的IPTG誘導(dǎo)表達(dá)系統(tǒng)給予說明,誘導(dǎo)表達(dá)條件的優(yōu)化請(qǐng)參照所使用的誘導(dǎo)表達(dá)體系的詳細(xì)說明。其它誘導(dǎo)表達(dá)系統(tǒng)請(qǐng)參考適當(dāng)?shù)氖褂谜f明進(jìn)行。
                                a.挑取表達(dá)His標(biāo)簽重組蛋白的單克隆,接種到3ml或10-20ml含適當(dāng)抗生素的LB培養(yǎng)液中,培養(yǎng)過夜。
                                b.按照1:20的比例取培養(yǎng)過夜的菌液,接種到預(yù)熱至37℃并含適當(dāng)抗生素的LB培養(yǎng)液中。例如取5ml培養(yǎng)過夜的菌液接種到100ml預(yù)熱至37℃并含適當(dāng)抗生素的LB培養(yǎng)液中。具體的培養(yǎng)體積視需要純化的蛋白量而定,初步的鑒定培養(yǎng)3-10ml即可;常規(guī)的表達(dá)純化,通?煽紤]培養(yǎng)100-200ml;制備型的純化,培養(yǎng)體積可以達(dá)到1L或更大。如果希望取得更好的表達(dá)效果,建議按照1:100的比例接種過夜培養(yǎng)的菌液,但后續(xù)培養(yǎng)至相應(yīng)的OD值需要更長的時(shí)間。
                                c.37℃常規(guī)培養(yǎng)約30-60min或更長時(shí)間,至菌液的OD600達(dá)到0.5-0.7,并且OD600最好接近0.6。
                                d.加入IPTG至終濃度為1mM,繼續(xù)培養(yǎng)4-5小時(shí)。
                                注:可以在加入IPTG前取出少量菌液同樣培養(yǎng)4-5小時(shí)后作為未誘導(dǎo)的對(duì)照,也可以在加入IPTG前直接取出少量菌液作為未誘導(dǎo)的對(duì)照。對(duì)于特定蛋白的誘導(dǎo)表達(dá),最佳的IPTG濃度、誘導(dǎo)溫度、和誘導(dǎo)時(shí)間需要通過實(shí)驗(yàn)確定。
                                e.收集菌液至離心管中,4℃ 4,000g離心20min或4℃ 15,000g離心1min,棄上清,收集沉淀。隨后即可進(jìn)入細(xì)菌裂解步驟,也可以在-20℃或-80℃凍存?zhèn)溆。冷凍保存的菌體使用前需置于冰上解凍15min。


                                2.非變性條件下His標(biāo)簽蛋白的小量純化:
                                本方法常用于小量樣品的快速分析和鑒定,為后續(xù)大量制備打下基礎(chǔ)。
                                a.接步驟1(e),離心收集1ml菌液的細(xì)菌沉淀并棄上清,加入100μl非變性裂解液,將細(xì)菌沉淀充分重懸于裂解液中,可進(jìn)行輕微的vortex(盡量避免產(chǎn)生氣泡)。
                                注:根據(jù)His標(biāo)簽重組蛋白表達(dá)的豐度,菌液和裂解液的體積比可以在25:1-5:1范圍內(nèi)適當(dāng)調(diào)整。表達(dá)豐度非常高時(shí),每毫升菌液沉淀可以加入200μl裂解液;表達(dá)豐度非常低時(shí),每毫升菌液沉淀可以加入40μl裂解液。相關(guān)溶液的配制方法附后。本非變性裂解液可以確保裂解絕大多數(shù)可溶性蛋白和包涵體蛋白,裂解后可以直接用于SDS-PAGE。如有必要,可以在裂解細(xì)菌之前,在裂解液中添加適量的蛋白酶抑制劑混合物。
                                b.加入溶菌酶至1mg/ml并輕輕混勻,盡量避免產(chǎn)生氣泡,冰水浴或冰上放置30min。
                                注:溶菌酶可以用裂解液配制成100mg/ml的母液,臨使用前加入。溶菌酶配制成母液后,可以適當(dāng)分裝后-20℃保存。
                                c.輕輕vortex數(shù)下,以充分裂解細(xì)菌,盡量避免產(chǎn)生氣泡。
                                d.4℃離心(15000g×10min),取10μl上清留樣作后續(xù)檢測用,收集余下上清至一新的潔凈離心管中。
                                e.加入20μl混合均勻的50% BeyoGold™ His-tag Purification Resin,4℃在搖床上緩慢搖動(dòng)30min,以充分結(jié)合帶His標(biāo)簽的目的蛋白。
                                注:緩慢搖動(dòng)30min已經(jīng)可以確保蛋白充分結(jié)合,但可以根據(jù)時(shí)間安排的需要緩慢搖動(dòng)更長時(shí)間甚至緩慢搖動(dòng)過夜。經(jīng)測試,直接使用50% BeyoGold™ His-tag Purification Resin也能獲得良好的純化效果。但如果希望獲得更高的標(biāo)簽蛋白得率,可以參考步驟3f,用一個(gè)柱體積的非變性裂解液平衡BeyoGold™ His-tag Purification Resin 2-3次。平衡后,視不同的待純化蛋白而定,待純化蛋白的得率有可能會(huì)提高約5-20%左右。
                                f.4℃離心(1000g×10s)沉淀凝膠,取20μl上清留樣作后續(xù)檢測用,其余上清棄去。
                                g.加入40μl非變性洗滌液重懸凝膠,4℃離心(1000g×10s),取20μl上清留樣作后續(xù)檢測用,其余上清棄去。
                                h.重復(fù)步驟g,再進(jìn)行一次洗滌。
                                i.加入20μl非變性洗脫液,輕輕重懸凝膠。4℃離心(1000g×10s),收集上清及凝膠。上清即為純化獲得的帶有His標(biāo)簽的目的蛋白。
                                j.重復(fù)步驟i兩次。共洗脫收集約60μl純化的蛋白樣品。

                                3.非變性條件下His標(biāo)簽蛋白的大量純化:
                                a.接步驟1(e),對(duì)于新鮮的或解凍的細(xì)菌沉淀,按照每克細(xì)菌沉淀濕重加入4ml(2-5ml均可)非變性裂解液的比例加入裂解液,充分重懸菌體。如有必要,可以在裂解細(xì)菌之前,在裂解液中添加適量的蛋白酶抑制劑混合物。
                                b.加入溶菌酶至終濃度為1mg/ml并混勻,冰水浴或冰上放置30min。
                                注:溶菌酶可以用裂解液配制成100mg/ml的母液,臨使用前加入。溶菌酶配制成母液后,可以適當(dāng)分裝后-20℃保存。
                                c.冰上超聲裂解細(xì)菌。超聲功率200-300W,每次超聲處理10s,每次間隔10s,共超聲處理6次。
                                注:具體超聲處理的方式須根據(jù)特定型號(hào)的超聲儀器自行摸索和優(yōu)化。
                                d.(可選做)如果超聲處理后裂解液非常粘稠,可以加入RNase A至10μg/ml及DNase I至5μg/ml,冰上放置10-15min。或者也可以使用適當(dāng)?shù)难b好了較細(xì)針頭的注射器,反復(fù)抽吸數(shù)次,以剪切粘稠的基因組DNA等。
                                e.4℃ 10,000g離心20-30min,收集細(xì)菌裂解液上清并置于冰水浴或冰上?梢匀20μl上清留作后續(xù)檢測用。
                                注:上清必須保持澄清,即不含任何不溶物,才能進(jìn)行下一步的純化。上清中如果混有不溶性雜質(zhì)會(huì)嚴(yán)重影響后續(xù)純化獲得蛋白的純度。
                                f.取1ml混合均勻的50% BeyoGold™ His-tag Purification Resin,4℃離心(1000g×10s)棄去儲(chǔ)存液,向凝膠中加入0.5ml非變性裂解液混勻以平衡凝膠,4℃離心(1000g×10s)棄去液體,再重復(fù)重復(fù)平衡1-2次,棄去液體。將約4ml細(xì)菌裂解液上清加入其中,4℃在側(cè)擺搖床或水平搖床上緩慢搖動(dòng)60min。
                                注:BeyoGold™ His-tag Purification Resin也可以不平衡直接使用,但蛋白的得率有可能會(huì)有5-20%的下降。
                                g.將裂解液和BeyoGold™ His-tag Purification Resin的混合物裝入試劑盒提供的親和層析柱空柱管中。
                                注:也可先取1ml混合均勻的50% BeyoGold™ His-tag Purification Resin裝柱,然后用0.5ml非變性裂解液平衡2-3次后加入約4ml細(xì)菌裂解液上清,后續(xù)可以把穿流液收集后重復(fù)上柱3-5次以充分結(jié)合目的蛋白。先混合后裝柱的方式操作起來相對(duì)麻煩一些,但更有利于帶有His標(biāo)簽重組蛋白與鎳柱的充分結(jié)合,特別是當(dāng)His標(biāo)簽被蛋白本身部分遮擋或His標(biāo)簽重組蛋白濃度很低時(shí)與鎳柱的結(jié)合效率會(huì)高一些。
                                h.將純化柱底部的蓋子打開,在重力作用下使柱內(nèi)液體流出,收集約20微升穿流液作后續(xù)分析用。
                                i.洗柱5次,每次加入0.5-1ml非變性洗滌液,每次均收集約20微升穿柱的洗滌液用于后續(xù)的分析檢測用。洗柱及下一步洗脫過程中可以用Bradford法簡單快速地檢測每次洗滌液和洗脫液中的蛋白含量,從而考慮增加或減少洗滌和洗脫的次數(shù)。
                                注:如果出現(xiàn)后續(xù)獲得蛋白純度不夠高的情況,可以再增加洗柱次數(shù)2-3次。
                                j.洗脫目的蛋白6-10次,每次用0.5ml非變性洗脫液洗脫。將每次的洗脫液分別收集到不同的離心管中。收集獲得的洗脫液即為純化的His標(biāo)簽蛋白樣品。蛋白純化效果可以參考圖1。

                                 

                                圖1. His標(biāo)簽重組蛋白純化效果圖。M: marker; CL:細(xì)菌裂解液(cell lysate);FT:上樣穿流液(flow through);W1-W3:洗滌液1-3 (wash 1-3);E1-E4:洗脫液1-4 (elution 1-4)。注:實(shí)際的電泳結(jié)果會(huì)因樣品、上樣量等的不同而有所不同。

                                4.簡化的操作流程:
                                a.細(xì)菌中的目的蛋白誘導(dǎo)表達(dá)后,離心沉淀細(xì)菌。
                                b.每克細(xì)菌沉淀濕重加入4ml非變性裂解液,可添加適量蛋白酶抑制劑,充分重懸細(xì)菌。
                                c.加入溶菌酶至終濃度為1mg/ml并混勻,冰水浴或冰上放置30min。
                                注:溶菌酶可以用裂解液配制成100mg/ml的母液,臨使用前加入。溶菌酶配制成母液后,可以適當(dāng)分裝后-20℃保存。
                                d.冰上超聲裂解細(xì)菌,離心取上清。
                                e.BeyoGold™ His-tag Purification Resin裝柱,1ml非變性裂解液平衡純化柱2次。
                                f.步驟4d中的上清上柱。
                                注:上清上柱是可以收集穿流液并重復(fù)上柱3-5次,以充分結(jié)合His標(biāo)簽蛋白。
                                g.用0.5ml非變性洗滌液洗柱5次。
                                注:如果出現(xiàn)咪唑濃度偏低的情況,可以自行添加適量咪唑,如果出現(xiàn)咪唑濃度偏高的情況,可以使用試劑盒提供的非變性裂解液作為洗滌液使用。
                                h.用0.5ml非變性洗脫液洗脫6-10次。
                                注:通常該洗脫條件會(huì)比較理想。如果出現(xiàn)洗脫效果欠佳的情況,可以自行提高咪唑濃度至100-250mM。

                                 

                                常見問題:
                                如果純化不成功,可以對(duì)純化過程中收集的每個(gè)組分進(jìn)行SDS-PAGE電泳檢測,分析其原因。
                                蛋白無法與BeyoGold™ His-tag Purification Resin結(jié)合
                                1.測序檢查基因序列的讀碼框是否正確。
                                2.嘗試將標(biāo)簽加在蛋白的另一端。
                                3.增加BeyoGold™ His-tag Purification Resin與蛋白結(jié)合時(shí)間(如4℃過夜)。
                                4.如果使用預(yù)裝柱,可收集裂解液上柱后的穿流液并多次重復(fù)上柱。
                                5.檢查所有緩沖液和溶液的pH值是否正確。
                                6.確認(rèn)體系中所用各種試劑的濃度在鎳柱的耐受范圍以內(nèi)。
                                7.降低結(jié)合緩沖液中的咪唑濃度。
                                目的蛋白被洗滌液洗脫
                                1.降低洗滌液中的咪唑濃度或者稍微提高其pH值。
                                2.檢查洗滌液的pH和成分。
                                3.確認(rèn)洗滌液中各種試劑的濃度在耐受范圍內(nèi)。
                                蛋白在純化過程中形成沉淀
                                1.將純化溫度控制在室溫。
                                2.加入去垢劑,如0.1% Triton X-100或者Tween-20。
                                蛋白無法洗脫
                                1.用梯度pH及咪唑洗脫,確定最優(yōu)洗脫條件。
                                目的蛋白與其它蛋白共同洗脫
                                1.提高結(jié)合緩沖液和洗滌液中的咪唑濃度。
                                2.降低BeyoGold™ His-tag Purification Resin的使用量。
                                3.加入DTT或β-巰基乙醇打開二硫鍵。
                                4.增加鹽或者去垢劑濃度,或者向洗滌液中加入乙醇或甘油以降低非特異相互作用。
                                5.檢查基因內(nèi)部是否含有起始密碼子(C端標(biāo)記蛋白)或者提前終止位點(diǎn)(N端標(biāo)記蛋白)。

                                來源:上海雅吉生物科技有限公司
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