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超微量紫外/熒光全功能分光光度計(jì)在RNA質(zhì)控的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):5535 發(fā)布日期:2020-3-30  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
RNA質(zhì)控,我來(lái)幫你!
 
小編心里話:RNA質(zhì)控是個(gè)技術(shù)活兒!
 
對(duì)于每天泡在實(shí)驗(yàn)室的人來(lái)說(shuō),qPCR已是家常便飯。毫無(wú)疑問(wèn)濃度高,純度好,片段完整,才是我們理想中的RNA樣品。然而,RNA總是嬌氣的存在!室溫或4度極易降解,提取的時(shí)候容易有污染物殘留。因此完整的RNA質(zhì)控包含了三個(gè)方面:濃度質(zhì)控,純度質(zhì)控,片段完整性質(zhì)控。
 
如何把控RNA質(zhì)量,繼續(xù)反轉(zhuǎn)錄呢?
 
有一款RNA質(zhì)控的高手,既可以提供RNA濃度質(zhì)控,也可以提供RNA純度質(zhì)控,沒(méi)錯(cuò),就是美國(guó)Denovix公司獨(dú)家提供的DS-11FX超微量紫外/熒光全功能分光光度計(jì),看上去酷酷的
RNA純度質(zhì)控的標(biāo)準(zhǔn)方法是超微量分光光度計(jì)(光吸收)法,通過(guò)監(jiān)控A260/230和A260/280的比值來(lái)判定RNA的純度。通常A260/280的比值范圍在1.8-2.0之間,如果大于2.0則說(shuō)明RNA已經(jīng)降解,如果低于1.8則說(shuō)明含有蛋白質(zhì)或其他雜質(zhì);而A260/230的比值如果小于2,則表明RNA中含有酚類,鹽等雜質(zhì)。DS-11FX的微量光度計(jì)功能可以幫助科研人員來(lái)準(zhǔn)確的判定RNA樣品的純度。
 
下圖為RNA紫外法檢測(cè)示意圖,A260/280和A260/230都不在正常的比值范圍,說(shuō)明RNA樣品純度很差,儀器會(huì)自動(dòng)進(jìn)行提示,兩個(gè)黃色小三角就是警示圖標(biāo)哦,點(diǎn)擊萌萌的黃色三角警示,儀器會(huì)顯示污染物的種類,夠智能吧,這就是DS-11特有的SmartQC功能

圖1 總RNA的測(cè)量界面圖(美國(guó)DeNovix,DS-11FX)
 
RNA濃度質(zhì)控的標(biāo)準(zhǔn)方法是熒光法,除非是純度很高的RNA也可以采用紫外法。熒光法采用RNA特異性染料,可以準(zhǔn)確的測(cè)量RNA濃度。DS-11FX不但提供RNA濃度質(zhì)控,也可以提供DNA和蛋白的濃度精確控制,功能超級(jí)強(qiáng)大哦。
 
dsDNA,RNA,ssDNA,Protein單獨(dú)的熒光檢測(cè)app
 
發(fā)表在Cell stem cell的文章PAX3 Confers Functional Heterogeneity in Skeletal Muscle Stem Cell Responses to Environmental Stress,作者提取衛(wèi)星細(xì)胞的總RNA,采用DS-11FX超微量/熒光全功能分光光度計(jì)進(jìn)行RT-PCR之前的RNA的質(zhì)量把控和濃度鑒定。


RNA片段完整性質(zhì)控最常用的是核酸蛋白片段分析儀(Qsep系列毛細(xì)管電泳儀)
RNA樣本即使檢測(cè)到較高濃度,也不代表核酸片段就是完整的,因?yàn)樗樗榈男∑我部梢越Y(jié)合染料。不能只做濃度純度檢測(cè),片段完整性也是評(píng)判樣本質(zhì)量的關(guān)鍵點(diǎn),RNA樣品的降解會(huì)是下游實(shí)驗(yàn)失敗的一個(gè)重要原因。
 

自信滿滿的Qsep系列毛細(xì)管電泳儀不僅可以清晰地對(duì)28S/18S(或者23S/16S)進(jìn)行電泳分離,還可以根據(jù)檢測(cè)出的片段分布情況給出完整性評(píng)分值RQN,數(shù)值越接近10代表樣本完整性越好。除了峰圖,Qsep還可給出28S:18S比值和DV200值作為參考,再輕微的降解也逃不過(guò)Qsep的火眼金睛。
 
綜上,DS-11FX紫外/熒光結(jié)合Qsep可以提供完美的RNA質(zhì)控,國(guó)內(nèi)大量著名高校及企業(yè)如北京大學(xué),復(fù)旦大學(xué),上海交大,浙江大學(xué),中山大學(xué),四川大學(xué),諾禾,金域等等都開(kāi)始采用領(lǐng)先的1+1RNA質(zhì)控方案。質(zhì)控新思路,歡迎您的加入。
 
 
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