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腫瘤細(xì)胞學(xué)上的常用實(shí)驗(yàn)方法

瀏覽次數(shù):10052 發(fā)布日期:2019-9-18  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
前幾期,我們已經(jīng)了解了腫瘤細(xì)胞的基本特征及培養(yǎng)手法等,接下來(lái)我們將會(huì)陸續(xù)為大家介紹各種常用的細(xì)胞實(shí)驗(yàn)技術(shù)。對(duì)于任何研究,一套系統(tǒng)的邏輯思路似乎比具體實(shí)驗(yàn)方法更重要。所以在介紹之前,我們就從藥物研發(fā)的角度,和大家一起簡(jiǎn)單聊聊前人們的研究思路以及腫瘤學(xué)研究中一些常用方法與技術(shù),歡迎互相討論。
第一部分:以NCI為代表的藥物篩選模式

該篩選模式即NCI基于NCI-60的抗腫瘤藥物篩選模式,自1990年起,業(yè)界和學(xué)術(shù)界利用NCI-60細(xì)胞已篩選出10萬(wàn)余種化合物,這一方法也是目前腫瘤藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域的中流砥柱。

首先看看它經(jīng)歷的4個(gè)發(fā)展階段:

  • 1955-1985年:體內(nèi)篩選模型(in vivo。以移植性腫瘤動(dòng)物模型為基礎(chǔ),以動(dòng)物生命延長(zhǎng)率和腫瘤生長(zhǎng)抑制率為藥物基本評(píng)價(jià)指標(biāo);

  • 1985-1990年:體外篩選模型(in vitro)逐漸取代體內(nèi)模型。即放棄體內(nèi)小鼠篩選,以人腫瘤細(xì)胞株為基礎(chǔ)的體外抗腫瘤藥物篩選模型。

  • 1990-2016年:體外篩選模型(in vitro)為基礎(chǔ)。主要是以9大類60種人類腫瘤細(xì)胞株NCI-60進(jìn)行體外篩選;后續(xù)在動(dòng)物體內(nèi)驗(yàn)證[1];

  • 2016年-至今:開始使用來(lái)自病人的異種移植腫瘤(PDX)為模型。主要是考慮到NCI-60在體外培養(yǎng)已上千代,可能已產(chǎn)生變異。

然而,PDX模型的建立較為困難且數(shù)據(jù)庫(kù)尚不完善,目前我們?nèi)圆扇∫泽w外細(xì)胞株篩選為基礎(chǔ),體內(nèi)模型后續(xù)驗(yàn)證的策略。

基本篩選模型如下圖所示:

基于NCI-60的藥物篩選流程[1]

篩藥流程(基于細(xì)胞表型篩選):

  1. 首先對(duì)待篩化合物初篩(3株較敏感的腫瘤細(xì)胞株MCF-7; NCI-H460; SF-268),以抑制細(xì)胞增殖為指標(biāo)(3個(gè)參數(shù):半生長(zhǎng)抑制GI50,總體生長(zhǎng)抑制TGI和半致死濃度LC50)。

  2. 進(jìn)一步在15-20株腫瘤細(xì)胞株(包括耐藥細(xì)胞株如MCF-7/ADR),正常細(xì)胞株等篩選;

  3. 綜合體外結(jié)果,在體內(nèi)模型驗(yàn)證;

  4. 藥物安全性、藥代動(dòng)力學(xué)等研究(體內(nèi)動(dòng)物水平);

  5. 根據(jù)細(xì)胞表型獲取相關(guān)分子,進(jìn)行藥物作用機(jī)制及靶點(diǎn)探究(體外細(xì)胞水平為主)。

根據(jù)以上NCI篩選模式的發(fā)展階段,我們可以看到以細(xì)胞篩選為基礎(chǔ)的模式已逐漸成為了必不可少的部分。

細(xì)胞篩選模型的主要優(yōu)勢(shì):

  • 成本低,操作簡(jiǎn)單,得到結(jié)果快;

  • 用藥量少,特別是針對(duì)取材困難的天然產(chǎn)物;

  • 多種人源細(xì)胞株同時(shí)篩選,可能篩選出對(duì)特殊人類腫瘤有效的藥物。

細(xì)胞實(shí)驗(yàn)?zāi)艿玫绞裁矗?/strong>

  • 高通量篩選出候選化合物;

  • 初步了解候選化合物的抗瘤譜;

  • 為隨后進(jìn)行的體內(nèi)實(shí)驗(yàn)提供參考,如劑量范圍、腫瘤類別等 。

常見的細(xì)胞實(shí)驗(yàn)技術(shù)

NCI-60這種篩選模式主要針對(duì)未知靶點(diǎn)的藥物,一般是基于表型的篩選方法(細(xì)胞增殖為主),若是發(fā)現(xiàn)藥物有較好的抑制細(xì)胞生長(zhǎng)、轉(zhuǎn)移或血管新生的作用,即可進(jìn)一步結(jié)合動(dòng)物體內(nèi)結(jié)果驗(yàn)證藥效。進(jìn)而再探索藥物的作用靶點(diǎn)[2]。

如鉑類抗腫瘤藥物,代表藥物:順鉑和奧沙利鉑

  • 首先是發(fā)現(xiàn)鉑類有很好的抑制多株腫瘤細(xì)胞增殖的功能;

  • 進(jìn)一步體內(nèi)驗(yàn)證有很好的抗多種癌的效果;

  • 最后,發(fā)現(xiàn)順鉑與DNA結(jié)合干擾了正常分裂而殺死癌細(xì)胞;進(jìn)而通過NMR廣譜分析單晶的X射線衍射技術(shù)確定了鉑與DNA堿基結(jié)合的位置。

如下圖所示,為未知靶點(diǎn)藥物的篩選過程:

第二部分:新興靶向藥物篩選模式

傳統(tǒng)的抗癌藥物即廣譜的化療藥物除了殺傷癌細(xì)胞,也會(huì)對(duì)正常細(xì)胞產(chǎn)生影響,如鉑類藥物具有強(qiáng)烈的腎毒性。因此,21世紀(jì)初推動(dòng)了靶向藥物的發(fā)展。這類化合物一般是針對(duì)某種已知靶點(diǎn)合成可能與靶點(diǎn)結(jié)合或者抑制該靶點(diǎn)的化合物,其中以細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)分子為靶點(diǎn)的抗腫瘤藥物占據(jù)了大部分:

  • 蛋白酪氨激酶抑制劑  代表藥物:依馬替尼

  • EGFR酪氨酸激酶抑制劑  代表藥物:吉非替尼 

  • 腫瘤新生血管生成抑制藥物 代表藥物:Avastin

  • 法尼基轉(zhuǎn)移酶抑制劑  代表藥物:替匹法尼

  • 組蛋白去乙;窰DACs抑制劑  代表藥物:SAHA(臨床階段)

  • GPCR  代表藥物:乳腺癌藥物Zoladex

對(duì)于這類化合物,一般是先進(jìn)行靶點(diǎn)驗(yàn)證如酶活實(shí)驗(yàn)(明確沒有脫靶),再進(jìn)行細(xì)胞相關(guān)功能試驗(yàn),和體內(nèi)效果驗(yàn)證。與未知靶點(diǎn)藥物相比,靶向藥物在靶向探索部分,更加快捷和準(zhǔn)確,可以直接進(jìn)行靶點(diǎn)驗(yàn)證。

一般篩選過程如下圖所示:

靶向藥物篩選流程

如下圖為HDACs抑制劑的篩選過程,首先在細(xì)胞上驗(yàn)證藥物的靶向性,在確定藥物的靶點(diǎn)后,進(jìn)行靶點(diǎn)相關(guān)的細(xì)胞功能試驗(yàn),如HDACs與腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)和分化密切相關(guān),可進(jìn)行細(xì)胞增殖,細(xì)胞周期等實(shí)驗(yàn);最后在動(dòng)物水平驗(yàn)證化合物的抗癌效果。

HDACs抑制劑的篩選過程[3]

本期介紹就到這里了,腫瘤細(xì)胞學(xué)研究是一個(gè)很龐大的工程,今天我們只是從新藥研發(fā)角度簡(jiǎn)單介紹了一些常見的細(xì)胞生物學(xué)上的實(shí)驗(yàn)方法,希望大家能給大家?guī)?lái)幫助。

參考文獻(xiàn)

1. Shoemaker R H. The NCI60 humantumour cell line anticancer drug screen.[J]. Nature Reviews Cancer, 2006,6(10): 813-823.

2. Swinney D C, Anthony J. How were newmedicines discovered[J]. Nature Reviews Drug Discovery, 2011, 10(7): 507-519.

3. Zhang T, Chen Y, Li J, et al.Antitumor action of a novel histone deacetylase inhibitor, YF479, in breastcancer.[J]. Neoplasia, 2014, 16(8): 665-677.

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