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基因型鑒定試劑盒使用說明書

瀏覽次數(shù):3449 發(fā)布日期:2019-7-29  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
試劑盒成分
 
1、 YSY Buffer
 
2、2*PCR Master Mix(使用實(shí)驗(yàn)室常用的酶即可,由客戶自備)
 
儲(chǔ)藏條件:4oC
實(shí)驗(yàn)步驟
 
1、細(xì)胞與動(dòng)物組織的準(zhǔn)備:
 
1.1 培養(yǎng)細(xì)胞準(zhǔn)備:
 
以培養(yǎng)密度為 1´106 個(gè)/ml 為例,在超凈臺(tái)內(nèi)取 1ml(內(nèi)含 300-1000 個(gè)細(xì)胞);對于某些類貼壁細(xì)
 
胞,可直接刮取側(cè)壁細(xì)胞,植入已編號的 PCR 管內(nèi)。
 
  • 血液準(zhǔn)備:
 
取適當(dāng)部位,采集血液 1 ml。
 
       注意:如果樣品在 10 分鐘內(nèi)處理,則無需抗凝處理;在高通量采樣情況下,如果樣品在塑料PCR管內(nèi)需存放 10 分鐘以上,需采用抗凝處理。
 
1.3 哺乳動(dòng)物組織準(zhǔn)備:
 
采集相應(yīng)部位,剪取 1mm31 ml左右組織放入已編號的 PCR 管內(nèi)。
 
1.4 斑馬魚尾鰭、果蠅等其他模式動(dòng)物組織準(zhǔn)備:
 
選取尾鰭、翅膀等無損害部位,可通過剪取、穿孔或針刺等方法制備少量新鮮組織,體積約 1mm3
 
即 1 ml
 
2、基因組 DNA 模板的制備
 
  • 加樣
  • 10ml 的 YSYBuffer 液分別逐一加入裝有組織或細(xì)胞的 PCR 管壁(注意勿將槍頭碰到組織
 
 
YSY Biotech 基因的故事   讓斑馬魚來為您講述
 
樣品,防止污染);加樣完畢后,將 PCR 管快速離心,確保溶液和組織或細(xì)胞均位于 PCR 管
 
底部;
 
  • 制備基因組模板
 
  • PCR 管放入 PCR 儀中,啟動(dòng) PCR 程序:65℃×30min、95℃×5min、16℃×1min;蚪M
 
模板若不立即使用,請放入-20℃保存。
 
3、目標(biāo)基因的 PCR 擴(kuò)增(以下試劑請自備)
 
3.1 取用新的 PCR 管,按下列順序組裝 PCR 反應(yīng)體系:
 
20 m反應(yīng)體系(產(chǎn)物直接凝膠電泳進(jìn)行基因型鑒定用)
 
基因組 DNA 模板(步驟 2.2 所得):1 ml
 
2 × PCR Master Mix:10 ml(自備)
 
正向引物(5mM): 1ml (自備)
 
反向引物(5mM): 1ml (自備)
 
超純水:   7 ml(自備)
 
  • 組裝完畢后,將 PCR 管快速離心,確保所有溶液均位于 PCR 管底部;
 
  • 將 PCR 管放入 PCR 儀中,啟動(dòng)客戶自行設(shè)計(jì)的 PCR 程序完成 PCR 擴(kuò)增。
 
4、PCR 產(chǎn)物驗(yàn)證
 
取 2ml 擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行基因型鑒定;若需進(jìn)一步測序,可將余下的產(chǎn)物直接送測
 
序;若需酶切鑒定,則在經(jīng) PCR 產(chǎn)物純化試劑盒純化后,用核酸酶內(nèi)切酶進(jìn)行酶切鑒定。
 
注:測序公司一般額外收取 5 元錢的切膠費(fèi)用,請?jiān)谒蜏y前和測序公司確認(rèn)無需切膠回收。
 
5、結(jié)果閱讀(基因突變及突變率分析)
 
如果基因型可由引物特異性識別,則通過將觀測 PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果確定基因型;通過測序確定基
 
因型的,其測序結(jié)果可通過人工閱讀測序的色譜圖,識別突變等位基因的基因型,確定突變率。核
 
酸內(nèi)切酶酶切結(jié)果可通過對凝膠電泳條帶的灰度分析,確定突變率。

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