Less is more:DIA技術(shù),2table+1figure,得一篇12分的Molecular Psychiatry文章
Nature旗下的Molecular Psychiatry(IF=11.64)是精神疾病領(lǐng)域的top期刊。
在19年1月發(fā)表了一篇題為“Complement pathwaychanges at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in alongitudinal population-based study: evidence for a role of stress”的文章,文中利用了DIA技術(shù),研究補(bǔ)體系統(tǒng)與精神異常的關(guān)系。
Complement pathway changes at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in a longitudinal population-based study: evidence for a role of stress
IF=11.64
補(bǔ)體級聯(lián)是免疫系統(tǒng)的重要組成。越來越多的證據(jù)表明,補(bǔ)體系統(tǒng)異常與精神疾病有密切關(guān)系。為了進(jìn)一步證明兩者之間的關(guān)系,研究者對來自于UK avon longitudinal study of parents and children (ALSPAC)隊(duì)列中的血液樣本,進(jìn)行了DIA蛋白質(zhì)組檢測,重點(diǎn)關(guān)注其中29個補(bǔ)體級聯(lián)相關(guān)蛋白的表達(dá)水平。結(jié)果顯示,6個蛋白的表達(dá)水平與精神異常相關(guān)。利用大鼠慢性應(yīng)激模型,該研究結(jié)果進(jìn)一步表明:慢性應(yīng)激可能引起補(bǔ)體通路異常,與精神異常有顯著相關(guān)性。(小編:如果進(jìn)一步研究一下他們的腸道菌群,可能會有更多的發(fā)現(xiàn))
對于為什么采用DIA技術(shù)進(jìn)行血漿蛋白質(zhì)組研究,作者在文中給出了說明:DIA技術(shù)避免了非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)研究中會遇到的許多問題,比如缺失性,原文如下:
作者對于文章中圖表和結(jié)果的展示采取的是“less is more”原則,2 table+1 figure,Results全文也僅有3段話:
1個table和1個figure:列出所檢測的幾個補(bǔ)體通路相關(guān)的表達(dá)水平。
雖然話少,但作者為保證數(shù)據(jù)的嚴(yán)謹(jǐn)性,特意在進(jìn)行數(shù)據(jù)分析時,剔除了兩個樣本的信息,原因是因?yàn)樵摌颖镜纳V信息不好,原文如下:
跟本平臺一樣,對DIA的數(shù)據(jù)有著嚴(yán)格的質(zhì)控,色譜的評價是非常重要的,但是卻被大家所忽視(中科新生命的DIA數(shù)據(jù)從3個維度評價色譜表現(xiàn),并將數(shù)據(jù)呈現(xiàn)在報告中)。
雖然DIA是個比較新的技術(shù),但憑借著覆蓋度、重現(xiàn)性、準(zhǔn)確度方面的革新式提升,DIA已經(jīng)出現(xiàn)在越來越多的高水平研究中。隨著2019年的到來,我們一定會看到越來越多DIA技術(shù)的應(yīng)用被報道。
中科新生命不僅是在國內(nèi)最早推出DIA服務(wù)的平臺,而且也是僅有的對DIA進(jìn)行持續(xù)深度開發(fā)的平臺。例如,針對臨床最高頻研究樣本——血漿,我們實(shí)現(xiàn)了單個樣本、無需去除高豐度蛋白、無需分級、2h時長定量1000+蛋白的分析能力,該突破被大V平臺廣泛關(guān)注和報道(例如Bioart之前的一篇推文:蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)新突破:血液樣本DIA,定量蛋白數(shù)創(chuàng)新高)。后續(xù),同樣的技術(shù)升級我們也將移植到其他類型樣本上,敬請期待。
最后再給要發(fā)DIA文章的老師們加一把力:
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注:上述數(shù)據(jù)為MedSci實(shí)時信息,動態(tài)變化,僅用于科學(xué)研究,不得作任何商業(yè)用途。
蛋白|修飾|代謝|脂質(zhì)|結(jié)構(gòu)確證
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Q: 1875681852